ENDOREPLIKACJA endoreplikacja – zwielokrotnienie zawartości DNA poza typowym cyklem komórkowym w ogóle nie następuje wejście w mitozę po fazach G1, S i G2 lub następuje przedwczesne zakończenie mitozy; poziom DNA po każdym cyklu endoreplikacyjnym się zwiększa; liczba chromosomów się zwiększa lub nie gdy następuje powielenie całości DNA, mamy do czynienia z endomitozą (wtedy zwiększa się liczba chromosomów i następuje poliploidyzacja komórek) lub endoreduplikacją (wtedy liczba chromosomów się nie zwiększa, tylko liczba chromatyd chromosomów – powstają chromosmy politeniczne) gdy następuje powielenie części DNA, mamy do czynienia z wybiórczą replikacją – amplifikacją (wtedy powielone zostają tylko pewne geny; odbywa się zazwyczaj poza chromosomami) lub niepełną replikacją (wtedy niewielkie fragmenty DNA, zazwyczaj heterochromatynowe, nie zostają zreplikowane; powstają chromosomy politeniczne z fragmentami niedoreplikowanego DNA) endoreplikacja u roślin: zjawisko powszechne do tego stopnia, że trudno by było wskazać roślinę, u której jakieś komórki nie przeszłyby przez endoreplikację; endomitoza, endoreduplikacja i amplifikacja towarzyszą wczesnym stadiom rozwoju rośliny (lub jej organów), np. w komórkach włosków liści, miękiszu liści (zwłaszcza u sukulentów), epidermy liści, miękiszu kory pierwotnej, włośników, prekursorów naczyń; niepełna replikacja zachodzi w komórkach, których różnicowanie kończy się programowaną śmiercią komórkową, np. w komórkach wieszadełka, liścieni zarodka, bielma, ścian owocni, łożyska, zarodka w fazie kiełkowania korzyści z endoreplikacji dla roślin: powielenie genomu wydaje się bardziej ekonomicznym rozwiązaniem wzrostu rośliny (lub jej organu) niż intensyfikacja mitoz (endoreplikacja nie wymaga tak dużego zaangażowania związków wysokoenergetycznych, jakiego wymaga mitoza); do pewnego momentu powielenie DNA jest skorelowane ze wzrostem komórek i ich ilością – komórek jest mniej i są większe (ale tylko do tetra-, oktoploidii) endoreplikacja u zwierząt: wchodzą w nią nieliczne komórki, przede wszystkim organów zaangażowanych w sekrecję, związana z intensyfikacją metabolizmu (biologiczny sens endoreplikacji raczej nie polega na wzroście komórek, choć też jest z nim skorelowany); występuje np. u owadów w komórkach przetchlinek, cewek Malpighiego, ścian jelita, ślinianek (og. w gruczołach wydzielniczych), troficznych, follikularnych, oocytach; u ssaków w megakariocytach i trofoblastach endoreplikacja w cyklu komórkowym: jeżeli po replikacji do mitozy w ogóle nie dochodzi, zachodzi endoreduplikacja; jeżeli przedwczesne zakończenie mitozy następuje we wczesnej profazie, zachodzi endomitoza lub endoreduplikacja; jeżeli przedwczesne zakończenie mitozy następuje we wczesnej anafazie, zachodzi endomitoza; jeżeli zreplikowana zostaje niecała chromatyna (przede wszystkim euchromatyna lub jej część), po czym nie dochodzi do mitozy, zachodzi amplifikacja lub niepełna replikacja zajście endoreplikacji wymaga wyłączenia mechanizmów kontrolnych cyklu komórkowego* ENDOMITOZA: jej efektem jest poliploidyzacja komórek megakariocyty: duże komórki wytwarzające wypustki (przypominające pseudopodia), osadzają się na ścianach naczyń krwionośnych i do światła naczyń odcinają obłonione fragmenty swojej cytoplazmy (zachodzi sekrecja) – prekursory płytek krwi; konieczny jest więc intensywny wzrost tych komórek, który jest skorelowany z podwyższonym poziomem DNA; endomitoza inicjowana jest przez trombopoetynę – po zreplikowaniu DNA komórka wchodzi w mitozę: pojawia się aktywne MPF, degradowana jest otoczka jądrowa, chromatyna kondensuje, wyodrębniają się chromosomy, odbywa się normalna metafaza, zainicjowana zostaje anafaza, ale przebiega tylko anafaza A, po czym następuje przedwczesne wyjście z anafazy (nie odbywa się anafaza B), przez co siostrzane chromosomy odsuwają się od siebie tylko na bardzo niewielki dystans, podczas telofazy zostaje odbudowana otoczka jądrowa i wszystkie chromosomy znajdują się w jednym jądrze – efektem jest powielenie liczby chromosomów; wyjście z mitozy następuje na skutek przedwczesnej lub zintensyfikowanej degradacji cykliny B komórki miękiszowe (np. w liściach sukulentów): bardzo duże komórki; po zreplikowaniu DNA zahamowana zostaje degradacja otoczki jądrowej, nie powstaje wrzeciono kariokinetyczne, kondensacja chromatyny jest niepełna, ale chromosomy dzielą się na chromatydy, dochodzi do degradacji kohezyny i liczba chromosomów ulega podwojeniu ENDOREDUPLIKACJA: jej efektem jest powstanie chromosomów politenicznych (złożonych z wielu chromatyd), o bardzo dobrze widocznym prążkowaniu (ze względu na ogromną ilość położonych obok siebie chromatyd), posiadających puffy (pierścienie Balbianiego), które są miejscami gwałtownej dekondensacji, despiralizacji fragmentów chromatyny, będące przygotowaniem do intensywnej transkrypcji na tych odcinkach, pojawiają się na chromosomach w różnych miejscach, w zależności od tego, które fragmenty są aktualnie aktywne transkrypcyjnie; obecne także duże, rogalikowate struktury na chromosomach politenicznych – jąderka aby zaszła endoreduplikacja konieczne: zablokowanie wejście w mitozę (nie może się pojawić aktywne MPF) oraz cykliczna replikacja DNA (replikacja --> faza G --> replikacja --> faza G..., faza G konieczna do tego, żeby chromatyna osiągnęła stan kompetencji do replikacji – dołączone muszą zostać do chromatyny białka PRC (kompleksu prereplikacyjnego); w typowym cyklu komórkowym chromatyna jest kompetentna do replikacji w fazie G1, aby ją ponownie uzyskać musi przejść mitozę – istnieje mechanizm, który chroni przed przedwczesnym zainicjowaniem replikacji DNA: aby została zainicjowana replikacja, z chromatyną musi zostać zasocjowany kompleks prereplikacyjny, składający się z wielu kompleksów białek, np. ORC – rozpoznający miejsca inicjacji replikacji, kompleks MCM, cdc6; po zapoczątkowaniu replikacji wszystkie białka (z wyjątkiem ORC) kompleksu prereplikacyjnego oddysocjowują od chromatyny i pozostają odłączone tak długo, jak długo działają aktywne kompleksy cyklina/kinaza; ponowne zmontowanie kompleksu prereplikacyjnego na chromatynie jest możliwe, kiedy spadek aktywności i poziomu cyklin będzie maksymalny – po degradacji cykliny A i B; cykliczność cyklów endoreduplikacyjnych zależy od zmian aktywności kompleksu cyklina E/kinaza CDK (kom. zwierz.) oraz cyklina A/kinaza CDK i syntezy białka cdk6 (kom. rośl.)) endoreduplikacja u roślin: w komórkach w nią wchodzących utrzymuje się wysoki poziom białka ccs52 (cell cycle switch), które jest odpowiednikiem cdc20 u zwierząt (jest składnikiem kompleksu ligazy ubikwitynowej/APC, decydującym o specyficzności substratowej ligazy ubikwitynowej), przez co nawet, gdy cyklina B się pojawi, jest od razu degradowana przez kompleks APC – brakuje jednego ze składników MPF, poza tym istnieje dodatkowa ścieżka zabezpieczająca przed wejściem w mitozę: utrzymuje się też wysoki poziom białka CKI, które jest inhibitorem aktywności kinaz cyklinozależnych oraz zahamowana jest aktywność fosfatazy, która defosforyluje w miejscach inhibitorowych kinazę – nie pojawia się więc aktywne MPF, przez co jest spełniony 1. warunek endoreduplikacji (zablokowanie wejścia w mitozę); 2. warunek (zapewnienie cykliczności replikacji DNA): utrzymuje się stały poziom aktywności kompleksu fazy G1 (cyklina D/kinaza CDK), który fosforyluje białko FB, w wyniku czego uwolniony zostaje czynnik transkrypcyjny f2f, który promuje transkrypcję genów cykliny A i białka cdc6, powstaje kompleks cyklina A/kinaza CDK, który inicjuje replikację DNA, po zainicjowaniu replikacji cyklina A jest ubikwitynowana i degradowana w proteasomach, następnie znów w fazie G musi dojść do fosforylacji FB... itd.; w fazie G zachodzi też reasocjacja białek kompleksu prereplikacyjnego na chromatynie endoreduplikacja u zwierząt (owadów): zahamowanie wejścia w mitozę podobnie jak u roślin: w komórkach follikularnych, znajdujących się w jajnikach, zahamowana zostaje ekspresja genu dla fosfatazy STRING cdc25, która może defosforylować kinazę cdk w jej miejscach inhibitorowych (niski poziom STRING cdc25 = nieaktywna kinaza cdk1); poza tym promowana ekspresja genu białka Fzr (odpowiednika ccs52 u roślin), regulującego specyficzność substratową kompleksu APC/ligaza ubikwitynowa, którego wysoki poziom wywołuje degradację cykliny B – nie może więc powstać aktywne MPF; zapewnienie cyklicznej replikacji DNA: kluczową rolę w regulacji cyklu spełnia kompleks cyklina E/cdk2; niski poziom białka Dacapo (CIP/KIP), inhibitora kinazy cdk2, pozwala na utworzenie aktywnego kompleksu cyklina E/cdk2, niezbędnego do inicjacji replikacji, po zainicjowaniu replikacji cyklina E ulega degradacji, następnie syntetyzowana jest ponownie itd.; w trofoblastach ssaków poziom cykliny E się nie zmienia (nie ulega degradacji), ale konieczna jest cykliczność aktywności kompleksu cdk2/cyklina E, którą wywołuje zmienny poziom białka p57, które jest inhibitorem kinaz cdk (CIP/KIP), p57 akumulowane jest pod koniec S (wtedy zahamowana aktywność cdk2 i kompleks cdk2/cyklina E przestaje być aktywny, co pozwala na oddysocjowanie od chromatyny białek kompleksu prereplikacyjnego i wejście w fazę G), pod koniec S p57 degradowane, co umożliwia reasocjację białek kompleksu prereplikacyjnego podczas fazy G, wtedy też zaczyna być syntetyzowane białko p57 (ale maksimum akumulacji osiąga pod koniec S) (ścieżka Notch) pętle inwersyjne są efektem zaistnienia w jednym ze skoniugowanych chromosomów politenicznych inwersji (chromosom, w którym nie doszło do inwersji, musi się odpowiednio złożyć, aby dopasować się do chromosomu z inwersją) niepełna endoreduplikacja: chromosomy mają powielone całe DNA, z wyjątkiem DNA centromerowego – chromosomy połączone są okolicami centromerowymi AMPLIFIKACJA: podlegają jej najczęściej geny, których ostatecznym produktem jest RNA odbywa się najczęściej pozachromosomowo: odcinki mające być zamplifikowane są transkrybowane – powstaje matryca rRNA, na której odwrotna transkryptaza syntetyzuje rDNA; kopia rDNA ulega cyrkularyzacji i odbywa się replikacja: endonukleaza rozcina jedną z nici DNA, miejscem inicjacji replikacji jest koniec 3', asocjuje z nim polimeraza, która cyrkuluje po kolistej matrycy, katalizując syntezę komplementarnego DNA, przez co z każdym obrotem wydłuża się powielane DNA