Figure 1.5 Genomes 3 (© Garland Science 2007) Reguła komplementarności zasad – puryna w jednej nici łączy się za pośrednictwem wiązań wodorowych z pirymidyną w drugiej nici, przy czym zawsze adenina z tyminą oraz guanina z cytozyną. Wiązania wodorowe: A G T C stosunek A do T oraz stosunek C do G wynosi 1:1 Reguła polarności (biegunowości) – nici tworzące podwójny heliks biegną w przeciwnym kierunku, jedna od 5` do 3`końca deoksyrybozy, druga zaś od 3` do 5` końca deoksyrybozy. Figure 1.8a Genomes 3 (© Garland Science 2007) Podwójna helisa opisana przez Watsona i Crick`a jest formą B. DNA w komórce występuje głównie w formie B Inne formy DNA w komórce powstają dzięki elastyczności nukleotydów, która pozwala przybierać ich cząsteczkom różne kształty. Dlaczego? Cechy różnych form podwójnej helisy DNA Cecha Konformacja B-DNA Typ helisy Średnica helisy (nm) Przyrost długości helisy na parę zasad (nm) Skok helisy (nm) Liczba zasad na skręt A-DNA Z-DNA Prawoskrętna 2,37 0,34 Prawoskrętna 2,55 0,29 Lewoskrętna 1,84 0,37 3,4 10 3,2 11 4,5 12 Figure 1.9 Genomes 3 (© Garland Science 2007) DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: – zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA – zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji nukleotydów • Różnorodna kolejność występowania czterech różnych nukleotydów stwarza nieograniczone możliwości kodowania informacji genetycznej; • Informacja genetyczna występuje w postaci różnych sekwencji zasad w różnych odcinkach DNA odpowiadających pojedynczym genom; Przykład Jeśli założymy, że cząsteczka DNA jakiegoś organizmu składa się z 106 par nukleotydów, to ilość różnych sekwencji, które mogą wystąpić w tej cząsteczce DNA jest róna 4 10(6) • Podwójna struktura heliksu DNA umożliwia samopowielanie DNA (replikację), a więc również informacji w nim zawartej. • Każdy z komplementarnych łańcuchów tworzy matrycę (wzorzec), na której może być odtworzony drugi komplementarny łańcuch DNA.