PYTANIA NA DYPLOMOWY EGZAMIN MAGISTERSKI KIERUNEK BIOLOGIA STUDIA STACJONARNE DRUGIEGO STOPNIA Specjalność BIOLOGIA MOLEKULARNA Rok akademicki 2010/2011 1. Techniki mikroskopowe (zasady pobierania i przygotowania materiału biologicznego do mikroskopii fluorescencyjnej; metody utrwalania i przygotowania materiałów do mikroskopii elektronowej; metody barwień charakterystyka stosowanych przeciwciał i fluorochromów; immunofluorescencyjnych; budowa i zasada działania mikroskopu fluorescencyjnego i elektronowego). 2. Sekwencje wydarzeń embriogenetycznych (geny homeotyczne i ich analogi u człowieka; trzy osie polarności zarodka człowieka: przednio-tylna, prawo-lewa i grzbietowoboczna a cząsteczki sygnałowe; różnicowanie się komórek cewy nerwowej i rdzenia kręgowego – hamowanie oboczne i system Delta-Notch; migracja neuronów; kierowanie stożkiem wzrostu; macierz i czynniki troficzne; przykłady zaburzeń w migracji neuronów u człowieka). 3. Mechanizmy rozwoju układu nerwowego (neurulacja, indukcja nerwowa, rola kwasu retinowego, geny homeotyczne i ich rola – mutacje – w rozwoju zarodkowym ssaków i bezkręgowców; indukcja wtórna i pączek ogonowy, wczesne kształtowanie się osi zarodka, rola czynników wzrostu w różnicowaniu komórek). 4. Praktyczne wykorzystanie wiedzy z enzymologii (w medycynie ludzkiej i weterynaryjnej – diagnostyka medyczna, terapia, konstrukcja nowych leków; szczepionki; kryminalistyka; hodowla zwierząt; przemysł spożywczy; badania naukowe). 5. Określanie aktywności enzymów (sposoby oznaczania aktywności enzymów; techniki oznaczania ilości enzymów i aktywności enzymatycznej; czynniki wyboru metody). 6. Budowa enzymów a mechanizm katalizy (wyznaczanie grup ważnych dla katalizy aminokwasów katalitycznych; określanie niezbędności jonów metali i koenzymów; wykorzystanie inhibitorów; punktowa mutageneza; chelatory). 7. Oddziaływanie dioksyn na człowieka i środowisko naturalne (najbardziej toksyczne dioksyny dla człowieka i zwierząt; drogi przedostawania się dioksyn do organizmu; konsekwencje zatrucia dioksynami). 8. Podstawowe pojęcia stosowane w toksykologii do oceny wchłoniętej dawki trucizny (stężenie w punkcie narażenia; intensywność; czas trwania narażenia; masa ciała; wartość dawki: progowa, graniczna, lecznicza, toksyczna, letalna, LD50). 9. Diagnostyka cytogenetyczna w medycynie i weterynarii (opis; uwarunkowania genetyczne i detekcja wybranej jednostki/zespołu chorobowego o podłożu aberracyjnym) 10. Możliwość praktycznego wykorzystania badań cytogenetycznych (w hodowli roślin i zwierząt, taksonomii i filogenezie) 11. Rekonstrukcje zarodków ssaków w warunkach in vitro (zapłodnienie in vitro – człowiek, zwierzęta; klonowanie zarodkowe i somatyczne; cechy korzystne i niekorzystne oraz problemy etyczne związane z tą technologią). 12. Molekularne mechanizmy zapłodnienia (rozpoznanie między gametami; zmiany w plemniku; zmiany w oocycie; powstanie zarodka). 13. Dopasowywanie sekwencji (sequence alignment) – metody, znaczenie, typy, dopasowania, przykłady algorytmów. 14. Biologiczne bazy danych - sposób i formy gromadzenia danych biologicznych w formatach cyfrowych (definicja biologicznych baz danych; model danych; formaty plików sekwencji; dostęp do danych). 15. Komórki macierzyste i ich wykorzystanie w biotechnologii (pochodzenie komórek macierzystych – zarodki i tkanki dojrzałych organizmów; etapy różnicowania tych komórek; transdyferencjacja; wykorzystanie komórek w inżynierii tkankowej, rekonstrukcji zarodków i odtwarzaniu tkanek/narządów). 16. Regulacja wydzielania hormonów kory nadnerczy (czynniki powodujące wydzielanie, wpływ glikokortikoidów na mięśnie, tkankę tłuszczową i układ rozrodczy). 17. Etapy biosyntezy oraz rola hormonów tarczycy (metaboliczne szlaki; działanie hormonów tarczycy; regulacja wydzielania). 18. Różnicowanie się komórek w roślinnym organizmie wielokomórkowym (Tworzenie planu budowy organizmu; polaryzacja zygoty; segmentacja apikalno-bazalna; wzrost nieograniczony i ograniczony; segmentacja promieniowa i obwodowa; zróżnicowanie grzbietobrzuszne organów; specyfikacja losów komórek). 19. Metody stosowane w badaniach ekspresji genów i charakterystyka jednej z nich na podstawie stworzonego przez siebie, teoretycznego modelu doświadczalnego (metody: PCR, RT-PCR, Real time-PCR, ISH, mikromacierze, Northen Blot). 20. Metody stosowane w badaniach ekspresji białek i charakterystyka jednej z nich na podstawie stworzonego przez siebie, teoretycznego modelu doświadczalnego (analiza Western, immunocytochemia, immunohistochemia, Elisa).