Terapia genowa Autor: dr Artur Cieślewicz Zakład Farmakologii Klinicznej [email protected] Definicja Terapia genowa: Procedura medyczna, podczas której dzika wersja genu jest wprowadzana do komórek pacjenta w celu wyleczenia choroby wywołanej przez zmutowany gen, kodującego niefunkcjonalny produkt Rodzaje terapii genowej 1. Terapia in vivo a. Działanie bezpośrednio w organizmie pacjenta b. Niezbędne metody precyzyjnego transportu terapeutycznych genów do określonych komórek 2. Terapia ex vivo a. Pobieramy populację komórek z organizmu pacjenta b. Transformacja w warunkach laboratoryjnych c. Zmodyfikowane komórki powracają do organizmu pacjenta Wektory • • Niewielkie cząsteczki DNA, umożliwiające wprowadzenie obcego DNA do komórki Plazmidy, genomy wirusowe, sztuczne chromosomy Wektory adenowirusowe • • • Oparte na ludzkim adenowirusie Terapeutyczny gen wstawiany na miejsce genów wirusowych (zwykle E1-E3) Tak przygotowany DNA – pakowany do kapsydu Rodzaje wektorów adenowirusowych • • • 1 generacja: delecje genów E1 i E3 (ograniczona replikacja) 2 generacja: delecja genu E4 (zredukowana odpowiedź immunologiczna) 3 generacja: usunięte geny wirusowe; silnie zredukowana odpowiedź immunologiczna Zalety • • • • Wysoka efektywność transdukcji Pojemność” do 8 kbp Infekuje komórki dzielące się i zróżnicowane Wektor wyboru w terapii genowej niektórych nowotworów Wady • • • Ekspresja ograniczona w czasie Wczesne generacje: mogło dojść do ekspresji wirusowych białek Skuteczność in vivo utrudniona przez odpowiedź immunologiczną Pierwszy rekombinowany adenowirus dopuszczony do terapeutycznego stosowania: Onyx-15 (Oncorine): • • Niemożność unieczynnienia białka p53 => namnażanie tylko w komórkach nowotworowych Oncorine + 5FU + cisplatyna => lepsza odpowiedź na leczenie, mniejsze prawdopodobieństwo progresji w porównaniu do samej chemioterapii Wektory retrowirusowe • • Bazują na genomie retrowirusa (RNA jako materiał genetyczny) Terapeutyczny gen wstawiany na miejsce genów gag, pol, env Zalety • • • • Wysoka efektywność transdukcji „Pojemność” do 8 kbp Integracja z genomem gospodarza => stała ekspresja genu Brak ekspresji białek wirusowych Wady • • • Infekowanie tylko komórek dzielących się Losowa integracja z genomem Skuteczność in vivo utrudniona przez odpowiedź immunologiczną Wektory niewirusowe Liposomy • Fosfolipidowe pęcherzyki transportujące DNA Sztuczne ludzkie chromosomy (HAC) • • • • • Tworzone na bazie chromosomów Zawierają: centromer, miejsca inicjacji replikacji, telomery Wiążą się z histonami; replikują, segregują poprawnie podczas kariokinezy Brak ograniczeń co do długości genu jaki można umieścić w chromosomie Kontrola ekspresji: elementy regulatorowe Przykłady terapii genowej Czerniak • • • terapia ex vivo do pobranych limfocytów penetrujących guza wprowadzono gen kodujący TNF (Tumor Necrosis Factor – czynnik martwicy nowotworu) Zwiększona produkcja TNF zahamowała wzrost komórek raka Choroba wieńcowa • • Plazmidy z genem VEGF (Vascular Endothelial Growth Factor – czynnik wzrostu śródbłonka naczyniowego) wstrzyknięto bezpośrednio do mięśnia sercowego Ekspresja VEGF – stymulacja tworzenia nowych naczyń krwionośnych Zespół SCID • • • Pierwszy sukces terapii genowej (1990r.) Przyczyna genetyczna: mutacja w genie ADA, prowadząca do niedoboru deaminazy adenozyny terapia ex vivo: pobrane limfocyty modyfikowano dzikim genem ADA Mukowiscydoza • • • • Przyczyna: mutacje w genie CFTR (Cystic Fibrosis Conductance Transmembrane Regulator) – brak funkcjonalnych kanałów jonowych w przypadku homozygot recesywnych Badania na kulturach tkankowych, wyprowadzonych z komórek płuc i trzustki pacjentów chorych na mukowiscydozę: znaczące obniżenie zawartości Cl- po wprowadzeniu dzikiego allela CFTR Badanie kliniczne: terapia in vivo o 140 pacjentów przyjmowało inhalację (1/miesiąc) placebo lub wektora liposomowego z genem CFTR o Znacząco wyższa nasilona pierwszosekundowa objętość wydechowa (FEV1) u pacjentów poddanych terapii genowej Lepszy wektor dla mukowsicydozy: F-HN SIV o lentiwirus + białka kapsydu F i HN wirusa Sendai Wrodzona ślepota Lebera • • Stopniowa utrata wzroku (fotoreceptory przestają reagować na światło) powodowana mutacją w genie RPE65 (enzym pełniący kluczową rolę w cyklu przemian retinolu) Terapia genowa: psy, które odziedziczyły zmutowane allele RPE65 o Wstrzyknięcie wektora z dzikim genem RPE65 bezpośrednio do siatkówki psów ślepych od urodzenia o Po terapii psy zaczęły be trudności poruszać się po otoczeniu (omijanie przeszkód) o odzyskanie wzroku potwierdzone rezonansem magnetycznym mózgu Cukrzyca typu 1 • • • Autoimmunologiczna: niszczenie komórek trzustki przez układ odpornościowy (przeciwciała) => brak insuliny Badanie na myszach z cukrzycą streptozotocynową: wektory adenowirusowe z genami o Ngn3 (neurogenina 3): czynnik transkrypcyjny niezbędny w rozwoju komórek wydzielniczych trzustki o Btc (betacellulina): czynnik wzrostu wysepek Langerhansa Efekt terapii: o Przywrócenie wydzielania insuliny stymulowanego glukozą oraz odwrócenie hiperglikemii o Normalizacja wydzielania glukozy przez wątrobę o Odwrócenie ketonemii o Przywrócenie normalnego poziomu glikogenu w wątrobie o Przywrócenie normalnego poziomu transkryptów genów związanych z lipogenezą Choroba Parkinsona • • • • Choroba neurodegeneracyjna; przyczyna – spadek ilości dopaminy Leczenie: uzupełnianie dopaminy (L-DOPA); z czasem traci skuteczność Nadaktywne jądro niskowzgórzowe => obniżanie poziomu dopaminy Pacjentom wstrzyknięto wektor z genem GAD (dekarboksylaza kwasu glutaminowego) bezpośrednio do jądra niskowzgózowego o Ekspresja GAD => produkcja neuroprzekaźnika GABA o Inhibicja nadaktywnych nerwów w jądrze niskowzgórzowym o Złagodzenie objawów choroby Anemia sierpowata • • I choroba genetyczna o scharakteryzowanym podłożu molekularnym (mutacja w genie βglobiny) Terapia genowa korygująca chorobę u myszy o wektor lentiwirusowy przeniósł dziki gen β-globiny do komórek krwiotwórczych o Długotrwała ekspresja została osiągnięta u wszystkich zwierząt o Niezmutowane białko stanowiło >50% całkowitej hemoglobiny i było obecne w 99% krwinek Terapia genowa w stomatologii • • • • Odbudowa kości wokół implantów badanie na szczurach: Do dużych ubytków kostnych w szczęce dostarczono wektory adenowirusowe z BMP7 przy użyciu macierzy kolagenowej BMP7 bierze udział w regulacji wzrostu i różnicowania komórek kości, rozwojy zębów, procesach naprawczych przyzębia Zwierzęta, które poddano terapii genowej produkowały 50% więcej kości wokół implantów od zwierząt poddanych standardowemu leczeniu Terapia genowa i alkoholizm • • • • Dehydrogenaza aldehydowa: kluczowy enzym w metabolizowaniu etanolu Mutacje obniżające aktywność enzymu: mniejsze o 2/3 ryzyko zapadnięcia na alkoholizm Disulfiram: inhibitor dehydrogenazy aldehydowej; stosowany w leczeniu alkoholizmu Terapia genowa: Antysensowny ssDNA komplementarny do mRNA ADH o blokada translacji o test na uzależnionych od alkoholu szczurach => 50% mniejsze spożycie alkoholu przez > miesiąc po terapii Wyciszanie genów Interferencja RNA: naturalny proces polegający na degradacji lub zahamowaniu ekspresji docelowego transkryptu przez specyficzne krótkie cząsteczki RNA (siRNA lub miRNA) • projektowanie siRNA w celu wyciszenia ekspresji szkodliwych genów Projektowanie siRNA • • długość zwykle 19-30 nt transport do komórek o „nagie cząsteczki” – niestabilne o kompleksowanie z nośnikami o wektory wirusowe RNAi w leczeniu raka Wyciszenie ekspresji VEGF • • • Zablokowanie angiogenezy w tkance nowotworowej Odcięcie dopływu krwi Zagłodzenie” nowotworu Wyciszenie ekspresji PKN3 (kinaza białkowa N3) • Atu027 • • • Inhibicja PKN3 zmniejsza przerzuty do węzłów chłonnych w raku prostaty Zwierzęce modele raka płuc: zmniejszenie przerzutów w grupie zwierząt, której podano lek Zwierzęce modele raka piersi: zapobiega przerzutom do płuc Wyciszenie ekspresji tenascyny C (TN-C) • • • nadekspresja przyczynia się do adhezji, migracji, inwazyjności i proliferacji glejaka „nagie” cząsteczki dsRNA, 160 pz wstrzyknięto bezpośrednio do naciekającej tkanki nowotworowej podczas zabiegu chirurgicznego Znaczące wydłużenie mediany czasu przeżycia pacjentów poddanych terapii w poróonaniu do grupy kontrolnej (48,2 tygodnie vs 106,6 tygodni) Zwyrodnienie plamki żółtej związane z wiekiem • • • Uszkodzenie siatkówki (zwłaszcza plamki żółtej), prowadzące do pogorszenia wzroku o przyczyna: neowaskularyzacja za siatkówką RNAi w celu wyciszenia ekspresji VEGF o Lek wstrzyknięty bezpośrednio do oka o I faza badań klinicznych: 25% pacjentów – poprawa wzroku; stabilizacja u pozostałych Poprawa nie związana z wyciszeniem VEGF!!! o Synteza interferonu γ i interleukiny 12 => Negatywna regulacja VEGF => Zahamowanie angiogenezy Infekcje wirusowe Wirus Ebola • • siRNA przeciwku L-polimerazie, oraz wirusowym białkom VP24 i VP35 Zastosowanie leku uchroniło zwierzęta przed śmiercią Wirus HIV • • niezwykle wysokie tempo mutacji; zwiększenie skuteczności terapii => łączenie wielu metod wyciszania wirusowych genów o Lentiwirusy niosące shRNA przeciwko transkryptom genów tat (trans-aktywator transkrypcji) i rev (regulator ekspresji białek wirusowych o Dodatkowo inhibitory bazujące na RNA: wabik TAR RNA, rybozym typu hammerhead przeciwko receptorowi CCR5 Badanie kliniczne I faza o Zmodyfikowane komórki przyjęły się u wszystkich pacjentów w ciągu 11 dni o Nie zaobserwowano związanych z leczeniem toksyczności o Ekspresja shRNA i rybozymu – udokumentowana przez 24 miesiące obserwacji Mukowiscydoza • • VCP/p397: nadekspresja skutkuje niszczeniem kanałów CFTR Badania na liniach komórkowych: wyciszenie VCP/p397 przywraca komórkom zdolność transportowania jonów chlorkowych Choroby metaboliczne • Obniżenie poziomu LDL: siRNA przeciwko APOB, PCSK9 o Badanie eksperymentalne na gryzoniach => znaczące obniżenie LDL o Pierwsze badania na ludziach: siRNA przeciwko APOB jest dobrze tolerowany Enzymatyczna terapia zastępcza • Jeżeli przyczyną choroby genetycznej jest brak określonego enzymu: podawanie pacjentom oczyszczonego enzymu o Nie leczy bezpośredniej przyczyny (mutacja w genie) => enzym musi być przyjmowany przez całe życie ETZ dla SCID • • • PEG-ADA (pegylowana deaminaza adenozyny): ADA powiązana z glikolem polietylenowym Mniejsza śmiertelność i zachorowalność w porównaniu do pacjentów poddanych przeszczepowi szpiku Roczny koszt ~400 000$ ETZ dla choroby Gauchera • • • mutacja w genie GBA (beta-glukocerebrozydaza) => Glukocerebrozydy nie są degradowane w lizosomach => gromadzenie w komórkach 12 pacjentów otrzymywało oczyszczony enzym pozyskany z tkanek łożyska => znacząca poprawa w objawach choroby Produkcja dużych ilości enzymu: klonowanie ludzkiego genu do komórek bakteryjnych