GENETYKA Z BIOTECHNOLOGIĄ Dr hab. Jerzy Przyborowski, prof. UWM Dr hab. Danuta Packa Dr Paweł Sulima GENETYKA Z BIOTECHNOLOGIĄ (ECTS: 3) Cel kształcenia: 1. Poznanie podstawowych mechanizmów dziedziczenia oraz źródeł zmienności genetycznej roślin wyższych w celu zrozumienia funkcjonowania organizmów w środowisku przyrodniczym. 2. Poznanie metod utrzymania i poszerzania zmienności genetycznej w obrębie i między gatunkami roślin wyższych, w tym drzew leśnych. 3. Zapoznanie studentów z najnowszymi osiągnięciami z zakresu badań genetycznych i biotechnologicznych, wspierających hodowle leśne oraz z możliwością ich zastosowania w praktyce leśnej. GENETYKA Z BIOTECHNOLOGIĄ (ECTS: 3) Treści wykładów Budowa i organizacja materiału genetycznego w komórkach organizmów wyższych. Chromatyna – skład, struktura i poziomy organizacji. Cykl komórkowy, replikacja DNA. Zapis i odczyt informacji genetycznej. Pojęcie genu, budowa i struktura genów. Centralny dogmat biologii molekularnej. Etapy ekspresji genów i regulacja ich ekspresji. Źródła i rodzaje zmienności organizmów żywych. Zmienność rekombinacyjna – mechanizm i znaczenie. Zmienność mutacyjna – pojęcie i podział mutacji. Mutacje genowe i chromosomowe. Metody poszerzania zmienności genetycznej. Programy selekcji i zachowania leśnych zasobów genowych drzew oraz metody zachowania bioróżnorodności na poziomie genetycznym. Biotechnologia w utrzymaniu i kształtowaniu bioróżnorodności leśnej. Genetyczne i fizjologiczne podstawy kultur tkankowych in vitro: totipotencja i zdolności morfogenetyczne komórek roślinnych. Mikrorozmnażanie in vitro – metody, specyfika i wykorzystanie w leśnictwie. Biotechnologiczne doskonalenie roślin. GENETYKA Z BIOTECHNOLOGIĄ (ECTS: 3) • Egzamin • Zaliczanie ćwiczeń Literatura: 1. 2. 3. 4. Samborska-Ciania A., Przyborowski J. – Materiały do ćwiczeń z genetyki. Wydawnictwo UWM w Olsztynie, 2006. Genetyka molekularna. Praca zbiorowa pod redakcją P. Węgleńskiego. PWN W-wa, wyd. 6, 2006. Winter P.C., Hickey G.I., Fletcher H.L. – Krótkie wykłady. Genetyka. Wydawnictwo Naukowe PWN Wwa, wyd. 2, 2005. Biotechnologia roślin. Praca zbiorowa pod red. S. Malepszego. Wydawnictwo Naukowe PWN W-wa, 2005. Literatura (cd.): 5. 6. 7. 8. Gajewski W. – Genetyka ogólna i molekularna. Wyd. VI, PWN W-wa, 1987. Hames B.D., Hooper N.M. – Krótkie wykłady.Biochemia. Wydawnictwo Naukowe PWN W-wa, wyd. 2, 2006. Berg P., Singer M. – Język genów. Prószyński i Spółka, 1997. Brown T.A. – Genomy. Wydawnictwo Naukowe PWN W-wa, 2009. Czym jest genetyka? Genetyka jest jedną z podstawowych nauk biologicznych badającą zagadnienia zmienności i dziedziczności u organizmów żywych. Zmienność organizmów Zmienność genetyczna Dziedziczność Dziedziczność 1. Prawa ustanawiane przez genetyków mają charakter uniwersalny i w równym stopniu odnoszą się do roślin, zwierząt i ludzi. 2. Uniwersalność genetyki wynika z jedności materiału genetycznego i jednakowych zasad kodowania. 3. Poszczególne gatunki różnią się jedynie zasobem posiadanej informacji oraz aparatem służącym do jej odczytywania i realizacji. Badania prowadzone przez genetyków wykonywane są na organizmach z wszystkich grup, a uzyskiwane wyniki znajdują zastosowanie w tak różnych dziedzinach życia jak rolnictwo, medycyna czy biotechnologia. Kwasy nukleinowe to związki polimeryczne zbudowane z monomerów zwanych nukleotydami Nukleotyd – monomer kwasów nukleinowych, składający się z: • reszty kwasu ortofosforowego, • cząsteczki pentozy, • jednej z organicznych zasad azotowych. Figure 1.4a Genomes 3 (© Garland Science 2007) Organiczne azotowe Nucleic zasady Acid Bases Adenina Guanina Puryny Cytozyna Tymina Pirymidyny Uracyl Wiązanie N-glikozydowe Wiązanie fosfodiestrowe Figure 1.5 Genomes 3 (© Garland Science 2007) Reguła komplementarności zasad – puryna w jednej nici łączy się za pośrednictwem wiązań wodorowych z pirymidyną w drugiej nici, przy czym zawsze adenina z tyminą oraz guanina z cytozyną. Wiązania wodorowe: A G T C stosunek A do T oraz stosunek C do G wynosi 1:1 Reguła polarności (biegunowości) – nici tworzące podwójny heliks biegną w przeciwnym kierunku, jedna od 5` do 3`końca deoksyrybozy, druga zaś od 3` do 5` końca deoksyrybozy. Figure 1.8a Genomes 3 (© Garland Science 2007) Podwójna helisa opisana przez Watsona i Crick`a jest formą B. DNA w komórce występuje głównie w formie B Inne formy DNA w komórce powstają dzięki elastyczności nukleotydów, która pozwala przybierać ich cząsteczkom różne kształty. Dlaczego? Cechy różnych form podwójnej helisy DNA Cecha Konformacja B-DNA Typ helisy Średnica helisy (nm) Przyrost długości helisy na parę zasad (nm) Skok helisy (nm) Liczba zasad na skręt A-DNA Z-DNA Prawoskrętna 2,37 0,34 Prawoskrętna 2,55 0,29 Lewoskrętna 1,84 0,37 3,4 10 3,2 11 4,5 12 Figure 1.9 Genomes 3 (© Garland Science 2007) DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: – zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA – zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji nukleotydów Dlaczego to DNA jest substancją zawierającą informację genetyczną? • Różnorodna kolejność występowania czterech różnych nukleotydów stwarza nieograniczone możliwości kodowania informacji genetycznej; • Informacja genetyczna występuje w postaci różnych sekwencji zasad w różnych odcinkach DNA odpowiadających pojedynczym genom; Przykład Jeśli założymy, że cząsteczka DNA jakiegoś organizmu składa się z 106 par nukleotydów, to ilość różnych sekwencji, które mogą wystąpić w tej cząsteczce DNA jest róna 4 10(6) Dlaczego DNA jest substancją przekazującą informację genetyczną? • Podwójna struktura heliksu DNA umożliwia samopowielanie DNA (replikację), a więc również informacji w nim zawartej. • Każdy z komplementarnych łańcuchów tworzy matrycę (wzorzec), na której może być odtworzony drugi komplementarny łańcuch DNA.