Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii

Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r.
Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc
KIEROWNIK:
dr hab. n. med. Joanna Chorostowska-Wynimko, prof. nadzw. IGiCHP
Sekretariat:
tel. 022.43.12.158
fax. 022.43.12.358
e-mail: [email protected]
Laboratorium:
tel. 022.43.12.105
Badanie
Osoba kontaktowa
Telefon
Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych
mgr Aneta Stępniewska, tech. analit. Beata Szumna
22.43.12.105
α1-antytrypsyna (A1AT) – stężenie, określenie fenotypu/genotypu
mgr inż. Radosław Struniawski, mgr Agata Giżycka
22.43.12.158
ACE - Aktywność enzymu konwertującego angiotensynę
tech. analit. Beata Szumna, dr n. med. Adriana Roży,
22.43.12.105
Diagnostyka molekularna raka płuca
dr n. med. Michał Skroński, mgr inż. Paulina Jaguś
22.43.12. 256
Diagnostyka infekcji wirusowych układu oddechowego oraz pneumocystozy (PCP)
mgr inż. Paulina Jaguś, dr n. med. Adam Szpechciński,
dr n. med. Adriana Roży, tech. analit. Beata Szumna
22.43.12.105
Materiały biologiczny na badania:
 Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych,
 Wykrywanie obecności antygenów siedmiu wirusów oddechowych met. immunofluorescencji pośredniej,
 Oznaczanie antygenu pp65 wirusa cytomegalii (CMV) met. immunofluorescencji pośredniej
przyjmowane są od poniedziałku do piątku w godz.8:00 – 12:00, badania wykonywane tylko w dniu pobrania materiału.
Materiały biologiczny na pozostałe badania przyjmowane są od poniedziałku do piątku, w godzinach 8.00 -15.00
Str. 1 z 3
Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r.
l.p.
Badanie
Materiał
Metoda
Zakres biologicznych wartości referencyjnych:
Całkowita liczba komórek [x106]
1
2
Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn
oskrzelowo-pęcherzykowych
Aktywność enzymu konwertującego angiotensynę ACE
l.p.
Badanie
płyn z BAL
surowica
Manualna
Cytometria
przepływowa
kinetyczna
Materiał
Makrofagi [%]
Limfocyty [%]
Granulocyty obojętnochłonne [%]
Granulocyty kwasochłonne [%]
Stosunek odsetka limfocytów
CD4+/CD8+
Osoby zdrowe
niepalące
palące
< 20
< 10
> 80
< 15
<3
< 0,5
1,5- 2,5
> 90
< 10
<3
< 0,5
0,51,5
dla dorosłych: 8 – 52 U/l surowica
Metoda
Wynik
Zakres biologicznych
wartości referencyjnych
do 5 dni
roboczych
do 5 dni
roboczych
Wynik
alfa1 – Antytrypsyna (A1AT)
3
Stężenie alfa1-antytrypsyny
surowica
Nefelometryczna
4
Diagnostyka wrodzonego niedoboru alfa1- antytrypsyny
(fenotypowanie/genotypowanie)
krew żylna EDTA
Ogniskowanie izoelektryczne
Real time PCR/
sekwencjonowanie
dla dorosłych: 88 – 183 mg/dl
do 5 dni roboczych
Wynik opisowy
do 21 dni roboczych
Wynik opisowy
do 10 dni roboczych
Diagnostyka molekularna raka płuca
5
6
Mutacje w genie EGFR
Rearanżacja genu ALK
tkanki i komórki
FFPE , rozmazy
komórkowe
tkanki i komórki
FFPE
Allelospecyficzny Real-time PCR/
sekwencjonowanie
FISH (Fluorescencyjna
hybrydyzacja in situ)
Str. 2 z 3
Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r.
l.p.
Badanie
Materiał
Zakres biologicznych
wartości
referencyjnych
Metoda
Wynik
Diagnostyka infekcji wirusowych układu oddechowego oraz pneumocystozy (PCP)
Wykrywanie obecności antygenów siedmiu wirusów
7
oddechowych: wirusa grypy typ A i typu B; wirusa para grypy typu 1,
wymaz z gardła
Immunofluorescencja
pośrednia
Wynik opisowy
wymaz z gardła
Real time PCR
Wynik opisowy
wymaz z gardła,
wymaz z nosogardła
Real time PCR
Wynik opisowy
2, 3; syncytialnego wirusa oddechowego, adenowirusa.
8
Wykrywanie i identyfikacja wirusa grypy typu A i podtypu AH1N1
oraz grypy typu B
Wykrywanie i identyfikacja 21 patogenów oddechowych:
Adenowirus (HAdV), Bokawirus (HBoV), Koronawirus ( 229E, HKU1,
NL63, OC43), Ludzki metapneumowirus (HMPV), Wirus grypy typu
9
A (podtyp: H1, H3, 2009 H1), Wirus grypy typuB; Wirus paragrypy
typu 1, 2, 3, 4; Enterowirus, Rinowirus (HRV), Syncytialny wirus
oddechowy (RSV) oraz Bordetella pertussis, Chlamydophila
w dniu dostarczenia
materiału do ZGiIK
lub następnym dniu
roboczym
pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae.
10
CMV - Oznaczanie antygenu pp65 wirusa cytomegalii.
krew żylna EDTA
Immunofluorescencja
pośrednia
Wynik opisowy
11
CMV - Wykrywanie sekwencji genu kodującego białko ppUL83
(pp65) wirusa cytomegalii
osocze EDTA
płyn z BAL
mocz
płyn m-r
Real time PCR
Wynik opisowy
12
Wykrywanie obecności oocyst Pneumocystis jirovecii.
13
Wykrywanie obecności materiału genetycznego Pneumocystis
jirovecii.
płyn z BAL
plwocina
Immunofluorescencja
pośrednia
Wynik opisowy
Real time PCR
Str. 3 z 3