25. IV. 07 r. - CYKL KOMÓRKOWY - szereg zmian biofizycznych i biochemicznych komórki, zachodzący końcem jednego z początkiem nastepnego podziału. Faza G1 - trwa 6-12 h, przerwa pomiędzy zakończeniem podziału i początkiem fazy S - przygotowanie komórki do podwojemia materiału genetycznego - synteza RNA, enzymów, białek, węglowodanów i tłuszczów charakterystycznych dla danego typu komórki Faza S - trwa 6-8 h - replikacja DNA z 2n do 4n - zwiększenie rozmiarów jądra, chromatyna pozostaje zbitą masą Faza G2 - synteza białek związanych z regulacją procesu podziałowego - sprawdzenie, czy DNA zostało prawidłowo podwojone - komórka nadal rośnie wraz z ważniejszymi organellami - pod koniec tej fazy zachodzi kondensacja chromatyna - duplikacja centrioli i centrosomów Faza M - trwa 1 h - 2 etapy - podział jądra (kariokineza) i podział cytoplazmy (cytokineza) - 2 typy fazy M - mitoza w komórkach somatycznych i mejoza w kom. rozrodczych Faza G0 (GR) Komórki, które się nie dzielą, wycofują się z fazy G1 albo G2 do G0. Decyzja o wejściu do G0 najczęściej nie jest nieodwracalna, komórka może wyjść z tej fazy i dokończyć podział. Regulacja cyklu komórkowego: - jest inicjowany i regulowany przez wiele białek (kinazy, cykliny) i ich kompleksy - geny cyklu, których produkty białkowe pobudzają cykl to protoonkogeny, a te których białka hamują cykl to geny supresorowe - białka protoonkogenowe są enzymami, białkowymi kinazami zależnymi od cyklin CDK, fosfatazami lub białkami regulatorowymi - regulacja cyklu odbywa się przez uruchomienie kaskadowych reakcji fosforylacji cyklinami i defosforylacji białek Punkt kontrolny G1/S - gen kodujący białko p53 chroni komórką przed przemianą w komórkę nowotworową - uszkodzenie DNA prowadzi do pobudzenia kilku kinaz, które potrafią przyłączać grupy fosforanowe do p53, który jako czynnik transkrypcyjny uruchamia odczytywanie innych genów regulujących cykl, np. p21 - p21 odpowiada za zatrzymanie cyklu komórkowego na granicy G1/S Punkt kontrolny replikacji DNA - występuje w fazie S - rozpoznaje uszkodzenia DNA i powoduje zatrzymanie cyklu na tym etapie Punkt kontrolny G2/M - czynnik MPA, czynnik indukujący mitozę - heterodimer CDK1/cyklina B - defosforylacja pre-MPF w aktywny MPF - powoduje przejście cyklu komórkowego z fazy G2 do M Punkty kontrolne w mitozie - między profazą i metafazą - wrzeciona mitotycznego - między anafazą i telofazą Cykliny 1. Mitotyczne (cyklina A i B) 2. G1: aktywne w fazie G1 i G1/S, należą do nich: cykliny C, D i E ; przy końcu C terminalnym zaw. rejon PEST rozpoznawany przez enzymy, odp. za ubikwitynację 3. Cykliny związane z jednostką MPF Kinazy cyklu komórkowego - CDK - kinazy zależne od cyklin - znanych jest kilkanaście kinaz, bliżej poznano 7 - CDK1 - CDK7 - przenoszą grupy fosforanowe na różne białka - są podstawowym składnikiem MPF Kinaza CD1 Wiązane cykliny Akt. w fazie cyklu Cyklina A,B S; G2/M CD2 CD3 CD4 CD5 CD6 CD7 A, E, D3, D1 ? D1 D D1 H S; G1/S; G1 G1? G1 G1 G1 ? Cykl komórkowy w powiązaniu z apoptozą: - apoptoza - degradacja białek i genomu - cykl kom. - genom podwaja się i powstają 2 nowe komórki - oba procesu są ściśle związane z rakiem (zaburzenia w cyklu, nadmierna proliferacja prowadzi do nowotworu; apoptoza eliminuje komórki rakowe) 9.V.07 r. - APOPTOZA Horvitz, Sulston, Brenner - badali apoptozę i dostali Nobla (2002) Caenorhabditis elegans - dorosły odobnik jest hermafrodytą i składa się z 959 komórek somatycznych. Liczba komórek powstających - 1090. W wyniku apoptozy ginie 131 (113 umiera w czasie embriogenezy, 18 podczas dorosłego życia). Geny proapoptotyczne: ced-3 (u człowieka ICE), ced-4 (u czł. - Apaf-1) Geny antyapoptotyczne - ced-9 (bcl-2) Zdrowa komórka -> obkurcza się i oddziela od komórek sąsiednich -> powstawanie pęcherzyków (uwypuklenia apoptotyczne), kondensacja chromatyny i cytoplazmy -> marginacja skondensowanej chromatyny na brzegach jądra - fragmentacja jądra i komórki -> fagocytoza Apoptoza 1. Dotyczy pojedynczych komórek 2. Zmniejszenie objętości komórek i pofałdowanie błony komórkowej. 3. Kondensacja chromatyny, fragmentacja jądra. 4. Zamknięcie organelli w ciałkach apoptotycznych. 5. Ciągłość błony komórkowej zachowana aż do momentu sfagocytowania ciałek apoptotycznych. 6. Brak zapalenie, hamowanie reakcji zapalnej. 7. Fagocytoza przez sąsiednie komórki i makrofagi. Nekroza 1. Dotyczy grup komórek. 2. Zwiększenie objętości i pęcznienie komórki. 3. Brak kondensacji chromatyny, liza jądra. 4. Pęcznienie i rozpad organelli. 5. Perforacja błony, zwartość komórki wydostaje się do przestrzeni pozakomórkowej. 6. Odczyn zapalny ze strony otoczenia. 7. Fagocytoza przez fagocyty. Czynniki wywołujące apoptozę: - hormony i cytokiny - deficyt czynników wzrostu i troficznych - czynniki cytotoksyczne - czynniki fizyczne Szlak zewnętrzny: - pobudzenie receptorów śmierci należących do nadrodziny receptorów TNF, np. CD95, TRAIL-R1 i R2 - receptory śmierci posiadają wewnątrzkomórkową domenę śmierci DD - po związaniu się liganda dochodzi do oligomeryzacji receptora, następnie powstaje kompleks DISC (death inducing signaling complex) - kompleks ten powstaje poprzez połączenie domen śmierci z białkiem adaptorowym FADD oraz z prokaspazą 8 - następuje aktywacja prokaspazy 8, która jest bezpośrednim aktywatorem kaspazy 3 Szlak wewnętrzny: - istotnym etapem jest uwolnienie cytochromu c z przestrzeni między błonami poprzez specjalne kanały - kanały te tworzone są przez białka z rodziny Bcl-2 samodzielnie lub po połączeniu się z białkami megakanału - wypływ cytochromu c jest sygnałem do tworzenia kompleksu zwanego apoptosomem - apoptosom składa się z cytochromu c, prokaspazy 9, ATP i białka Apaf-1, następnie aktywuje kaspazę 3 - podczas apoptozy z mitochondrium uwalniane są także białka Smac/Diablo i Omi, są one antagonistami inhibitorów apoptozy (IAP) Apoptoza indukowana przez cytotoksyczne limfocyty T: - limfocyt w kontakcie z komórką docelową uwalnia perforyny - cząsteczki perforyny tworzą w błonie komórki docelowej kanały - przez kanały wnikają granzymy B, aktywują szlak kaspaz - wraz z granzymami uwalniają się jony wapnia wpływające stymulująco na apoptozę Właściwości kaspaz: - proteazy cysteinowe zawierają kw. asparaginowy w pozycji P1 (proteoliza w miejscu reszty Asp) - syntetyzowane są jako nieaktywne zymogeny Dotychczas zidentyfikowano 14 kaspaz: - kaspazy inicjatorowe - 8, 9, również 2 i 10 - posiadają "domeny śmierci" CARD i DED - kaspazy wykonawcze 3, 6, 7 - aktywne enzymy prowadzące do destrukcji komórki Białka trawione przez kaspazy: - większość tych białek uczestniczy w procesach molekularnych związanych z cyklem komórkowym i apoptozą - do proteolizy białek dochodzi tylko przy udziałe kaspaz 3, 6, 7 Trawione są m. in. białka: - PARP (bierze udział w rozpoznawaniu i naprawianiu DNA) - ICAD - uczestniczy w apoptozie - Rb - bierze udział w cyklu komórkowym - MDM 2 - wiąże sięz p53 i je stabilizuje - niektóre białka szkieletu komórkowego, np. laminy, aktyna, fodryna - inne cząsteczki kaspaz Śmierć komóki niezależna od kaspaz: - proteaza aktywowana wapniem, kalpaina, pełni autonomiczną rolę w apoptozie - ostatnie doniesienia wskazują na jej rolę w procesie aktywacji i unieczynniania kaspaz 3, 7, 9 i 12; kaspazy mogą regulować jej działanie poprzez aktywację - proteazy serynowe: AP24 jest zaangażowne we fragmentację DNA - katepsyna D, proteaza lizosomalna, zaangażowana w zewnątrzpochodną dorgę aktywacji apoptozy - także inne katepsyny mogą uczestniczyć w regulacji apoptozy Rodzina białek Bcl-2: - białka proapoptotyczne np. Bax, Bad, Bak, Bik, Bid, Bel-xs zmuszają komórkę do apoptozy - białka antyapoptotyczne np. Bcl-2, Bcl-XL, Mcl-1 zwiększają prawkopodobieństwo przeżycia komórki - pełnią funkję regulatorową apoptozy przez oddziaływanie na wiele procesów komórkowych - kontrola komórkowego poziomu jonów (wapniowych, wodorowych, potasowych i chlorowych) - nadzór nad stanem redoks - regulacja wypływu z mitochondrium cytochromu c i AIF - aktywacja enzymów: kaspaz i DN-az - białka te tworzą homo- i heterodimery - stosunek białek antyapoptotycznych do proapoptotycznych o śmierci lub przeżyciu komórki - połączenie się białek w heterodimery o przeciwstawnym charakterze powoduje inhibicję ich biologicznej aktywności Fizjologiczne znaczenie apoptozy: - ma ogromne znaczenie w embriogenezie, wzroście i rozwoju narządów - jest procesem przeciwstawnym do mitozy i wspólnie z nią decyduje o liczbie komórek w populacji W rozwoju kręgowców: - śmierć komórek ogona kijanki w procesie metamorfozy - śmierć prawie połowy neuronów powstających w trakcie embriogenezy w rozwoju ukł. nerwowego - śmierć komórek soczewki oka w czasie jej kształtowania - zanik błony pławnej między palcami u zarodka ludzkiego - w życiu postnatalnym: apoptoza keratynocytów skóry, krypt jelitowych, komórek endometrium macicy itd. Apoptoza w stanach patologicznych: Ograniczenie apoptozy prowadzi do nowotworów i autoagresji komórek ukł. odpornościowego. Wzrost apoptozy jest charakterystyczny dla chorób zwyrodnieniowych: choroby Alzheimera, Parkinsona, AIDS, zawału serca czy udaru mózgu 16.V.07 r. - WZROST I RÓŻNICOWANIE KOMÓREK Wzrost zespołu komórek zachodzi na drodze zwiększania: - liczby komórek (proliferacja, rozrost, hiperplazja) - objętości i masy pojedynczych komórek (przerost, hipertrofia) - objętości i masy międzykomórkowej (akrecja) Przerost - zachodzi w fazie G1 cyklu komórkowego i w czasie różnicowania się komórek w życiu płodowym, objętość i masa poszczególnych komórek znacznie wzrasta Akrecja - zachodzi w wielu tkankach, głownie w tkance łącznej w życiu płodowym i pozapłodowym do okresu pokwitania, przyczynia się do zwiększania masy i objętości narządów. Wzrost organizmu w okresie rozwoju zarodkowego oraz w późniejszych etapach rozwoju odbywa się głównie przez proliferację. Jest ona sposobem odnowy komórek i zachodzi w cyklu komórkowym Populacje komórek: - rozrastająca się - komórki tej populacji znajdują się w cyklu komórkowym (proliferują), np. stadia rozwoju zarodkowego oraz wzrost nowotworów - wzrastająca - część komórek jest w cyklu komórkowym, a pozostałe w stanie G0 - populacje takie znajdują się w narządach organizmu rosnącego w życiu pozapłodowym - odnawiająca się - liczba komórek tej populacji nie zmienia się, chociaż pewna liczba komórek ją opuszcza (migracja, obumieranie, złuszczanie), na jej miejsce powstaje taka sama liczba nowych komórek przez proliferację, np. nabłonek - statyczna - stałą liczba komórek, np. nerwowe, mięśniowe. Wskutek starzenia się organizmu liczba komórek tych populacji zmniejsza się. Kom. nerwowe, mięśniowe - nieproliferujące ; stacjonarne Kom. wątroby, nerek, wyspy trzustkowe, gruczoły ślinowe - słabo proliferujące, wolno odnawiające się Kom. szpiku, ukł. limfatycznego, naskórka, nabłonka i rogówki - intensywnie proliferujące, szybko odnawiające się Różnicowanie charakteryzuje nieodwracalność, obniżenie potencji rozwoju oraz ograniczenie liczby funkcji specjalistycznych do kilku lub nawet jednej. Różnic. komórek (cytodyferencjacja) - proces powstawania różnych wyspecjalizowanych komórek. Jeżeli zmiany prowadzące do różnicowania są odwracalne, mówimy o modulacji. Wyróżnia się różnicowanie: - pierwotne - w najwcześniejszych fazach rozwoju - pośrednie - w późniejszych fazach rozwoju embrionalnego - terminalne - w życiu postembrionalnym Etapy różnicowania: Różnicowanie biochemiczne - wskutek przestrojenia potencji genomu ujawnia się kilka cech fenotypowych lub jedna z nich (synteza odpowiednuch enzymów i katalizowanie przez nie kilku produktów komórki, które są wyrazem jej specjalizacji) Różnicowanie komórkowe - wskutek zmian biochemicznych zmienia się budowa komórki, zwiększa się odpowiednio liczba struktur komórkowych, np. mitochondriów, pojawiają się wyspecjalizowane truktury, np. miofibryle, tono-neuro itp. Różnicowanie tkankowe - zespół komórek zróżnicowanych biochemicznie i komórkowo zestraja swoje właściwości i zaczyna działać jako tkanka. Czynniki wzrotu i różnicowania - cytokiny: - polipeptydy (ponad 40 rodzajów): pochodne kw. arachidonowego - leukotrieny, są wspólnie nazywane czynnikami wzrostu i różnicowania. Wysyłane są przez jedne komórki po to, aby swoiście zmienić zachowanie się innych komórek. Sygnał do podziałów jest przekazywany przez błonę komórkową po związaniu czynnika wzrostu z receptorem błonowym. Do najbardziej znanych czynników wzrostu i różnicowania należą: - czynnik wzrostu naskórka (EGF) - transformujący czynnik wzrostu (TGF) - czynnik wzrostu nerwów (NGF) - czynnik wzrostu fibroblastów (FGF) - leukotrieny B4, C4, D4 i E4 Obecnie dzięki wprowadzeniu inżynierii genetycznej wytwarza się cytokiny na skalę przemysłową i wykorzystuje jako leki. Zastosowanie cytokin w medycynie: - profilaktycznie, np. wykorzyst. erytropoetyny, aby zwiększyć liczbę erytrocytów - interwencyjne lub lecznicze: w celu leczenia konkretnego zaburzenia, np. neutropenii Sztuczne regulowanie różnicowania: - indukcja protoonkogenami - indukcja hormonami steroidowymi - czynnik wzrotu - dodawany do hodowli Odróżnicowanie - determinacja, redyferencjacja, powrót wyspecjalizowanych morfologicznie i funkcjonalnie komórek do stanu niezróżnicowanego, zach. w czasie transformacji nowotworowej.