METODY HODOWLANE METODY HODOWLANE - zagadnienia 1. Matematyczne podstawy metod hodowlanych 2. Wartość cechy ilościowej i definicje parametrów genetycznych 3. Metody szacowania parametrów genetycznych 4. Wartość hodowlana cechy ilościowej (ocena wartości hodowlanej na podstawie różnych źródeł informacji, porównanie ich dokładności) 5. Indeks selekcyjny (łączenie źródeł informacji o wartości hodowlanej) 6. Eliminacja wpływów środowiska w ocenie wartości hodowlanej (metody równoczesnego porównania, metoda BLUP) 7. Selekcja i postęp hodowlany SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY METODY HODOWLANE: I. SZACOWANIE PARAMETRÓW GENETYCZNYCH II. OCENA WARTOŚCI HODOWLANEJ III. SELEKCJA Selekcja – wybór najlepszych genetycznie zwierząt na rodziców następnych pokoleń hodowlanych. ?!?! SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Selekcja – wybór najlepszych genetycznie zwierząt na rodziców. Inaczej: jest to podział populacji na dwie części, z których tylko jednej umożliwia się pozostawienie potomstwa (przeznaczonego do dalszej hodowli) Rodzaje selekcji – jest ich wiele, według różnych kryteriów. Np. ze względu na efekt może być selekcja rozdzielcza, dośrodkowa (stabilizujaca), kierunkowa SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Rodzaje selekcji: Ze względu na efekt: rozdzielcza, dośrodkowa (stabilizujaca), kierunkowa Ze względu na wielkość jednostki selekcyjnej: indywidualna, rodzinowa Ze względu na rodzaj reakcji na selekcję: bezpośrednia, pośrednia Ze względu na liczbę cech doskonalonych: na jedną lub kilka cech Ze względu na liczbę decyzji: jednostopniowa, wielostopniowa. SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Jak określić, czy selekcja jest skuteczna? Miarą wielkości reakcji populacji na selekcję jest POSTĘP HODOWLANY G G1 G0 Go Gm G G0 Gm G0 I o I m G0 o 2 2 2 2 gdzie G – średnia wartość hodowlana, w zależności od wskaźnika: 1 – pokolenia potomnego, 0 – pokolenia rodzicielskiego, o – wybranych ojców, m – wybranych matek. Wielkości Io = Go – G0 oraz Im = Gm – G0 pokazują genetyczną przewagę wybranych ojców i matek nad pokoleniem 0. Io oraz Im nazywamy genetycznymi różnicami selekcyjnymi SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Postęp hodowlany G G1 G0 Io I m 2 Ten wzór pokazuje, jaki postęp hodowlany dokonuje się w ciągu jednego pokolenia (między pokoleniem rodzicielskim 0 a potomnym 1). Czy „pokolenie” to precyzyjna jednostka czasu? Lepiej obliczać postęp hodowlany na 1 rok G G ' T gdzie T – odstęp pokoleń (średni wiek wybranych rodziców w momencie urodzenia się potomka hodowlanego) A zatem Io Im T Tm G ' , bo T o To Tm 2 SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Postęp hodowlany na 1 pokolenie i na 1 rok Io Im G 2 Io Im G ' To Tm Dotąd rozpatrywaliśmy dwie drogi przekazywania postępu: przez ojców (Io) i przez matki (Im). W populacjach zwierzą hodowlanych wewnątrz tych dróg rozróżnia się dodatkowe: do synów (w przyszłości kolejnych ojców) i do córek (w przyszłości matek), mamy więc cztery drogi Drogi przekazywania wyższości genetycznej z pokolenia na pokolenie nazywamy ścieżkami selekcyjnymi W programach hodowlanych można wyróżnić też więcej niż cztery ścieżki selekcyjne SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Podstawowe ścieżki selekcyjne w hodowli bydła mlecznego Pokolenie wyjściowe P0 BUHAJE KROWY Wybrani rodzice Ojcowie buhajów Ojcowie krów Matki buhajów Matki krów Genetyczna Średni wiek w wyższość chwili wybranych urodzenia rodziców nad P0 potomka IBB Pokolenie następne P1 TBB Buhaje IBK TBK IKB TKB Krowy IKK TKK SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Pokolenie wyjściowe P0 BUHAJE KROWY Wybrani rodzice Ojcowie buhajów Ojcowie krów Matki buhajów Matki krów Genetyczna Średni wiek w wyższość chwili wybranych urodzenia rodziców nad P0 potomka IBB Pokolenie następne P1 TBB Buhaje IBK TBK IKB TKB Krowy IKK TKK Postęp hodowlany przekazywany jest czterema ścieżkami selekcyjnymi: I BB I BK I KB I KK G ' TBB TBK TKB TKK SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Pokolenie wyjściowe P0 BUHAJE KROWY Wybrani rodzice Ojcowie buhajów Ojcowie krów Matki buhajów Matki krów Genetyczna Średni wiek w wyższość chwili wybranych urodzenia rodziców nad P0 potomka IBB TBB Pokolenie następne P1 46% Buhaje IBK TBK 24% IKB TKB 24% Krowy IKK TKK 6% W hodowli bydła największy udział w przekazywaniu postępu hodowlanego mają ścieżki „męskie”! Wynika to głównie z możliwości bardzo ostrej (intensywnej) selekcji samców (przykładowe dane procentowe wzięto z pracy Skjervolda, 1963) SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY A jak obliczyć przewagę genetyczną na ścieżkach selekcyjnych, czyli te wszystkie Io, Im lub wręcz IBB, IBK, IKB i IKK? Czyli: jak oszacować postęp hodowlany? Czyżby znowu równanie regresji?! BINGO!!! Io Im G G1 G0 2 SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Równanie regresji Gr Gr G0 b( Pr P0 ) pokazuje związek genetycznej wyższości zwierząt wybranych na rodziców i ich przewagi fenotypowej* nad pokoleniem 0. Symbol Gr zastępuje tu np. Io czy Im - jest uogólnieniem (r od „rodzic”). Gr b( Pr P0 ) * Dokładniej – przewagi fenotypowej źródła informacji o G rodzica; wiadomo, że czasem trudno o wydajność własną… Zwłaszcza u buhajów ras mlecznych… SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Żeby wykorzystać wzór Gr b( Pr P0 ) trzeba znać wydajności zwierząt wybranych na rodziców (lub ich krewnych). Znamy je przed dokonaniem wyboru, więc obliczenia dadzą nam postęp hodowlany, jakiego jeszcze nie ma, jakiego się spodziewamy. Oceniamy zatem oczekiwany postęp hodowlany Coś jeszcze trzeba znać, żeby wykorzystać ten wzór… …be? MUUU!!! SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY We wzorze Gr b( Pr P0 ) b oznacza współczynnik regresji wartości hodowlanej na wartość fenotypową, który ma znaną (por. ocena wartości hodowlanej) postać: G b R P gdzie R to dokładność oceny Stąd mamy: Pr P0 Gr R G P SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Oczekiwany postęp hodowlany Pr P0 Gr R G P Pr P0 S Pr P0 s P różnica selekcyjna („zwykła”) standaryzowana różnica selekcyjna Standaryzacja zmiennej losowej X (x – zmienna standaryzowana) X x S, s – informują o intensywności selekcji (im większa różnica, tym ostrzejsza selekcja) ?!?! SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Gr R Pr P0 G P s Pr P0 P Gr R s G Gr = dokładność x intensywność x zmienność genetyczna Czyli jak cokolwiek zwiększymy to mamy większy postęp?! Niestety, zmienność jest jaka jest, a R i s się nie lubią, antagonistki jedne! „Albo ja albo ona!” Trzeba się nieraz nakombinować… Jak koń pod górę… Koń? Gdzie? SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Oczekiwany postęp hodowlany Gr R s G Według tego wzoru szacuje się oczekiwany postęp hodowlany na poszczególnych ścieżkach selekcyjnych, np. wartości Io, Im I o Ro so G I m Rm sm G a następnie – oczekiwany postęp hodowlany w całej populacji: Io Im G ' To Tm SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Oczekiwany postęp hodowlany Gr R s G Wartość s związana jest z progiem selekcyjnym x (mówi się też: punkt brakowania, miejsce podziału populacji na część wybraną i nie), oraz frakcją wybranych zwierząt p (np. jeśli do hodowli pozostawiamy połowę populacji, to p = 50% = 0,5). f ( x) s p gdzie f(x) określa prawdopodobieństwo dla wartości x w populacji Odpowiadające sobie wartości s, x, p odczytuje się z tablic matematycznych (wynikają z rozkładu normalnego cechy). SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Selekcja jednej z cech genetycznie skorelowanych zmienia również poziom drugiej cechy – to tzw. reakcja skorelowana Selekcja wykorzystująca reakcję skorelowaną to selekcja pośrednia Przykład: cechy X i Y są skorelowane; kryterium selekcji jest pojedyncza wydajność cechy X u osobnika Selekcja bezpośrednia G X h X s G X Selekcja pośrednia GY / X RY / X s GY RY / X ??? bo R hX SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Selekcja bezpośrednia Selekcja pośrednia G X h X s G X GY / X RY / X s GY rG GX R hX GY hX PX hY PY RY / X rG XY hX SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Selekcja pośrednia GY / X rG XY hX s GY GY hY Y GY / X rG XY hX s hY Y Czy selekcja pośrednia może dać lepszy efekt niż bezpośrednia? Tak, jeżeli: na 1 pokolenie GY / X h rG XY X 1 GY hY na 1 rok G 'Y / X GY / X TY 1 G 'Y GY TY / X Słowem: jeśli istnieje wysoka korelacja, duża różnica odziedziczalności, a także gdy selekcja pośrednia skraca odstęp pokoleń (wybierane są młodsze zwierzęta niż w bezpośredniej) SELEKCJA I POSTĘP HODOWLANY Podsumowanie: Selekcja to wybór zwierząt na rodziców następnych pokoleń hodowlanych Selekcja będzie skuteczna jeśli spowoduje postęp hodowlany Wielkość postępu hodowlanego zależy od dokładności oceny wartości hodowlanej, intensywności selekcji i zmienności genetycznej cechy Znając te wielkości można oszacować oczekiwany postęp hodowlany W selekcji można wykorzystać skorelowanie cech