Zręby modelu dynamiki choroby o potencjale epidemicznym. Choroby zakaźne są następstwem zakażenia ustroju czynnikiem zakaźnym, co prowadzi do replikacji tego czynnika zakaźnego w ustroju z potencjalną możliwością szerzenia się czynnika i infekowania kolejnych organizmów. Lokalnie prawdopodobieństwo zakażenia zależy od indywidualnego stanu organizmu, ilości czynnika zakaźnego, powierzchni oddziaływania i czasu kontaktu z powierzchnią oddziaływania do czasu inaktywacji lub usunięcia czynnika zakaźnego. Ostatnie dwie wartości da się uznać za charakterystyczne dla danego patogenu i zamknąć jako wartość jednej zmiennej. Natomiast ilość czynnika zakaźnego da się opisać w warunkach naturalnych jako funkcję ilości organizmów w fazie zakaźnej i sekwestracji tych organizmów, przy założeniu, że czynnik zakaźny nie jest zdolny do życia w środowisku naturalnym nie infekując, lub przy absencji osobników z podklasy S. Modele stosowane w przeszłości to między innymi model Karmack – McKendrick, bazujący na układzie trzech równań różniczkowych, każde dla jednej podklasy organizmów: Susceptible, Infected, Recovered. ∂S Zmienna r nawiązuje do infekcyjności, ściśle jest multiplikacją =−rSI ∂t współczynnika sekwestracji i współczynnika infekcyjności, natomiast ∂I zmienna α odpowiada za zdrowienie i utworzenie puli Recovered. =rSI − I Współczynnik sekwestracji ∂t może być zależny od ∂R = I średniego natężenia ∂t objawów, ale również, w wypadku człowieka, od ilości chorych, ponieważ ilość miejsc w szpitalach jest ograniczona, a tam można liczyć na najwyższą sekwestrację. Przydatność tego modelu jest ograniczona do infekcji w populacji homogennej z zaniedbaniem rozmieszczenia przestrzennego i różnic przestrzennych. Jednak równania te daje się w prosty sposób rozpiąć na siatce Eulerowskiej. Należy umożliwić dyfuzję czynnika infekcyjnego, odzwierciedlającą losową migrację ∂S osobników, której współczynnik zależy od =−rS∗InA klasy i podklasy organizmu. Zmiana ∂t wartości współczynnika może zależeć od ∂I =rS∗InA− I objawów chorobowych, albo też w ∂t przypadku człowieka, od zaprzestania ∂R = I wykonywanej pracy lub hospitalizacji. Ten ∂t model umożliwia obserwację fali ∂ InA 2 =k∗I −decay InA∗InA−dyfuzja InA∗∇ InA wędrującej, tak charakterystycznej dla ∂t układów biologicznych m.in. migracji komórek zapalnych w procesach reparacyjnych. Alternatywnym sposobem bez wprowadzania czynnika infekcyjnego(InA) ∂ S =−rS∗InAcreation−decay Susceptible∗S do równań, jest użycie średniej ważonej ∂t ilości chorych (I) w sąsiadujących ze sobą ∂ I =rS∗InA− I −decay Infected∗I obszarach jako wartości I wyzwalającej ∂t zachorowanie w nowej komórce symulacji. ∂ R = I −decay Recovered ∗R Można to rozumieć jako wirtualne ∂t zachodzenie na siebie obszarów, gdzie ∂ InA współczynnik zachodzenia jest ściśle =k∗I −decay InA∗InA−dyfuzja InA∗∇ 2 InA ∂t związany z mobilnością osobników { { { zainfekowanych (I), jednak sama dyfuzja tych osobników nie zachodzi. Dalsze modyfikacje umożliwiają dodanie rozrodczości i śmiertelności w populacji, zwłaszcza, jeśli modelowana będzie infekcja na dużym obszarze dla populacji o szybkim obrocie (wysoka rozrodczość i krótki czas życia pojedynczego osobnika). W takiej konfiguracji w skomplikowanych warunkach brzegowych mogą powstać oscylatory w postaci fal wędrujących przypominające w istocie zjawisko re-entry. Ta forma zakłada, że odporność nie jest dziedziczona, co w rozumieniu pokolenia jest zawsze prawdą, z wyjątkiem krótkiego okresu po urodzeniu, gdy przeciwciała matczyne są transportowane aktywnie przez łożysko do krwi płodu, mając tam stężenie wyższe, niż we krwi matki i wydzielnicze IgA z mlekiem tworzą odporność błon śluzowych u niemowlęcia. W dłuższym okresie pojawia się odporność na drodze selekcji osobników wrażliwych, jeśli śmiertelność u ozdrowieńców i/lub chorych jest wyższa od populacyjnej. Zmienna creation, kryje za sobą jeden z możliwych modeli przyrostu populacji, najprostszym jest przyjęcie, że liczebność rośnie w tempie geometrycznym, innym jest modyfikacja zakładająca pojemność maksymalną środowiska, ustaloną w warunkach doświadczalnych. Wtedy populacja asymptotycznie będzie dążyć do pewnej stałej liczebności, nigdy jej nie osiągając. Dla modelowania rozprzestrzeniania chorób zakaźnych wśród ludzi w obszarach o niehomogennym rozkładzie (obszary wysoko zurbanizowane rozdzielone przestrzennie obszarami o niskiej gęstości zaludnienia), należy wziąć pod uwagę transport jako istotny czynnik pozadyfuzyjny mobilności osób chorych. Należy ustalić a priori pole prędkości jako funkcja czasu w cyklu dobowym i dodać czynnik adwekcyjny, albo też nanieść na symulację eulerowską, zwektoryzowaną sieć dróg. Na podstawie badań statystycznych policzyć współczynniki dyfuzji czynnika infekcyjnego, związane z kontaktem osób zainfekowanych z mieszkańcami podatnymi (S) tego obszaru uwzględniając stopień uczęszczania, na każdym z odcinków drogi. Zastosowanie powyższych powinno umożliwić przewidzenie z dużym prawdopodobieństwem dynamiki rozwoju choroby o potencjale epidemicznym lub pandemicznym w większości populacji, ze szczególnym naciskiem na człowieka jako gatunek. Jest to istotne ze względu na prewencję i odpowiedni podział środków finansowych na służbę zdrowia dla regionów najbardziej zagrożonych oraz podjęcie działań mających na celu powstrzymanie dalszego rozwoju infekcji.