wyk adBMK - biologia komórki - Saphira6

wyk�adBMK.doc
(29788 KB) Pobierz
BIOLOGIA MOLEKULARNA KOMÓRKI (MECHANIZMY TRANSPORU WEWNĄTRZKOMÓRKOWEGO)
Ogólne zagadnienia:
TRANSPORT BIAŁEK PRZEZ BŁONY, MECHANIZMY TRANSPORTU DO ORGANELII KOMÓRKOWYCH

Transport białek pomiędzy jądrem a cytoplazmą

Sortowanie i transport białek do mitochondriów, chloroplastów i peroksysomów

Eksport białek bakteryjnych

Translokacje białek przez błony ER

Modyfikacje, fałdowanie i system kontroli w ER
PĘCHERZYKOWY TRANSPORT WEWNĄTRZKOMÓRKOWY

Mechanizmy transportu wewnątrzkomórkowego

Etapy sekrecji białek

Endocytoza, egzocytoza
TRANSPORT BIAŁEK PRZEZ BŁONY, MECHANIZMY TRANSPORTU DO ORGANELII KOMÓRKOWYCH
Główne organelle błonowe komórki zwierzęcej
Membrany różnie wykształcone w zależności od typu komórki.
Transport białek w komórce
W mitochondriach i chloroplastach występuje część rybosomów (synteza części białek).

Sekwencje sygnałowe
białka powstające w cytoplazmie, nietransportowane – brak sekwencji sygnałowych

białka transportowane do organelli:
posttranslacyjnie
(po translacji)
kotranslacyjnie
(podczas procesu translacji)
rozpoznawane przez białka
transportujące
przy użyciu szorstkiego ER
nie potrzebne białka opiekuńcze
wymagany receptor
transport do jądra, mitochondriów,
chloroplastów, peroksysomów
Sygnały kierowania białek
a)
sekw. sygnałowe na N lub C-terminalnym końcu – nie są integralną częścią białka, mogą być odcięte po fałdowaniu
(peptydazy sygnałowe); 15 do 60 am.; używane do transportu do mitochondriów, chloroplastów, peroksysomów,
jądra, z ap. Golgiego do ER, między jądrem a cytoplazmą
b) determinanty sygnałowe, łatki – brak bezpośredniego kontaktu w formie liniowej; w środku łańcucha w różnych
odległościach, po przyjęciu struktury 3-rzędowej uruchamiane; transport do lizosomów, cytozol-jądro
kierowanie białek = sortowanie białek
sekwencje sygnałowe zazwyczaj nie są konsensusowe – ważny rodzaj aminokwasów a nie kolejność
Strategie transportu przez błony
1)

Musi istnieć kanał.
białko bezpośrednio rozpoznaje strukturę translokonu (kanału) - transport do mitochondriów, chloroplastów, ER
2) białko transportowane + białko przenośnikowe (rozpoznaje białko obecne w kanale); w peroksysomach
3)
białko przenośnikowe; przez pory jądrowe
Rodzaje transportu białek w komórce
a)
cytozol  jądro – specyficzny transport
przez pory jądrowe
b)
cytozol  mitochondria, peroksysomy,
chloroplasty, ER – transmembranowy
transport przez przenośniki (kotranslacyjny
i posttranslacyjny)
c)
ER, ap. Golgiego, lizosomy – pęcherzykowy
transport
Sposoby badania translokacji białek przez błony
1)
2)
podejście transfekcyjne – białko cytozolowe, po dodaniu syntetycznej sekw. sygnałowej, białko które powinno zostać
w cytozolu będzie transportowane; badanie istotności sekw. sygnałowej
podejście biochemiczne – system in vitro; powstaje białko z sekw. sygnałową  wniknięcie białka do organellum 
badanie zachowania białka w organellum (np. czy zachodzi odcinanie sekw. sygnałowej)
3)
podejście genetyczne – często w komórkach drożdżowych; dehydrogenaza histydynylowa prowadzi do produkcji
histydyny; po dodaniu sekw. sygnałowej można usunąć enzym z cytozolu i komórki nie będą w stanie żyć na podłożu
bez histydyny; badanie kanałów – ukł. temperaturozależne; transport enzymu do ER w zależności od temperatury;
mutowane translokonów
Transport między jądrem a cytoplazmą
- przez pory jądrowe
- podwójna błona – wewnętrzna i zewnętrzna, błony podobne, ale
o
bł. wew. - białka zaczepu chromatyny i
blaszki jądrowej
o
bł. zew. - ciągła z błoną rER, często ma
rybosomy, a białka wprowadzane do
przestrzeni międzybłonowej
co-translacyjnie
- pory jądrowe – perforacja w błonie jądrowej; od 3 do 4 tys.
Transport między jądrem a cytoplazmą odbywa się w obu kierunkach
białka budujące rybosomy są syntetyzowane w cytozolu
transport do jądra, składanie itd.
eksport do cytoplazmy (ok. 5 podjednostek rybosomalnych/min.)
Budowa kompleksów porów jądrowych (NPC)


120 mln Da

jeden por = 50 różnych białek u procaryota; u eucaryota 100 białek
8 kompleksów podjednostek, każda składa się z: podj. kolumnowej (szczebelkowej) – pomarańczowe, zaczepione w
otoczce jądrowej przez podjednostkę perinuklearnej podj. pierścienia zew. – zielone, podj. pierścieniowe – żółte

włókienka od strony cytozolowej trochę mniejsze, od strony jądrowej większe tzw. koszyczek

centralny kanał – transporter; wewnątrz NPC; śred. 9 -10nm, może się rozszerzać nawet do 30 nm

wewnątrz struktury poru, pomiędzy podj. kolumnowymi - kanały boczne uczestniczące w transporcie

120 nm cały kompleks NPC, 150 nm razem z podj. kotwiczącym (ramionami)
Dyfuzja bierna przez kanały porów jądrowych


Transport w czasie dextranu:

najmniejsze kulki dextranu najszybciej
białka ok. 5kDa przenikają bezproblemowo, biernie dyfundują

białka 5-50kDa – bierna dyfuzja, ale wolniej

50 kDa – granica dyfuzji biernej !!!

większe białka – bardzo wolno przenikają

inne kanały mają stałą wielkość (białka muszą być rozfałdowane)

tylko por jądrowy ma możliwość rozciągnięcia !!!
białka nie muszą być rozfałdowywane żeby być transportowane przez pory jądrowe  rozciągnięcie do 30nm

kanały boczne  raczej dyfuzja bierna

główny kanał  raczej transport aktywny przy udziale przenośników
Sygnał lokalizacji jądrowej (NLS)


sekw. sygnałowe na N lub C terminalnym końcu
sygnałowe łatki – aktywne po złożeniu białka do
3-rzędowej struktury
dużo Lys, Pro i Arg (dodatnie  łamią -helisę)

rzadko hydrofobowe

sekw. sygnałowe rzadko odcinane

położenie mniej istotne

Sygnał lokalizacji jądrowej...
Plik z chomika:
Saphira6
Inne pliki z tego folderu:


wyk�adBMK.doc (29788 KB)
W4czb_jądro_2011.pdf (2660 KB)
 rozdzial-28.pdf (258 KB)
Inne foldery tego chomika:

Zgłoś jeśli naruszono regulamin





Strona główna
Aktualności
Kontakt
Dział Pomocy
Opinie


Regulamin serwisu
Polityka prywatności
Copyright © 2012 Chomikuj.pl
systematyka strunowców