Zestaw do izolacji totalnego DNA z drożdży

advertisement
®
DNA YEAST KIT
Zestaw do izolacji
totalnego DNA z drożdży
EXTRACTME® jest zastrzeżonym
znakiem towarowym firmy BLIRT S.A .
Nr kat. EM10
Wersja zestawu: 1.2012
®
DNA YEAST KIT
I.
PRZEZNACZENIE ZESTAWU
Zestaw EXTRACTME® DNA YEAST przeznaczony jest do szybkiej i wydajnej izolacji
drożdżowego DNA o wysokiej czystości z hodowli płynnych i powierzchniowych
oraz osadów mrożonych. Protokół izolacji i składy buforów zostały zoptymalizowane
w celu osiągnięcia wysokiej wydajności i czystości izolowanego DNA . Produkt
przeznaczony jest wyłącznie do zastosowań badawczo-rozwojowych.
II.
SKŁAD I PRZECHOWYWANIE ZESTAWU
50
150
250
3 izolacje
izolacji
izolacji
izolacji
(DEMO)
Nr katalogowy
EM10-050
EM10-150
EM10-250
EM10-D
YS Buffer
10 ml
30 ml
50 ml
600 µl
YL Buffer
15 ml
45 ml
75 ml
900 µl
1 szt.
3 szt.
5 szt.
1 szt.
700 µl
2,1 ml
3,5 ml
200 µl
Lysis Mix
100 µl
300 µl
500 µl
6 µl
RNase A (lyophilized)
1 szt.
3 szt.
5 szt.
1 szt.
RNase Buffer
220 µl
660 µl
1,1 ml
100 µl
YB Buffer
18 ml
53 ml
88 ml
1,1 ml
YW Buffer
50 ml
150 ml
250 ml
3 ml
Elution Buffer
10 ml
3 x 10 ml
5 x 10 ml
600 µl
DNA Purification Columns
50 szt.
3 x 50 szt.
5 x 50 szt.
3 szt.
Collection Tubes (2 ml)
50 szt.
3 x 50 szt.
5 x 50 szt.
3 szt.
Liczba izolacji
Proteinase K (lyophilized)
Proteinase Buffer
Enzymy RNaza A oraz proteinaza K dostarczane są w postaci liofilizowanej. Każda probówka
zawiera odpowiednią ilość enzymu do przeprowadzenia 50 izolacji DNA . Liofilizaty enzymów
należy przechowywać w temp. +4°C. Przed pierwszym użyciem liofilizat RNazy A należy
rozpuścić w 220 µl RNase Buffer (w zestawie DEMO w 100 µl RNase Buffer). RNaza A w
roztworze przechowywana w temp. +4°C zachowuje całkowitą aktywność przez kilka dni.
Jeśli wymagane jest przechowywanie RNazy A przez dłuższy okres czasu, zaleca się
rozporcjowanie roztworu RNazy i przechowywanie w temp. -20°C.
www.dnagdansk.com
Nr kat. EM10
Liofilizat proteinazy K należy rozpuścić w 700 µl Proteinase Buffer (w zestawie DEMO
w 200 µl Proteinase Buffer). Roztwór proteinazy K należy przechowywać w temp. -20°C!
Roztwór Lysis Mix należy przechowywać w temp. -20°C.
Pozostałe składniki zestawu należy przechowywać w temp. pokojowej (15-25°C). Wszystkie
roztwory z zestawu należy przechowywać szczelnie zamknięte, aby uniknąć zmiany stężeń
w wyniku parowania. Odpowiednio przechowywany zestaw zachowuje stabilność minimum
przez okres 12 miesięcy.
III. WYMAGANE MATERIAŁY I SPRZĘT
pp
pp
pp
pp
pp
pp
jałowe próbówki wirownicze typu Eppendorf (1,5-2 ml)
pipety automatyczne oraz odpowiednie końcówki do pipet
rękawiczki jednorazowe
mikrowirówka z rotorem na probówki o obj. 1,5-2 ml (> 10 tys. rpm)
termoblok lub łaźnia wodna (do 70°C)
worteks
IV. ZASADA IZOLACJI
Procedura oczyszczania DNA składa się z 5 etapów i przeprowadzana jest
z wykorzystaniem minikolumn wirowniczych, zawierających odpowiednie
złoże, wydajnie i selektywnie wiążące kwasy nukleinowe. W pierwszym
etapie dezintegracji ulega ściana komórkowa drożdży. Powstałe w ten sposób
sferoplasty poddawane są następnie lizie enzymatycznej z wykorzystaniem
YL Buffer oraz proteinazy K. W tym etapie następuje degradacja błon i białek
komórkowych. Dodatkowo w celu otrzymania DNA wolnego od RNA stosuje się
RNazę A . Po dodaniu soli chaotropowych, lizat przenoszony jest do minikolumny
ze złożem. Dwuetapowe przemywanie DNA związanego do złoża ma na celu
usunięcie pozostałych zanieczyszczeń i/lub inhibitorów reakcji enzymatycznych.
Oczyszczone DNA eluowane jest z minikolumny buforem o niskiej sile jonowej lub
wodą (pH 7,0-9,0) i gotowe jest do bezpośredniego wykorzystania w technikach
biologii molekularnej (takich jak PCR, QPCR, Southern blotting, sekwencjonowanie
DNA, trawienie enzymami restrykcyjnymi, ligacja DNA itp.) lub może być
przechowywane do późniejszego użycia.
®
DNA YEAST KIT
V.
KONTROLA JAKOŚCI
Każda partia produkcyjna (LOT) zestawu EXTRACTME® DNA YEAST testowana
jest według opracowanych procedur. Wydajność, czystość oraz stabilność
wyizolowanego DNA analizowane są metodami spektrofotometrycznymi
oraz elektroforetycznymi. Dodatkowo funkcjonalna jakość oczyszczonego
DNA sprawdzana jest w reakcjach PCR i QPCR oraz reakcji trawienia
enzymami restrykcyjnymi.
VI. SPECYFIKACJA PRODUKTU
Materiał wyjściowy
Płynna lub powierzchniowa hodowla drożdży bądź mrożony osad komórkowy.
Wydajność izolacji
Liczba komórek: ≤ 1 x 108 Ž 100%
Liczba komórek: 2 x 108 ÷ 9 x 108 Ž 30-70%
Pojemność złoża
ok. 40 µg DNA
Czas izolacji
ok. 75 minut
Czystość DNA
A 260/A 280 = 1,7-2,0
VII. środki ostrożności
pp Hodowla drożdży jest biologicznym materiałem niebezpiecznym ze względu na zawartość mikroorganizmów potencjalnie patogennych lub substancji zagrażających zdrowiu, bądź życiu człowieka. Przy pracy z hodowlami
mikroorganizmów należy stosować się do wymogów dotyczących biologicznych materiałów niebezpiecznych.
pp Zaleca się przeprowadzać całą procedurę izolacji w komorze II klasy bezpieczeństwa biologicznego lub przy palniku laboratoryjnym, używać ochronnej odzieży laboratoryjnej oraz rękawiczek jednorazowych.
pp Należy unikać dotykania ścianek minikolumn pipetą, aby nie przenosić śladów DNA pomiędzy kolejnymi minikolumnami.
www.dnagdansk.com
Nr kat. EM10
pp Odpady zawierające sole guanidyny mogą tworzyć wysoce reaktywne
związki w połączeniu z substancjami utleniającymi. W przypadku rozlania
buforu, powierzchnię zmyć wodą z detergentem.
pp W przypadku rozlania cieczy zawierającej mikroorganizmy, zanieczyszczoną powierzchnię zmyć wodnym roztworem detergentu.
pp Zalecane jest używanie jałowych końcówek z filtrami do pipet.
VIII. SZCZEGÓLNE ZALECENIA I UWAGI
Materiał
Wydajność izolacji i jakość wyizolowanego DNA mogą zależeć od: ilości komórek
w materiale wyjściowym, typu komórki (morfologia), obecności antybiotyków
w pożywce, rodzaju pożywki, a także fazy wzrostu, wieku i stanu komórek
drożdżowych.
Zestaw przeznaczony jest do izolacji DNA maksymalnie z 1 x 10 8 komórek
drożdżowych. Użycie większej liczby komórek może spowodować drastyczny
spadek wydajności izolacji oraz czystości wyizolowanego DNA .
Zaleca się prowadzenie izolacji ze świeżej hodowli lub mrożonych osadów
komórkowych. Należy unikać wielokrotnego zamrażania i rozmrażania materiału
przed izolacją DNA. Użycie starego bądź wielokrotnie rozmrażanego materiału
może skutkować niską wydajnością izolacji wysokocząsteczkowego DNA .
Elucja DNA ze złoża
Optymalną objętość buforu elucyjnego (Elution Buffer) należy dobrać
w zależności od liczby komórek użytych do izolacji oraz od oczekiwanego
poziomu stężenia DNA w eluacie. Zaleca się stosowanie 50-100 μl Elution Buffer
przy izolacji maksymalnie z 1 x 10 8 komórek drożdżowych oraz zwiększenie
objętości buforu elucyjnego do 200 μl w przypadku większej liczby komórek.
Jeśli pożądane jest otrzymanie DNA o wysokim stężeniu, objętość buforu
elucyjnego można zmniejszyć nawet do 20 μl. Należy mieć jednak na uwadze,
że obniży to wydajność odzysku DNA . Istotne w tym przypadku jest dodanie
buforu elucyjnego centralnie na powierzchnię złoża.
W celu uzyskania maksymalnej wydajności elucji DNA , bufor elucyjny należy
podgrzać do 80°C i wydłużyć czas inkubacji złoża z buforem do 10 minut.
Jeśli istotne jest odzyskanie całkowitego DNA z minikolumny można
przeprowadzić dodatkową elucję (200 μl). W tym przypadku należy powtórzyć
pkt. 19-21 Protokołu izolacji DNA (sekcja XII), umieszczając minikolumnę
w nowej probówce 1,5 ml typu Eppendorf.
Elution Buffer zawiera 0,5 mM EDTA , którego obecność może przeszkadzać
w niektórych reakcjach enzymatycznych (np. sekwencjonowanie DNA). Do
®
DNA YEAST KIT
elucji DNA można użyć także buforu 5-10 mM Tris-HCl, pH 8,0-9,0 lub innych
buforów do celów specjalnych, o pH i stężeniu soli zbliżonych do tego buforu.
Dodatek czynników redukujących
Aby wspomóc proces lizy ściany komórkowej drożdży do buforu do sferoplastów
YS Buffer należy dodać β-markaptoetanol (β-ME) lub ditreitol (DTT). Związki
te są związkami redukującymi mostki dwusiarczkowe i stanowią, oprócz Lysis
Mix, dodatkowy czynnik wspomagający dezintegrację ściany komórkowej
drożdży. Dodatek czynnika redukującego jest opcjonalny w protokole izolacji.
Przygotowanie YS Buffer
W przypadku izolacji z większej ilości próbek wygodniej jest przygotować
wcześniej bufor do sferoplastów YS Buffer z dodatkiem β-ME lub DTT.
W tym celu należy odlać odpowiednią ilość YS Buffer do probówki
lub falkonu, tak aby wystarczyło do przeprowadzenia danej liczby
izolacji. Na każdy 1 ml buforu należy dodać 1 μl 14 M β-ME lub 50 μl 1
M DTT i dokładnie wymieszać. Przygotowane osady zawiesić w 200 μl
przygotowanego buforu YS Buffer, dodać 2 μl Lysis Mix, 4 μl RNase A
i wymieszać przez worteksowanie. Kontynuować izolację od pkt. 4 Protokołu
izolacji DNA (sekcja XII).
IX. PRZYGOTOWANIE PRÓBKI
Izolacja DNA z hodowli płynnej (0,2 – 3 ml)
Przed pobraniem odpowiedniej objętości hodowli płynnej, zawiesinę komórek
należy dokładnie wymieszać. Do 1,5 ml probówki typu Eppendorf przenieść
żądaną objętość hodowli (maksymalnie 1,5 ml) i wirować przy 5-6 tys. rpm (3-4
tys. × g). Zdekantować supernatant. Jeśli istnieje potrzeba izolacji z większej niż
1,5 ml objętości hodowli, do powstałego osadu dodać kolejne 1,5 ml hodowli
i powtórzyć wirowanie. Kontynuować izolację od pkt. 2 Protokołu izolacji DNA
(sekcja XII).
Izolacja DNA z zamrożonego osadu komórkowego
Zamrożony osad po wyjęciu z zamrażalnika należy bezzwłocznie zawiesić w 200
μl YS Buffer. Nie należy doprowadzać do rozmrożenia osadu. Kontynuować
izolację od pkt. 3 Protokołu izolacji DNA (sekcja XII).
Izolacja DNA z hodowli powierzchniowej
Do probówki 1,5 ml typu Eppendorf przenieść 200 μl YS Buffer. Ezą pobrać obfitą
liczbę komórek drożdżowych z płytki Petriego i zawiesić w buforze. Kontynuować
izolację od pkt. 3 Protokołu izolacji DNA (sekcja XII).
www.dnagdansk.com
Nr kat. EM10
X.
PRZED PRZYSTĄPIENIEM DO IZOLACJI
1.
2.
Każdy z odczynników zestawu należy wymieszać.
3.
4.
5.
6.
7.
Należy pamiętać o rozpuszczeniu liofilizatu Proteinase K w odpowiedniej ilości buforu do proteinazy
(Proteinase Buffer) oraz liofilizatu RNase A w odpowiedniej ilości buforu do RNazy (RNase Buffer).
W przypadku wytrącenia się osadu w buforach, butelkę z roztworem należy ogrzać do
temp. 50-60°C i inkubować, aż do całkowitego rozpuszczenia się osadu, mieszając co kilka minut,
a następnie schłodzić do temp. pokojowej.
Nagrzać termoblok lub łaźnię wodną do temp. 30⁰C i 55⁰C.
Można ogrzać odpowiednią ilość buforu elucyjnego do temp. 70°C.
Należy pamiętać, żeby wszystkie etapy izolacji przeprowadzać w temp. pokojowej.
Wszystkie etapy wirowania zostały zoptymalizowane z wykorzystaniem mikrowirówki Eppendorf
5417C. Prędkości wirowania podane w jednostkach rpm odnoszą się do tej mikrowirówki.
XI. BEZPIECZEŃSTWO I POSTĘPOWANIE Z PRODUKTEM
H225 Wysoce łatwopalna ciecz i pary. H302 Działa szkodliwie po połknięciu. H315 Działa drażniąco na
skórę. H318 Powoduje poważne uszkodzenie oczu. H319 Działa drażniąco na oczy. H334 Może powodować
objawy alergii lub astmy lub trudności w oddychaniu w następstwie wdychania. H335 Może powodować
podrażnienie dróg oddechowych. H336 Może wywoływać uczucie senności lub zawroty głowy. H411
Działa toksycznie na organizmy wodne, powodując długotrwałe skutki. P210 Przechowywać z dala od
źródeł ciepła/ iskrzenia/ otwartego ognia/ gorących powierzchni. Palenie wzbronione. P261 Unikać
wdychania pyłu/ dymu/ gazu/ mgły/ par/ rozpylonej cieczy. P273 Unikać uwolnienia do środowiska.
P280 Stosować rękawice ochronne/ odzież ochronną/ ochronę oczu /ochronę twarzy. P305 + P351 +
P338 W PRZYPADKU DOSTANIA SIĘ DO OCZU: Ostrożnie płukać wodą przez kilka minut. Wyjąć soczewki
kontaktowe, jeżeli są i można je łatwo usunąć. Nadal płukać. P342 + P311 W przypadku wystąpienia
objawów ze strony układu oddechowego: Skontaktować się z OŚRODKIEM ZATRUĆ lub z lekarzem.
YS Buffer, YL Buffer
Lysis Mix
YB Buffer
YW Buffer
Proteinase K
Proteinase K
Proteinase K
Uwaga
H315, H319, H335, P261, P305+P351+P338
Niebezpieczeństwo
H302, H315, H319, P305+P351+P338
Niebezpieczeństwo
H302, H315, H318, H319, H411, P273, P280, P305+P351+P338
Niebezpieczeństwo
H225, H319, H336, P210, P261, P305+P351+P338
Niebezpieczeństwo
H315, H319, H334, H335, P261, P305+P351+P338, P342+P311
Niebezpieczeństwo
H315, H319, H334, H335, P261, P305+P351+P338, P342+P311
Uwaga
H319, P305+P351+P338
1.
®
DNA YEAST KIT
XII. PROTOKÓŁ IZOLACJI DNA
1. Zwirować 1,5 ml hodowli drożdżowej przy 5-6 tys. rpm
(3-4 tys. × g) przez 5 min.
Można użyć większej objętości hodowli. W tym przypadku należy
postępować według modyfikacji protokołu opisanej w sekcji IX.
Przygotowanie próbki.
2. Supernatant zdekantować, a osad komórkowy dokładnie
zawiesić w 200 μl YS Buffer.
3. Dodać 2 μl Lysis Mix, 4 μl RNase A oraz 0,2 μl 14 M β-ME
(opcjonalnie, nie zawarty w zestawie), a następnie wymieszać
przez worteksowanie.
Można przygotować odpowiednią ilość buforu YS z dodatkiem β-ME
przed izolacją. Dokładne instrukcje opisane są w sekcji VIII. Szczególne
zalecenia i uwagi.
Alternatywnie do β-ME można dodać 10 μl 1 M DTT. Można także pominąć
dodatek związku redukującego, jednak odczynnik Lysis Mix nie będzie wtedy
działał z maksymalną wydajnością.
4. Inkubować 30 min w temp. 30°C, mieszając co 8-10 min
przez odwracanie.
5. Po inkubacji wirować próbkę 2-8 min przy 4,5 tys. rpm
(1 tys. × g).
6. Ostrożnie usunąć supernatant pipetą. Zwrócić szczególną
uwagę, aby nie naruszyć osadu sferoplastów.
7. Osad dokładnie zawiesić w 200 μl YL Buffer.
8. Dodać 10 μl Proteinase K i wymieszać przez worteksowanie.
9. Inkubować 10 min w temp. 55°C.
10. Dodać 350 μl YB Buffer i dokładnie wymieszać.
11. Inkubować kolejne 5 min w temp. 55°C.
12. Po inkubacji próbkę intensywnie worteksować przez 15 s.
www.dnagdansk.com
Nr kat. EM10
13. Wirować 2 min przy 10-12 tys. rpm (11-15 tys. × g).
14. Nie naruszając osadu delikatnie przenieść supernatant do
minikolumny ze złożem, umieszczonej w probówce odbierającej
i wirować 1 min przy 10-12 tys. rpm (11-15 tys. × g).
15. Przenieść minikolumnę do nowej probówki odbierającej (2 ml).
16. Dodać do minikolumny 600 μl buforu płuczącego YW Buffer
i wirować 30 s przy 10-12 tys. rpm (11-15 tys. × g).
17. Wylać przesącz z probówki odbierającej i umieścić w niej
ponownie minikolumnę.
18. Dodać do minikolumny 400 μl YW Buffer i wirować 30 s przy
10-12 tys. rpm (11-15 tys. × g).
19. Wyjąć minikolumnę, wylać przesącz i umieścić ponownie
minikolumnę w probówce odbierającej.
20. Wirować 2 min przy 12-14 tys. rpm (15-21 tys. × g).
21. Ostrożnie wyjąć suchą minikolumnę z probówki odbierającej
i umieścić ją w jałowej probówce 1,5 ml typu Eppendorf.
Bufor płuczący zawiera alkohol, który może powodować inhibicję
niektórych reakcji enzymatycznych, a także obniżenie wydajności elucji,
dlatego istotne jest jego całkowite usunięcie przed etapem elucji.
22. Nanieść 50-100 μl Elution Buffer uprzednio ogrzanego do
temp. 70°C centralnie na złoże w minikolumnie.
Możliwe jest zwiększenie objętości buforu elucyjnego. Więcej wskazówek
dotyczących tego etapu znajduje się w sekcji VIII. Szczególne zalecenia i uwagi.
23. Inkubować minikolumnę z buforem przez 2 min.
24. Wirować 1 min przy 10-12 tys. rpm (11-15 tys. × g).
25. Minikolumnę usunąć, a wyizolowane DNA przechowywać
w temp. +4°C lub temp. -20°C do czasu dalszych analiz.
®
DNA YEAST KIT
XIII. MOŻLIWE PROBLEMY I ICH ROZWIĄZYWANIE
Problem
Prawdopodobna
przyczyna
Niecałkowita liza ściany Za krótki czas lizy
komórkowej drożdży.
dla danego rodzaju
i ilości materiału.
Zatkane
złoże minikolumny.
Niska wydajność
izolacji DNA.
www.dnagdansk.com
Rozwiązanie
Należy wydłużyć inkubację w 30°C co najmniej
do 60 minut.
Do izolacji wzięto za
dużą liczbę komórek.
Należy powtórzyć izolację z mniejszej objętości hodowli.
Obniżona wydajność
działania roztworu
Lysis Mix.
Należy użyć świeżego roztworu Lysis Mix. Upewnić się,
że Lysis Mix jest przechowywany w temp. -20°C.
Nie dodano
czynnika redukującego.
Należy powtórzyć izolację upewniając się, że dodano
odpowiednią ilość β-ME lub DTT.
Powstała zawiesina
DNA , która trudno
przechodzi przez złoże.
Powtórzyć wirowanie przez 1 min przy maksymalnie
14 tys. rpm (21 tys. x g).
Niecałkowita
liza komórek.
Patrz Problem „Niecałkowita liza ściany
komórkowej drożdży”.
Materiał
o niskiej zawartości
komórek drożdżowych.
Zwiększyć objętość hodowli użytej do izolacji do 3 ml lub
więcej i/lub zmniejszyć objętość buforu elucyjnego do
20 μl.
Niecałkowita
liza komórek.
Patrz Problem „Niecałkowita liza ściany
komórkowej drożdży”.
Niecałkowita elucja DNA.
Przed naniesieniem na złoże podgrzać Elution Buffer
do temp. 80°C. Nanieść Elution Buffer centralnie na
powierzchnię złoża. Wydłużyć czas inkubacji z Elution
Buffer (powyżej 10 minut). Przeprowadzić powtórną elucję.
Zwiększyć objętość Elution Buffer użytego do elucji do
200 μl.
Niewłaściwe pH wody
(pH <7,0).
Do elucji użyć Elution Buffer.
Niewystarczające
zmieszanie lizatu
z buforem wiążącym
YB Buffer.
Izolację należy powtórzyć zwracając uwagę na całkowite
zmieszanie lizatu z YB Buffer przed inkubacją
w temp. 55°C (pkt. 8).
Obniżona aktywność
proteinazy K.
Sporządzić świeży roztwór proteinazy K. Należy upewnić
się, że roztwór proteinazy K jest przechowywany
w temp. –20°C.
Niecałkowite wysuszenie
kolumny z resztek
buforu płuczącego.
Izolację należy powtórzyć, zwracając szczególną uwagę,
aby po etapie „wirowania na sucho” (pkt.17) nie pozostało
żadnych resztek buforu płuczącego w minikolumnie.
Nr kat. EM10
Problem
Prawdopodobna przyczyna
Rozwiązanie
DNA wypływa
ze studzienek
w żelu agarozowym.
Obecność alkoholu w próbce.
Po każdym etapie płukania usuwać przesącz
z probówki odbierającej. Po drugim etapie płukania
pamiętać o przeprowadzeniu etapu „wirowania
na sucho”.
Niskie stężenie
wyizolowanego DNA.
Za duża objętość Elution Buffer.
Objętość buforu elucyjnego można zmniejszyć do
30 μl bez obniżenia wydajności elucji.
Wyizolowane DNA
jest podegradowane.
Nieprawidłowe
warunki przechowywania
materiału.
Izolację należy prowadzić ze świeżych lub
mrożonych osadów komórkowych. Należy unikać
częstego zamrażania i rozmrażania materiału.
Do izolacji użyto
starego materiału.
Zalecana jest izolacja ze świeżej hodowli
nocnej. Starsze hodowle mogą zawierać
podegradowane DNA.
Za krótki czas inkubacji
z RNazą A .
Należy wydłużyć czas inkubacji z RNazą A (pkt. 4)
do 30 min.
Obniżona aktywność RNazy A .
Izolację należy powtórzyć dodając świeży
roztwór RNazy A. Upewnić się, że RNaza A jest
przechowywana w temp. -20°C.
Niecałkowite wysuszenie
minikolumny z resztek
buforu płuczącego.
Izolację należy powtórzyć, zwracając szczególną
uwagę, aby po etapie „wirowania na sucho” (pkt. 17)
nie pozostało żadnych resztek buforu płuczącego
w minikolumnie.
Niewystarczająca ilość DNA
w eluacie.
Patrz Problem „Niecałkowita liza ściany komórkowej
drożdży” i „Niskie stężenie wyizolowanego DNA”.
Duża zawartość RNA w próbce.
Patrz Problem „Niecałkowita degradacja RNA”.
Niecałkowita degradacja
białek w związku z obniżoną
aktywnością proteinazy K.
Sporządzić świeży roztwór proteinazy K. Należy
upewnić się, że roztwór proteinazy K jest
przechowywany w temp. -20°C.
Pominięto jeden z dwóch
etapów płukania.
Izolację należy powtórzyć, pamiętając o obu
etapach płukania.
Niecałkowite wysuszenie
minikolumny z resztek buforu
płuczącego.
Izolację należy powtórzyć, zwracając szczególną
uwagę, aby po etapie „wirowania na sucho” (pkt. 17)
nie pozostało żadnych resztek buforu płuczącego
w minikolumnie.
Niecałkowita
degradacja RNA.
Reakcje enzymatyczne
z użyciem
wyizolowanego
DNA nie
zachodzą prawidłowo.
Wyizolowane DNA jest
niskiej czystości.
www.dnagdansk.com
BLIRT S.A ., ul. Trzy Lipy 3/1.38, 80–172 Gdańsk, www.dnagdansk.com
T: +48 58 739 61 50 F: +48 58 739 61 51 E: [email protected]
Download