CV - Instytut Genetyki Roślin

CV
dr Delfina Popiel
E-mail: [email protected]
Telefon: (+48 61) 65 50 290/217
Zakład Genetyki Patogenów i Odporności Roślin
Zespół Ewolucji Funkcji Systemów Biologicznych
Specjalizacja: biologia molekularna, fitopatologia molekularna, mykologia
Profil badawczy
Celem badań jest poznanie molekularnych mechanizmów powstawania oporności na
substancje fungicydowe u grzybów patogenicznych oraz zbadanie ewolucyjnych powiązań w
obrębie trzech najważniejszych mechanizmów odporności: mutacji w obrębie sekwencji
kodującej białka docelowe, nadekspresji genów kodujących białka docelowe oraz adaptacji
białek transportujących w kierunku zwiększonego powinowactwa do substancji o działaniu
przeciwgrzybiczym. Na podstawie przeprowadzonych badań planowane jest stworzenie
narzędzia diagnostycznego umożliwiającego szybką, dokładną i bezpieczną analizę
odporności patogenów zbożowych na stosowane środki ochrony roślin, składającego się z
zestawu szczegółowych procedur PCR, oraz qRT-PCR. Celem badań jest także
wyodrębnienie mechanizmów i sygnałów molekularnych (min. metabolity wtórne)
towarzyszących komunikacji pomiędzy grzybami patogenicznymi, roślinami i gatunkami
współwystępującymi z nimi w środowisku naturalnym (jako konkurenci lub antagoniści).
Metody







Analizy morfologiczne grzybów patogenicznych oraz testowanie ich podatności na
toksyny egzo- i engogenne.
Projektowanie starterów do PCR i RT-qPCR.
Analizy polimorfizmu DNA (PCR).
Analiza ekspresji genów (RT-qPCR).
Sekwencjonowanie produktów PCR.
Sekwencjonowanie nowej generacji (Illumina/Solexa).
Analizy chemiczne (HPLC).
Projekty badawcze krajowe i międzynarodowe

KBN
Nr projektu: KBN – 112/P06/2005
Tytuł projektu: Mikroorganizmy i związki naturalnego pochodzenia potencjalnie przydatne w
uprawie roślin oraz mechanizmy ich działania w zakresie „Mikroorganizmy jako biopestycydy
dla ochrony pszenicy przed infekcją patogenami Fusarium i akumulacja mikotoksyn w
ziarniakach”
Kierownik projektu: J. Chełkowski
Wykonawca: D. Popiel
Okres realizacji: 29.XI.2005 – 29.XI.2008

NCN
Nr projektu: UMO-2121/B/P01/2009/37
Tytuł projektu: Zastosowanie grzybów Trichoderma i Gliocladium
toksynotwórczych patogenów z rodzaju Fusarium
Kierownik projektu: J. Chełkowski
Wykonawca: D. Popiel
Okres realizacji: 04.08.2009 – 03.08.2010
do zwalczania
Nr projektu: N N310 203037
Tytuł projektu: Charakterystyka izolatów grzybów z rodzaju Trichoderma i Clonostachys o
zdolnościach do rozkładu mikotoksyn fuzaryjnych.
Kierownik projektu: L. Błaszczyk
Wykonawca: D.Popiel
Okres realizacji: 01.09. 2009 -30.08.2012
Nr projektu: UMO-2011/03/D/NZ2/01435
Tytuł projektu: Stworzenie hybrydowej, bazującej na metagenomie metodyki oceny
różnorodności biologicznej i potencjału toksykogenicznego grzybów środowisk
antropogenicznych
Kierownik projektu: G. Koczyk
Wykonawca: D. Popiel
Podtyp: SONATA
Okres realizacji: 14.08.2012 - 13.08.2015
Nr projektu: UMO-2011/03/D/NZ9/02061
Tytuł projektu: Molekularne mechanizmy powstawania oporności
syntetyczne substancje fungicydowe u grzybów rodzaju Fusarium
Kierownik projektu: D. Popiel
Podtyp: SONATA
Okres realizacji: 14.08.2012 - 13.08.2015
wielolekowej
na
 NCBiR
Nr projektu: LIDER/19/113/L-1/09/NCBiR/2010
Tytuł projektu: Modelowanie, przewidywanie i weryfikacja zdolności grzybów do akumulacji
toksyn
Kierownik projektu: G. Koczyk
Wykonawca: D. Popiel
Okres realizacji: 1.07.2010-30.06.2013
Nr projektu: LIDER/27/204/L-3/11/NCBR/2012
Tytuł projektu: Diagnostyka molekularna odporności grzybów patogenicznych na substancje
fungicydowe
Kierownik projektu: D. Popiel
Okres realizacji: 1.01.2013-31.12.2015
Publikacje:
Błaszczyk L., Popiel D., Chełkowski J., Koczyk G., Samuels GJ., Sobieralski K., Siwulski M.
(2011). Species diversity of Trichoderma in Poland. J Appl Genet. 52: 233-243.
Gromadzka K., Chelkowski J., Popiel D., Kachlicki P., Kostecki M., Goliński P. (2009). Solid
substrate bioassay to evaluate the effect of Trichoderma and Clonostachys on the production
of zearalenone by Fusarium species. World Mycotoxin J. 2: 45-52.
Stępień Ł., Popiel D., Koczyk G., Chełkowski J. (2008). Wheat-infecting Fusarium species in
Poland–their chemotypes and frequencies revealed by PCR assay. J Appl Genet 49: 433–
441.
Buśko M., Chełkowski J., Popiel D., Perkowski J. (2008). Solid substrate bioassay to
evaluate impact of Trichoderma on trichothecene mycotoxin production by Fusarium. J Sci
Food Agric 88: 533-541.
Gromadzka K., Buśko M., Wśkiewicz A., Kostecki M., Chełkowski J., Popiel D. (2008).
Impact of Trichoderma and Gliocladium on Fusarium mycotoksins production in solid
substrate. 3rd Int. FHB Symposium, Szeged, Hungary. Cer Res Comm 36B: 707-710.
Popiel D., Kwaśna H., Chełkowski J., Stępień Ł., Laskowska M. (2008). Impact of selected
antagonistic fungi on Fusarium species – toxigenic cereal pathogens. Acta Mycol 43: 29-40.
Nagrody i odznaczenia
Stypendium UAM za wyniki w nauce w roku 2008/09 otrzymane na rok akademicki 2009-10
Stypendium Rektora UAM za wyniki w nauce w roku 2008/09 otrzymane na rok akademicki
2009-10