Kurs specjalistyczny z Modelowania
advertisement
Kurs specjalistyczny z Modelowania Molekularnego Białystok, dn. 24.01.2015 r. Chcesz poznać nowoczesne techniki chemii kwantowej do obliczeń i wizualizacji procesów chemicznych? Chcesz wykorzystywać modelowanie molekularne do przewidywania oraz planowania swoich eksperymentów? Chcesz zrozumieć zachowanie się cząsteczek? Rada Uczelniana Samorządu Doktorantów Uniwersytetu w Białymstoku serdecznie zaprasza doktorantów i pracowników naukowych do udziału w Kursie specjalistycznym z Modelowania Molekularnego, który odbędzie się w dniach 7-10 marca 2015 roku w Instytucie Chemii Uniwersytetu w Białymstoku. Modelowanie molekularne jest obecnie prężnie rozwijającym się narzędziem do pracy naukowej nie tylko specjalistom z chemii teoretycznej i fizyki kwantowej, a także eksperymentatorom. Z każdym rokiem zainteresowanie modelowaniem molekularnym wzrasta, ponieważ szybko, precyzyjnie i bez stosowania szkodliwych odczynników daje odpowiedzi na, często niemożliwe do wyjaśnienia metodami eksperymentalnymi, pytania związane z: projektowaniem nowych związków chemicznych (katalizatorów, leków) oraz materiałów o ściśle zdefiniowanych właściwościach, dokładnym wyjaśnieniem procesów, zachodzących na różnych powierzchniach i w różnych fazach, wyznaczeniem możliwych ścieżek reakcji, stanów przejściowych wraz z pełnym opisem termodynamiki zachodzących procesów symulacjami różnych oddziaływań pomiędzy cząsteczkami itp. Kurs specjalistyczny z Modelowania Molekularnego składa się z dwóch części: teoretycznej i praktycznej (szczegółowa informacja dostępna w harmonogramie kursu). W części teoretycznej uczestnicy Kursu dokładnie zapoznają się z pojęciami: 1. Metody chemii kwantowej: od pierwszych zasad do mechaniki molekularnej. 2. Zasoby komputerowe. Zależność wykorzystania metod modelowania molekularnego ze względu na rodzaj analizowanego układu. 3. Modelowanie molekularne w fazie gazowej, ciekłej i na ciele stałym. 4. Oddziaływania międzycząsteczkowe w cieczach: rozpuszczalnik - substancja rozpuszczona. Solwatacja na poziomie molekularnym. 5. Modelowanie molekularne związków biologicznych. Podstawy drug design. 6. Optymalizacja i zrównoważenie struktur związków chemicznych. 7. Dynamika molekularna: klasyczna vs ab initio. 8. Zastosowanie podejścia hybrydowego QM/MM do modelowania procesów chemicznych. 9. Modelowanie procesów katalitycznych na powierzchni ciała stałego. 10. Adsorpcja cząsteczek organicznych na powierzchni metali oraz alotropów węgla. Praktyczna część kursu polega na poznaniu zaawansowanego i aktualnie popularnego oprogramowania do obliczeń kwantowo-mechanicznych, a także na budowie cząsteczek, obliczeniach statycznych, przewidywaniu najbardziej prawdopodobnej struktury nowych związków, wyliczeniu widm IR, CD, NMR związków oraz porównaniu widm z danym eksperymentalnymi, zapoznaniu się z dynamiką molekularną procesów solwatacji i adsorpcji, zastosowaniu dynamiki klasycznej do badań obiektów biologicznych oraz wykonaniu symulacji dynamiką molekularną. Kurs specjalistyczny z Modelowania Molekularnego Prowadzący kurs: dr Paweł Rodziewicz (Uniwersytet w Białymstoku, Fundacja Upowszechniania Nauk Chemicznych) Organizator kursu: Rada Uczelniana Samorządu Doktorantów UwB Patroni i sponsorzy kursu: Dziekan Wydziału Biologiczno-Chemicznego Uniwersytetu w Białymstoku Polskie Towarzystwo Chemiczne, Oddział w Białymstoku Ważne terminy: rejestracja – do 20.02.2015 r. potwierdzenie uczestnictwa przez organizatorów – do 22.02.2015 r. wniesienie opłat – do 02.03.2015 r. Termin i czas trwania kursu: 7-10 marca 2015 roku godz. 900 – 1630 Miejsce: Białystok, Kampus UwB, ul. Ciołkowskiego 1K, Instytut Chemii, s. 2008 Koszt udziału w kursie: 100 zł. - dla doktorantów i pracowników naukowych Uniwersytetu w Białymstoku, 300 zł. - w przypadku uczestników z innych uczelni. (opłata wlicza wszystkie materiały potrzebne do realizacji kursu oraz przerwy kawowe) Opłatę za udział w Kursie prosimy wpłacać na konto: Fundacja Upowszechniania Nauk Chemicznych 63 1940 1076 3124 6396 0000 0000 ul. Hurtowa 1, 15-399 Białystok z dopiskiem: KursMM_imię_nazwisko Ilość miejsc ograniczona (8 uczestników). Decyduje kolejność zgłoszeń. Udział w kursie jest możliwy tylko pod warunkiem wcześniejszej rejestracji. Rejestracja dostępna na stronie: https://docs.google.com/forms/d/1SMdL6ljriylmX6JaihotXcEoeSVDc8W3w6MBEiHlBE/viewform Kontakt: [email protected] 85 745 78 15 602 32 00 53 Z szacunkiem, Rada Uczelniana Samorządu Doktorantów UwB Kurs specjalistyczny z Modelowania Molekularnego Harmonogram Kursu 7 marca 9 marca 900 – 1030 – Powitanie uczestników Kursu. 900 – 1030 – Część teoretyczna kursu 5 Część teoretyczna 1 1030 – 1045 – Przerwa kawowa 1030 – 1045 – Przerwa kawowa 1045 – 1200 – Część teoretyczna kursu 6 1045 – 1200 – Część teoretyczna kursu 2 1200 – 1300 – Przerwa obiadowa 1200 – 1300 – Przerwa obiadowa 1300 – 1430 – Zajęcia praktyczne 5 1300 – 1430 – Zajęcia praktyczne 1 1430 – 1445 – Przerwa kawowa 1430 – 1445 – Przerwa kawowa 1445 – 1630 – Zajęcia praktyczne 6 1445 – 1630 – Zajęcia praktyczne 2 10 marca 8 marca 900 – 1030 – Część teoretyczna kursu 7 900 – 1030 – Część teoretyczna kursu 3 1030 – 1045 – Przerwa kawowa 1030 – 1045 – Przerwa kawowa 1045 – 1200 – Część teoretyczna kursu 8 1045 – 1200 – Część teoretyczna kursu 4 1200 – 1300 – Przerwa obiadowa 1200 – 1300 – Przerwa obiadowa 1300 – 1430 – Zajęcia praktyczne 7 1300 – 1430 – Zajęcia praktyczne 3 1430 – 1445 – Przerwa kawowa 1430 – 1445 – Przerwa kawowa 1445 – 1630 – Zajęcia praktyczne 8. 1445 – 1630 – Zajęcia praktyczne 4 Podsumowanie Kursu Zajęcia praktyczne 1: Wprowadzenie do systemu operacyjnego Linux. Tworzenie struktur cząsteczek. Zajęcia praktyczne 2: Proste obliczenia w fazie gazowej. Optymalizacja geometrii cząsteczek w podejściu Teorii funkcjonałów gęstości (DFT). Zajęcia praktyczne 3: Cząsteczki w fazie gazowej: rotacja wokół kąta dwuściennego, zmiany konformacyjne, projekcje Newmana. Zajęcia praktyczne 4: Własności spektralne cząsteczek: teoretyczne obliczenia widm IR, CD, NMR. Analiza orbitali molekularnych: orbitale HOMO i LUMO. Zajęcia praktyczne 5: Podstawy wizualizacji w programie VMD. Modelowanie rozpuszczalnika explicite. Analiza trajektorii ruchu cząsteczek za pomocą dynamiki ab initio. Zajęcia praktyczne 6: Własności fizykochemiczne cieczy. Funkcje rozkładu. Kurs specjalistyczny z Modelowania Molekularnego Zajęcia praktyczne 7: Obliczenia na ciele stałym: struktura heksagonalna lodu, adsorpcja cząsteczek organicznych na lodzie. Wprowadzenie do programu do wizualizacji struktur krystalicznych VESTA oraz XcrysDen. Zajęcia praktyczne 8: Obliczenia kwantowo-mechaniczne nanomateriałów węglowych. Obliczenia zachowania biopolimerów w rozpuszczalnikach na przykładzie cząsteczek białek.
