Biologia komórki

Załącznik nr 1
do zarządzenia Rektora nr 97/2012
SYLABUS (KARTA PRZEDMIOTU/MODUŁU)
Nazwa przedmiotu/modułu (zgodna z zatwierdzonym programem studiów na kierunku)
Punkty
ECTS
BIOLOGIA KOMÓRKI
Numer
katalogowy
5
Nazwa w j. angielskim
CELL BIOLOGY
Jednostka(i) realizująca(e) przedmiot/moduł (instytut/katedra)
Katedra Fizjologii i Biochemii Zwierząt / Wydział Medycyny Weterynaryjnej i Nauk o Zwierzętach
Kierownik przedmiotu/modułu
dr inż. Tatiana Wojciechowicz
Kierunek studiów
Poziom
Profil
Biologia
I stopień
ogólnoakademicki
Specjalność
Specjalizacja magisterska
Semestr
6
Biologia stosowana
RODZAJE ZAJĘĆ I ICH WYMIAR GODZINOWY
(zajęcia zorganizowane i praca własna studenta)
Forma studiów: stacjonarne
­ wykłady
­ ćwiczenia
­ inne z udziałem nauczyciela
razem
konsultacje
egzamin
­ praca własna studenta razem
przygotowanie do ćwiczeń i egzaminu
przygotowanie prezentacji
Łączna liczba godzin:
30
45
16
14
2
50
50
141
Forma studiów: niestacjonarne
­ wykłady
­ ćwiczenia …
­
­
­
­
­
­ praca
własna studenta
Łączna liczba godzin:
CEL PRZEDMIOTU/MODUŁU
Poznanie morfologii, budowy i funkcjonowania komórki na poziomie molekularnym oraz organelli subkomórkowych.
METODY DYDAKTYCZNE
Wykłady (z prezentacją multimedialną), ćwiczenia laboratoryjne (wykonywane indywidualnie i zespołowo
analizy struktur subkomórkowych i/lub całych komórek; analiza i opis przebiegu doświadczeń; interpretacja
wyników w formie pisemnego raportu)
Odniesienie
do efektów
kierunkowych
Odniesienie
do efektów
obszarowych
E1: Ma podstawową wiedzę na temat technik stosowanych w badaniach
z zakresu budowy i funkcjonowania komórki ze szczególnym
uwzględnieniem transportu komórkowego, sygnalizacji
wewnątrzkomórkowej oraz cyklu komórkowego
B1_W05
P1A_W01
P1A_W05
E2: Wykonuje
przedmiotem
B1_U05
B1_U13
P1A_U07
P1A_U04
P1A_U06
P1A_U02
P1A_U07
Kompetencje
Umiejętności
społeczne
Wiedza
EFEKTY KSZTAŁCENIA
proste
doświadczenia
tematyczne
związane
z
B1_U14
E3: Potrafi pracować w zespole
E4: Jest odpowiedzialny za bezpieczeństwo pracy własnej i innych
Metody weryfikacji efektów kształcenia
Dyskusja na ćwiczeniach laboratoryjnych; Ocena raportów; Kolokwia;
Zaliczenia ćwiczeń
Egzamin
B1_K02
B1_K05
P1A_K02
P1A_K06
Numery efektów
E1, E2, E3, E4
E1, E2
TREŚCI KSZTAŁCENIA
Treści programowe wykładów:
Filogeneza Eukaryota i Prokaryota. Funkcjonalna organizacja komórki –przedziały wewnątrzkomórkowe i organelle w
różnych typach komórek. Błony biologiczne komórek: skład biochemiczny, struktura przestrzenna, funkcje, rodzaje błon.
Połączenia międzykomórkowe. Transport pęcherzykowy i udział aparatu Golgiego w sekrecji białek, import białek. Jądro
komórkowe: skład macierzy jądrowej, organizacja chromatyny. Euchromatyna i heterochromatyna. Podziały komórek:
przebieg i etapy mitozy i mejozy (podział redukcyjny). Fazy cyklu komórkowego i regulacja przebiegu cyklu (kinazy Cdk,
cykliny, inhibitory cyklin). Elementy cytoszkieletu komórkowego (mikrotubule i centriole). Filamenty aktynowe, pośrednie
i miozynowe cytoszkieletu. Receptory błonowe i wewnątrzkomórkowe, klasyfikacja receptorów. Wtórne przekażniki:
lipidowe pochodne, jony wapnia, tlenek azotu, cAMP, cGMP. Degradacja substratów w komórce – lizosomy. Uszkodzenia
DNA i strategie naprawy. Starzenie się komórek i śmierć: programowana (apoptoza) i niefizjologiczna (nekroza). Cylozol –
skład biochemiczny i rola w metabolizmie komórki. Nowotworzenie – preinicjacja, inicjacja, promocja, inwersja, progresja.
Macierz zewnątrzkomórkowa – skład (białka strukturalne i fibrylarne oraz proteoglikany i gikozoaminoglikany).
Treści programowe ćwiczeń laboratoryjnych:
Poznanie techniki izolacji i inkubacji komórek jajnika szczura. Obserwacja żywych i martwych komórek jajnika w
trakcie liczenia z barwieniem błękitem trypanu z zastosowaniem komory do zliczania komórek Burkera. Wykazanie
wpływu folikulotropiny na sekrecję progesteronu przez badane komórki. Pomiar ilościowy progesteronu w inkubatach
komórkowych i zapoznanie się ze strategiami techniki immunoenzymatycznej ELISA. Poznanie techniki analizy ekspresji
metodą RT-PCR. Poznanie techniki izolacji RNA z izolowanych komórek, pomiar ilości wyizolowanego RNA oraz
określenie poziomu jego czystości. Oznaczenie ekspresji genu receptora leptyny w komórkach jajnika poprzez wykonanie
reakcji odwrotnej transkrypcji oraz PCR w czasie rzeczywistym - ddemonstracja. Frakcjonowanie komórki. Toretyczne
ustalanie parametrów wirowania - przeliczenia. Frakcjonowanie komórki metodą wirowania różnicowego. Analiza
homogenności preparatów. Wprowadzenie do ćwiczeń symulacyjnych. Izolacja i oczyszczanie białek - przegląd metod.
Izolacja rozpuszczalnych białek cytoplazmatycznych - zawiesina komórek. Solubilizacja białek błonowych - fragment
tkanki. Solubilizacja białek błon mitochondrialnych. Analiza ilościowa ekstraków - zgrubna analiza spektrofotometryczna,
porównanie metody wg. Lowry Bradforda. Oczyszczanie izolatów - dializa. Zagęszczanie ekstraktów białkowych.
Elektroforeza PAGE i elektrotransfer preparatów białkowych. Przygotowywanie żeli PAA. Rozdział elektroforetyczny
białek w żelu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących wg. Leamlli. Barwienie `Coomassie, archiwizacja i analiza
elektronogramów. Elektrotransfer rozdzielonych białek z żelu na membranę PVDF w układzie klasycznym i półsuchym.
Odwracalne barwienie membrany. Immunodetekcja specyficznego białka. Doświadczenie Slot-Blot - optymalizacja
rozcieńczenia Ab (wizualizacja kolorymetryczna). Doświadczenie Western-Blot (wizual. chemiluminescencyjna). Analiza
wyników.
Formy i kryteria zaliczenia przedmiotu/modułu
Część teoretyczna zaliczenia ćwiczeń (kolokwium) oraz egzamin
przeprowadzane są w formie pisemnej.
Zaliczenie (praktyczne i teoretyczne) ćwiczeń na ocenę pozytywną uprawnia do
przystąpienia do egzaminu.
Warunkiem zaliczenia przedmiotu jest zdanie egzaminu końcowego.
Procentowy udział w końcowej ocenie
100% EGZAMIN
WYKAZ LITERATURY
Podstawowa:
Podstawy biologii komórki, tom I i II, praca zbiorowa pod redakcją Bruce Alberts, PWN (2007, 2009)
Uzupełniająca:
Strukturalne podstawy biologii komórki, Wincenty Kilarski, PWN (2003)
Podstawy cytofizjologii, pod redakcją Jerzego Kawiaka, PWN (1998)
Podstawy molekularne biologii komórki, G. Fuller i D. Shields, PZWL (2005)