Ewolucja wyrostka robaczkowego Autor tekstu: PZ Myers Tłumaczenie: Małgorzata Koraszewska Ponieważ właśnie udzieliłem ostrej nagany za wprowadzającą w błąd prezentację tego artykułu (http://scienceblogs.com/pharyngula/2009/08/darwin_a nd_the_vermiform_appen.php) (i muszę podkreślić, że dziwnego skupienie się na Darwinie w ogóle w nim nie ma), możemy teraz przyjrzeć mu się bliżej. Dane są super i przedstawiają wielką ilość pracy; nadal jednak jestem krytyczny wobec interpretacji. Fundamentalne pytanie brzmi: czy budowa wyrostka robaczkowego podlegała pozytywnej selekcji? Autorzy są po stronie odpowiedzi „tak". Ja jestem po stronie odpowiedzi „być może". Najpierw jednak ważne zastrzeżenie. Kreacjoniści od dawna mówili o wyrostku robaczkowym: są absolutnie przekonani, że musi mieć jakąś ważną funkcję, bo Bóg by go w nas nie umieścił bez celu. Ten artykuł im nie pomoże. Sednem tej pracy jest filogenetyczna analiza dystrybucji wyrostka robaczkowego u ssaków w oparciu o teorię ewolucji: zabierz ewolucję, a praca znika w podmuchu logiki. Jeśli kreacjoniści próbują twierdzić, że ten artykuł dowodzi czegoś, co cały czas twierdzili, to go nie czytali i nie zrozumieli — będzie to jasny przypadek błędnego koła niedorzeczności. Aby śledzić rozumowanie, musisz mieć jasny obraz umiejscowienia małego odcinka instalacji kanalizacyjnej u ssaków. Mały rysunek poniżej pokazuje miejsce złączenia jelita cienkiego z jelitem grubym, tą częścią, która znajduje się wewnątrz twojego brzucha nisko po prawej stronie. Kiedy jesz, pokarm najpierw wędruje do żołądka, gdzie dostaje kąpiel z kwasów i trochę enzymów oraz mnóstwo rozcierania przez mięśnie, żeby go rozdrobnić. Następnie zostaje wstrzyknięty do jelita cienkiego (pomalowane na pomarańczowo), gdzie najpierw neutralizowane są kwasy i do miazgi pokarmowej, jak nazywa się wodnista, brejowata zupa, w którą zamienił się pokarm, dorzucone jest więcej enzymów. Podstawowym zadaniem jelita cienkiego jest wyssanie z miazgi pokarmowej wszystkich składników odżywczych i przekazanie ich do układu krążenia. Kiedy już nasz układ wyssie z miazgi pokarmowej tyle dobrych rzeczy, ile potrafi, zupa przechodzi do jelita grubego (pomalowanego na łososiowy kolor na moim rysunku). Nadal jest to bardzo wodniste — jeśli kiedykolwiek mieliście biegunkę, to tak właśnie to wygląda w tym punkcie. Podstawowym zadaniem jelita grubego jest odzyskanie wody z tych odpadów, kondensując je w gęste, ciastowate bryłki, które wszyscy znamy i kochamy jako ekskrementy. Jelito grube jest tu zasadniczo stacją oczyszczania ścieków. Ciekawe w tym przejściu jest to, że robi ono parę dość dziwnych ślepych zaułków. Jelito ślepe (różowe) jest małym woreczkiem i do nikąd nie prowadzi, podczas gdy wyrostek robaczkowy (czerwony) jest cienką wypustką jelita ślepego. Różnią się oba wielkością w ramach gatunku i między gatunkami — niektórzy ludzie rodzą się bez wyrostka robaczkowego, a wśród większości, która go ma, istnieje co najmniej dwukrotny rozrzut wielkości. Między gatunkami różnice są jeszcze większe: większość ssaków wcale nie ma wyrostka robaczkowego, a niektóre mają olbrzymie jelita Racjonalista.pl Strona 1 z 6 ślepe i wyrostki robaczkowe. Powiększone jelito ślepe u większości tych gatunków służy jako komora fermentacyjna, w której spoczywa trudny do strawienia pokarm, a żyjące tam bakterie pomagają w rozłożeniu go. Wykres poniżej przedstawia niektóre z tych form — żeby wam trochę namieszać w głowach, na moim rysunku wszystkie są do góry nogami, a wyrostek robaczkowy zawsze jest narysowany na szczycie. Wyrostek jelita ślepego (a do l) lub podobne do wyrostka struktury (m do o) u rozmaitych ssaków. Jelito ślepe/wyrostek robaczkowy są skierowane do góry rysunku, dalszy koniec jelita cienkiego na lewo, a bliższy koniec jelita grubego ku dołowi. (a) człowiek, Homo sapiens; (b) orangutan borneański, Pongo pymaeus; (c) biało stąpający lepilemur, Lepilemur leucopus; (d) wombat szerokogłowy, Lasiorhinus latifrons; (e) zając bielak, Oryctolagus cuniculus; (f) kuskus, Phalanger gymnotis; (g) wiewiórolotka Derby’ego, Anomalurus derbianus; (h) pałanka kuzu, Trichosurus vulpecula; (i) kretoszczur, Bathyergus suillus; (j) jeżatka afrykańska, Atherurus africanus; (k) bóbr, Castor canadensis; (l) nornik, Microtus pennsylvanicus, pokazany z częściowo rozwiniętym jelitem grubym; (m) koala, Phascolarctos cinereus; (n) dziobak, Ornithorynchus anatinus; (o) kolczatka australijska, Tachyglossus aculeatus. Te obrazki pochodzą z artykułu Smitha i in. i pokazują jego najlepszą stronę - zbiera on w jednym miejscu mnóstwo rozproszonych informacji o dystrybucji wyrostka robaczkowego. Autorzy omawiają także zmienność morfologii; wygląda na to, że istnieje pewna niejednoznaczność, czym właściwie jest wyrostek robaczkowy. Badacze używali ścisłej definicji wyrostka jako „stosunkowo wąskiej i rozciągniętej, ślepo zakończonej struktury na szczycie jelita ślepego, która wyraźnie odróżnia się od jelita ślepego dzięki stosunkowo nagłej zmianie średnicy jelita między jelitem ślepym a wyrostkiem robaczkowym" i odkryli, że są wypadki, których ta definicja nie obejmuje. Niektóre gatunki mają coś, co wyraźnie wygląda jak wyrostek robaczkowy, ale nie mają jelita ślepego. Inne mają jelito ślepe, które stopniowo zwęża się w wąską tubkę i nie ma tam nagłej zmiany średnicy. Komplikuje to analizę, a więc zrobili dwie analizy: jedną przy użyciu ścisłej definicji i z wyłączeniem niektórych przypadków i drugą z użyciem szerszej definicji, która obejmowała każdy gatunek, posiadający choćby niewyraźną formę robaka dyndającego we właściwym miejscu. Następnie zmapowali dystrybucję wyrostków robaczkowych na uzgodnioną filogenezę ssaków i otrzymali przedstawiony poniżej diagram drzewa. Drzewo po lewej stronie jest narysowane z użyciem ścisłej definicji wyrostka robaczkowego, a po prawej z użyciem szerszej definicji. Taksony, które mają wyrostki robaczkowe, są czerwone, taksony, w których jest mieszanina gatunków z i bez wyrostków robaczkowych są niebieskie, a te w ogóle bez wyrostków są szare. (Kliknij, żeby powiększyć obraz) (http://scienceblogs.com/pharyngula/upload/2009/08/a ppendix_phylo.php) Phylogenetic tree of mammalian relationships with appendicular characters mapped onto it. A mammalian molecular consensus phylogeny was taken, and appendicular and cecal characters were mapped onto the constraint tree as described in the Materials and methods. Results from Analysis 1 are shown by solid lines, which indicate the presence of a true appendix. Results from Analysis 2 are shown by the solid lines and by the checkered lines, the Racjonalista.pl Strona 3 z 6 checkered lines indicating the presence of an appendix-like structure. On the left are shown results from analyses considering all taxa with variable expression of the appendix the same as taxa with consistent expression of the appendix. On the right are shown results considering all taxa with variable expression of the appendix as a separate state (indicated by the blue colour). Colour and pattern codes are as follows: grey, appendix absent; red, appendix present; red checkered, appendix-like structure present; blue, appendix variable; Blue checkered, appendix-like structure variable. To jest ciekawe: jedynymi grupami, które mają wyrostki robaczkowe są Glires (siekaczowce -gryzonie i zające), naczelne, stekowce i niektóre torbacze. Istnieje zdecydowany wzorzec dystrybucji: nie jest tak, że wyrostek robaczkowy jest losowym zakłóceniem w uporządkowaniu jelit, ale jest konsekwentnie zachowywany w niektórych liniach rodowych przez całe 80 milionów lat, i jest konsekwentnie tracony w innych. Warto mieć te dane i dostarczają one znacznego materiału do przemyśleń; nie zgadzam się jednak z autorami w interpretacji tych danych. Nie sądzę, by czysto morfologiczne dane dostarczały nam dość informacji, by rozstrzygnąć podniesione tu kwestie. Oto wnioski autorów wyciągnięte z tej dystrybucji: najbardziej oszczędnym wyjaśnieniem jest, że przodkowie ssaków nie mieli wyrostka robaczkowego, a więc większość istniejących ssaków jest w prymitywnym, bez-wyrostkowym stanie. Wyrostek robaczkowy wyewoluował następnie niezależnie 2-4 razy, a linie rodowe, które go nabyły, wykazują także często wtórną jego utratę. Autorzy twierdzą, że to z konieczności wskazuje na adaptacyjną funkcję wyrostka, bo inaczej nie zostałby zachowany u tak wielu naczelnych i siekaczowców. Mówią także, jaka jest ta możliwa funkcja. W wielu wypadkach, w których jelito ślepe jest bardzo duże, jest to funkcja trawienia — to jest obszar jelit, który może zostać rozszerzony w komorę fermentacyjną. U innych, jak u ludzi, jest to zbyt małe do pełnienia takiej roli, ale może być rezerwuarem bakteryjnych biofilmów, które są oporne na utratę podczas ataków biegunki i dostarczają źródła dla szybkiego odnowienia flory jelitowej, kiedy zostaje ona zniszczona przez chorobę. Autorzy pokazali obecność biofilmów w wyrostku, a także w bliższej części okrężnicy u tych grup, które nie mają wyrostków — tak więc istnienie wspierających kolonii bakteryjnych w tym regionie jelit jest prastare. Nie jestem całkowicie przekonany. Jeśli wyrostki robaczkowe torbaczy i Euarchontoglires (Euarchonta i siekaczowce) są rzeczywiście homologiczne, powinno to wskazywać na to, że ich ostatni wspólny przodek miał jelito ślepe/wyrostek robaczkowy… i ten wzorzec jest wyjaśniony przez szeroko rozprzestrzenioną i częstą utratę tego narządu. Autorzy widzą to, ale przyznają, że istnieje problem z analizą tej koncepcji: zależy ona od znacznie większego prawdopodobieństwa straty niż zysku, a nie istnieją prawdopodobieństwa, które moglibyśmy przypisać takim wydarzeniom. W porządku. Znaczy to jednak, że przedstawiona analiza nie wystarcza, by dać pełną odpowiedź. Ja chciałbym zobaczyć wzorzec ekspresji genów. Ten region instalacji kanalizacyjnej, gdzie jelito cienkie staje się jelitem grubym, jest interesującą strefą, którą muszą określać jakieś wzorcujące cząsteczki; ponadto spodziewam się, że w tym obszarze musi działać jakiś rodzaj sieci regulacyjnej genu, żeby określać różne odcinki jelita cienkiego, jelita ślepego, wyrostka robaczkowego i jelita grubego. Co to są za geny? Które geny podlegają ekspresji w różnych odcinkach? Jak współdziałają i jak są regulowane? Widzicie, w jakim kierunku myślę: chcę wiedzieć o zdarzeniach rozwojowych i molekularnych, jakie tu zachodzą. To pomoże rozwiązać kwestię ewolucji wyrostka robaczkowego. Nie jestem także przekonany argumentem, że zachowanie cechy przez 80 milionów lat koniecznie jest dowodem doboru dla jakiejś specyficznej funkcji. Inną możliwością jest, że jest to całkowicie strukturalne: istnieje szlak, który ustanawia przejście od jelita cienkiego do grubego i jako skutek uboczny określa kilka stref przejściowych, jelito ślepe i wyrostek robaczkowy. Są one przeważnie nieszkodliwe, a więc zostają zachowane jako cechy całkowicie neutralne, których niełatwo się pozbyć bez zakłócenia funkcji całości jelit. Mówię przeważnie nieszkodliwe, ponieważ jedną lekcją, którą wyciągamy z tej filogenezy jest, że bardzo wiele linii rodowych całkowicie pozbyło się tej struktury. Mogła to być utrata o zupełnie neutralnym charakterze, ale mogła to także być wskazówka, że na ogół wyrostek robaczkowy szkodzi. Solidniejsza odpowiedź mogłaby się wyłonić, gdybyśmy na przykład porównali sieci molekularne leżące u podstaw tworzenia się wyrostków robaczkowych u stekowców i ludzi i stwierdzili, że używają tego samego zestawu genów — wtedy musielibyśmy uznać wysokie prawdopodobieństwo, że są one homologiczne i że ostatni wspólny przodek miał wyrostek robaczkowy. I odwrotnie, gdyby mechanizmy do wyłączania rozwoju wyrostka robaczkowego u afroterów, szczerbaków i innych grup ssaków, które nie mają wyrostka robaczkowego, były identyczne, sugerowałoby to, że ostatni wspólny przodek łożyskowców miał ten mechanizm i nie miał wyrostka robaczkowego, a Euarchontoglires definitywnie wyewoluowały go na nowo. Pokażcie mi drzewo zbudowane na podstawie genów, a wtedy może zaakceptuję tę interpretację z większą pewnością! Uważam po prostu, że jedną rzeczą, jaką te dane pokazują, to że wyrostek robaczkowy jest nadzwyczaj labilnym narządem, co powoduje, że jego pojawianie się i znikanie jest sugestywne, ale nie rozstrzygające. Jeśli zaś chodzi o argument, że jedną funkcją wyrostka robaczkowego, która jest ważna dla współczesnej populacji ludzkiej, jest rola bakteryjnego rezerwuaru dla odtworzenia flory bakteryjnej jelit po jej utracie spowodowanej chorobą, to wydaje się to całkowicie rozsądne. Jednak fakt, że wyrostek robaczkowy ma uboczną funkcję, która może być użyteczna dla osobników w specjalnych okolicznościach, nie oznacza, że wyrostek robaczkowy nie jest organem szczątkowym. Ani nie znaczy koniecznie, że na jego przetrwanie działał dobór. Fakt, że niektóre współczesne populacje ludzkie mają znaczącą śmiertelność spowodowaną przez objawy biegunki (na przykład w wyniku cholery) wydaje mi się być stosunkowo trywialnym czynnikiem w badaniu, które pokazuje przetrwanie wyrostka robaczkowego przez wiele dziesiątków milionów lat, szczególnie, kiedy nie znamy żadnych dowodów na zróżnicowane przeżycie osobników mających wyrostek robaczkowy i tych, którym go brakuje. Jestem tu trochę negatywny, ale to przede wszystkim dlatego, że ta dystrybucja jest tak interesująca i sugestywna, i wskazuje drogę, którą powinniśmy iść w poszukiwaniu odpowiedzi na pytanie, dlaczego mamy wyrostek robaczkowy. Mam także własne uprzedzenia — skłaniam się bardziej ku poglądowi, że ten narząd jest na ogół dla nas neutralny i wolę wyjaśnienia oparte na architekturze sieci regulacyjnych genu — a naprawdę marzyłbym o zobaczeniu danych molekularnych leżących u podstaw tego wzorca (sądzę także, że mogłoby to rozwiązać niektóre komplikacje i wieloznaczności morfologii). To jest dobry artykuł, ale daje mi inne przesłanie. Mówi do mnie: „Więcej genów! Więcej rozwoju!" Ale też przyznaję, że to samo mówi do mnie większość artykułów. Źródło Smith HF, Fisher RE, Everett ML, Thomas AD, Randal Bollinger R, Parker W (2009 Comparative anatomy and phylogenetic distribution of the mammalian cecal appendix (http://www3.interscience.wiley.com/journal/122544996/abstract). „J. Evol. Biol." 12 sierpnia 2009. Tekst oryginału (http://scienceblogs.com/pharyngula/2009/08/evolutio n_of_the_appendix.php). Pharyngula (http://scienceblogs.com/pharyngula/) 25 sierpnia 2009 PZ Myers Ur 1957. Amerykański profesor biologii na uniwersytecie w Minnesocie, prowadzi również popularyzujący naukę blog Pharyngula. Pokaż inne teksty autora (Publikacja: 27-08-2009) Oryginał.. (http://www.racjonalista.pl/kk.php/s,6754) Contents Copyright © 2000-2009 Mariusz Agnosiewicz Programming Copyright © 2001-2009 Michał Przech Autorem portalu Racjonalista.pl jest Michał Przech, zwany niżej Autorem. Właścicielami portalu są Mariusz Agnosiewicz oraz Autor. Żadna część niniejszych opracowań nie może być wykorzystywana w celach komercyjnych, bez uprzedniej pisemnej zgody Właściciela, który zastrzega sobie niniejszym wszelkie prawa, przewidziane w przepisach szczególnych, oraz zgodnie z prawem cywilnym i handlowym, Racjonalista.pl Strona 5 z 6 w szczególności z tytułu praw autorskich, wynalazczych, znaków towarowych do tego portalu i jakiejkolwiek jego części. Wszystkie strony tego portalu, wliczając w to strukturę katalogów, skrypty oraz inne programy komputerowe, zostały wytworzone i są administrowane przez Autora. Stanowią one wyłączną własność Właściciela. Właściciel zastrzega sobie prawo do okresowych modyfikacji zawartości tego portalu oraz opisu niniejszych Praw Autorskich bez uprzedniego powiadomienia. Jeżeli nie akceptujesz tej polityki możesz nie odwiedzać tego portalu i nie korzystać z jego zasobów. Informacje zawarte na tym portalu przeznaczone są do użytku prywatnego osób odwiedzających te strony. Można je pobierać, drukować i przeglądać jedynie w celach informacyjnych, bez czerpania z tego tytułu korzyści finansowych lub pobierania wynagrodzenia w dowolnej formie. Modyfikacja zawartości stron oraz skryptów jest zabroniona. Niniejszym udziela się zgody na swobodne kopiowanie dokumentów portalu Racjonalista.pl tak w formie elektronicznej, jak i drukowanej, w celach innych niż handlowe, z zachowaniem tej informacji. Plik PDF, który czytasz, może być rozpowszechniany jedynie w formie oryginalnej, w jakiej występuje na portalu. Plik ten nie może być traktowany jako oficjalna lub oryginalna wersja tekstu, jaki zawiera. Treść tego zapisu stosuje się do wersji zarówno polsko jak i angielskojęzycznych portalu pod domenami Racjonalista.pl, TheRationalist.eu.org oraz Neutrum.eu.org. Wszelkie pytania prosimy kierować do [email protected]