Baza danych KSIB
advertisement
Baza danych KSIB w Krajowym Centrum Roślinnych Zasobów Genowych Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie Krajowe Centrum Roślinnych Zasobów Genowych Zadania • Gromadzenie zasobów genowych • Kolekcje hodowców • Ekspedycje pozyskujące odmiany lokalne • Ekspedycje poszukujące dzikich ekotypów • Przechowywanie długoterminowe • Dokumentacja zasobów genowych Baza KSIB w KCRZG IHAR rozwiązania techniczne Internet GBIF Koszt postawienia serwera KSIB z oprogramowaniem testowym (90 dniowym) wyniósł 0 zł. Finansowanie z programu KSIB pozwoliło na postawienie nowego serwera z Win2003 SBS Premium router LAN IHAR Serwer internetowy ihar.edu.pl Linux Serwer KSIB/GBIF gbif.ihar.edu.pl Procesor K2/333 DiGIRProvider Win2000Server MS SQL Baza KSIB Serwer KCRZG Novell FoxPro Bazy KCRZG Baza KSIB w KCRZG oprogramowanie do obsługi baz danych Global Biodiversity Information Facility Bazy KCRZG Bazy KCRZG Baza KSIB DiGIRProvider Baza pośrednia MS SQL Program DiGIRProvider zapewnia łączność pomiędzy bazą KSIB oraz dokonuje odwzorowania pól bazy KSIB do standardu DarwinCore Bazy KCRZG FoxPro Baza KSIB w KCRZG odwzorowanie pól bazy KSIB do standardu DarwinCore w interface DiGIRProvider Standard DarwinCore DateLastModified InstitutionCode CollectionCode CatalogNumber ScientificName BasisOfRecord Kingdom Phylum DiGIRProvider MS SQL <<<<<<<<- DateLastMo Institutio Collection CatalogNum Scientific BasisOfRec Kingdom Phylum Baza KSIB MS SQL akceptuje 10 znakowe nazwy, DiGIR odwzorowuje je na dłuższe nazwy DarwinCore Baza KSIB w KCRZG odwzorowanie pól bazy KSIB do standardu DarwinCore w interface DiGIRProvider Standard DarwinCore Class Order Family Genus Species SubSpecies Country Notes DiGIRProvider MS SQL <– <<<<<<<- Class bioOrder Family Genus Species SubSpecies Country Notes Baza KSIB Słowo „order” jest słowem zastrzeżonym w MS SQL – można je zastąpić innym, a za pomocą DiGIR’a odwzorować je na nazwę „Order” Powstanie bazy KSIB Baza KSIB powstała poprzez transfer i przekształcenie części danych z baz KCRZG Zboża, Trawy Baza KSIB DiGIRProvider Baza KSIB Bazy KCRZG Bazy KCRZG Bazy planowane do transferu w drugim etapie Bazy danych KCRZG Bobik Bób Burak Chmiel Ekspedycje Groch Gryka Herbarium Kukurydza Len Proso Rzepak Seradela Topinambur Trzciny Trawy Tytoń Warzywa Winogrona Zboża Ziemniak Zioła Bazy KCRZG przetransferowane do bazy KSIB Na następnych slajdach opis transferu bazy „Zboża” do bazy KSIB Bazy KCRZG Baza „Zboża” w KCRZG dane paszportowe wykorzystane w KSIB Tablice bazy „Zboża” zboża.dbf Relacja przez pole BOT gatunki.dbf Lista pól w tablicy GRUP, KOL, NUMINT, NUM, PL, NOR, AVA, NAZ, ROD, PRO, LOC, E_LATT, E_LONG, E_ALTIT, GAT, BOT, FORMA_BOT, DAT, KRP, TYP, TYP1, NRD, KRD, DONOR, INR, INR2, HOD, ODA, CH, RDZ, NOTES, OBS, RRO, HER, PRZ, PLL, ROZ, GAP, RRP, HAB, ZMIANA BOT, KodRdz, GENUS, GATUNEK, SUBSP, VARIETAS, FORMA, OPIS Relacja przez pole KodRdz TabBot.dbf KodRdz, BotKin, BotPhy, BotCla, BotOrd, BotFam Baza KSIB Kolorem pomarańczowym wyróżnione pola przeniesione do bazy KSIB Bazy KCRZG Baza „Zboża” w KCRZG dane paszportowe wykorzystane w KSIB Pole AVA zostało użyte do przesłania do bazy KSIB jedynie danych o obiektach dla których są dostępne nasiona MS SQL CatalogNum Kingdom Phylum Class bioOrder Family Genus Species FoxPro <<<<– <<<<- PL BotKin BotPhy BotCla BotOrd BotFam GENUS GATUNEK Baza KSIB Pole PL zawiera unikalny, w ramach banku genów, numer obiektu Bazy KCRZG Baza „Zboża” w KCRZG dane paszportowe wykorzystane w KSIB MS SQL Przypisanie wszystkim rekordom wartości „G” oznacza, że wszystkie obiekty są przechowywane w postaci nasion. Subspecies Notes Country DateLastMo Institutio BasisOfRec Collection FoxPro <<<<<<<- SUBSP NAZ KRP ZMIANA ‘IHAR‘ ‘G‘ ‘POLIHAR‘ Pole NAZ zawierające nazwę obiektu, najczęściej nazwę odmiany, rodu lub nazwę zwyczajową, zostało przypisane polu NOTES, gdyż w standardzie DarwinCore brakowało odpowiedniego pola Na następnych slajdach opis zawartości bazy KSIB Baza KSIB Bazy KCRZG Baza KSIB w KCRZG zróżnicowanie pod względem botanicznym Rodzina: Poacea - 40 459 obiektów - w tym rodzaje: (reprezentowane przez mniej niż 10 obiektów) Agropyron Alopecurus Andropogon Arrhenatherum Avenula Boissiera Calamagrostis Calamovilfa Cenchrus Desmazeria Digitaria Echinaria Echinochloa Eleusine Elymus Elytrigia Eragrostis Gastridium Hystrix Melica Monerma Baza KSIB Muehlenbergia Nardurus Nardus Phalaris Polypogon Psatyrostachys Puccinellia Sorghastrum Trisetum Vulpia Baza KSIB w KCRZG zróżnicowanie pod względem botanicznym Rodzina: Poacea - 40 459 obiektów - w tym rodzaje: (reprezentowane przez więcej niż 10 obiektów) Aegilops Agrostis Avena 2 Bromus Cynosurus Dactylis 5 Deschampsia Festuca 4 Hordeum 6 314 53 337 119 28 691 61 612 233 Koeleria Lolium 2 Panicum Phleum 2 Poa 1 Secale 2 Setaria Triticum 11 32 574 369 460 639 324 92 454 Na następnych slajdach opis zróżnicowania rodzaju Titicum Baza KSIB Baza KSIB w KCRZG zróżnicowanie pod względem botanicznym Rodzaj: Triticum, gatunki: Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum aestivum L. 8064 Zachowywanie nazw aethiopicum Jakubz. gatunkowych w postaci 36 araraticum Jakubz. 4 użytej przez dawcę nasion, prowadzi do boeoticum Boiss. 19 pojawiania się carthlicum Nevski 1 synonimów. compactum Host 17 dicoccoides (Koern.exAh.etGrae)Schweinf 7 dicoccon Schrank 1 dicoccum (Schrank) Schuebl. 44 durum Desf. 1824 karamyschevii Nevski 1 kiharae Dorof. et Migusch. 1 Baza KSIB Baza KSIB w KCRZG zróżnicowanie pod względem botanicznym Rodzaj: Triticum, gatunki: Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum Triticum macha Dekapr. et Menabde militinae Zhuk. et Migush. monococcum L. persicum Vav. polonicum L. sp. spelta L. sphaerococcum Perciv. timopheevii (Zhuk.) Zhuk. turgidum L. vavilovii (Thum.) Jakubz Baza KSIB 6 2 19 13 13 1262 61 5 19 34 1 Baza KSIB w KCRZG zróżnicowanie pod względem botanicznym Gatunek: Triticum monococcum L. Varietas l. obiektów HORNEMANNII (Clem.) Koern. 3 Lista numerów id. próbki nasion 22861, 5007, 5040 Każdemu numerowi odpowiada w przechowalni jeden pojemnik z nasionami. MACEDONICUM Papag. 1 22860 NIGRICULTUM Flaksb. 1 5005 VULGARE Koern. 3 24067, 24068, 5006 - 10 20790, 21011, 21986, 21985, 21031, 1195, 5003, 5004, 24376, 20751 Jeśli w wyniku dystrybucji liczba nasion danego obiektu spada poniżej określonego minimum to są one wysiewane na poletkach rozmnożeniowych. Baza KSIB Dziękują za uwagę Wiesław Podyma Paweł Kolasiński Dorota Nowosielska Pszenica samopsza (Triticum monococcum)
