Genetyka medyczna II

advertisement
Składniki jądrowego genomu człowieka
Genom człowieka
3 000 Mpz (3x109, 100 cm)
Geny i sekwencje związane z genami
DNA pozagenowy
(900 Mpz, 30% g. jądrowego)
(2100 Mpz, 70%)
DNA kodujący
DNA niekodujący
(90 Mpz ~ ok. 25
tys. genów; 2%
g. jądrowego
(810 Mpz)
Pseuogeny
Introny (26%)
Fragmenty
genów
DNA
powtórzony
DNA
unikatowy
(420 Mpz)
(1680 Mpz)
Składniki jądrowego genomu człowieka
Genom człowieka
3 000 Mpz (3x109, 100 cm)
DNA powtórzony (420 Mpz, 14% całkowitego DNA)
DNA powtórzony tandemowo
Powtórzenia rozproszone w całym genomie
LINE
DNA satelitarny
DNA
minisatelitarny
Powtórzenia o
dł. 100-6500 pz
Powtórzenia o
dł. 10-20 pz
DNA
mikrosalelitarny
Powtórzenia o
dł. 2-5 pz
Elementy
LTR
długie,
kilka lub
więcej
kpz
SINE
krótkie
100-500
pz
Transpozony
Mitochondrialny genom człowieka
• Małe (16 569 pz) koliste DNA (1% całkowitego DNA w komórce)
• każde mitochondrium zawiera od 2-10 cząsteczek DNA
• Geny kodują białka oraz rRNA, tRNA (razem 37)
• 1 gen/0.45 kb
• Niewiele powtórzeń
• 2 geny rRNA (16S, 12S)
• Brak intronów; 93% to część kodująca;
• 22 geny tRNA (22)
• 13 regionów kodujących
białka:
cytochrom b
dehydrogenazęNADH
 oksydazy cytochromu b
ATP-azy
A scanning electron micrograph of mitochondrial DNA.
Hudson, B. et al. Nature 216, 650 (1967).
Porównanie dziedziczenia autosomalnego
Cecha
Dominujące
Recesywne
Choroba występuje u homozygot
(AA) i heterozygot (Aa);
Choroba występuje u
Wzór
homozygoty są najczęściej letalne homozygot (aa) (wzór
dziedziczenia lub chorują najciężej (wzór
poziomy)
pionowy)
Jeżeli jedno z rodziców jest chore
średnio 50% potomstwa też
choruje niezależnie od płci
W przypadku rodziców
heterozygotycznych (Aa)
ryzyko wystąpienia cechy u
potomstwa wynosi 25%
Ryzyko wystąpienia cechy u
potomstwa zwiększa się z
wiekiem ojca
Brak zależności między
wiekiem rodziców a ryzykiem
wystąpienia choroby u
potomstwa
Ekspresja
Zmienna
Stała
Inne cechy
Nie zaobserwowano wpływu
Pokrewieństwo rodziców
pokrewieństwa na częstość
zwiększa ryzyko wystąpienia
występowania cechy u potomstwa choroby u potomstwa
Ryzyko
genetyczne
Porównanie dziedziczenia sprzężonego z płcią
Cecha
Dominujące
Recesywne
Ryzyko genetyczne
(heterozygotyczna matka,
prawidłowy ojciec)
50% synów chorych, 50%
córek chorych
50% synów chorych, 50% córek
heterozygotycznych nosicielek
Ryzyko genetyczne
(prawidłowa matka, chory
ojciec)
0% synów chorych, 100%
córek chorych
0% synów chorych, 100% córek
heterozygotycznych nosicielek
Wzór dziedziczenia
pionowy
poziomy (pomijanie pokoleń z
heterozygotycznymi
nosicielkami)
Stosunek płci
2 x więcej chorych kobiet
niż mężczyzn (zmutowany
gen u mężczyzn jest
często letalny)
Znacznie więcej chorych
mężczyzn niż kobiet (chore
homozygotyczne kobiety są
rzadkie)
Cechy uwarunkowane wieloczynnikowe
Kryteria pomagające określić dziedziczenie wieloczynnikowe choroby:
 ryzyko powtórzenia jest wyższe, gdy chory jest więcej niż jeden
członek w rodzinie
 jeżeli manifestacja choroby u probanta jest cięższa, ryzyko jest
wyższe
 ryzyko jest wyższe jeżeli probant jest płci rzadziej dotkniętej chorobą
(np. jeżeli choroba jest rzadsza u kobiet (tzn. muszą mieć więcej
genów aktywnych) to ich synowie mają większe ryzyko dziedziczenia
choroby niż córki)
 ryzyko zwykle spada u dalej spokrewnionych członków rodziny
 ryzyko dla potomstwa i rodzeństwa probanta jest równe
pierwiastkowi kwadratowemu z częstości choroby w populacji
Prawo Hardy’ego- Weinberga
Częstości alleli w populacji
(A) = p (a) = q
p+q=1
Zależności liczbowe między częstością alleli a częstością
genotypów w populacji określa wzór Hardy’go – Weinberga:
(p+q)2 = 1
p2 + 2pq + q2 = 1
Prawo Hardy’ego- Weinberga
następne
pokolenie
p (A)
q (a)
Częstości genotypów
p2 - częstość (AA)
p(A)
p2
pq
2pq - częstość (Aa)
q2 - częstość (aa)
q (a)
jeżeli
pq
q2
p2 + 2pq + q2 = (p+q)2 - równowaga genetyczna
Zadania genetyczne - przykłady
a) Podaj rozkład genotypów i fenotypów u potomstwa, którego matka
wykazuje fenyloketonurię i ma oczy piwne, a ojciec ma oczy jasne.
Wiadomo także, że dziadkowie ze strony matki byli ciemnoocy, a
babka ze strony ojca chorowała na fenyloketonurię.
b) Jakie jest prawdopodobieństwo urodzenia się dziecka zdrowego o
włosach rudych, jeżeli matka ma włosy rude i obydwoje rodzice
chorują na achondroplazję?
c) Jakie cechy będzie miało potomstwo, jeżeli matka jest nosicielką
fenyloketonurii, a ojciec jest daltonistą? Wiadomo, że w rodzinie
matki nigdy nie występował daltonizm.
d) Praworęczna córka daltonisty poślubiła leworęcznego mężczyznę
prawidłowo widzącego barwy. Jaka część ich dzieci, i jakiej płci,
będzie leworęcznymi daltonistami?
Zadania genetyczne - przykłady
d) Jakie będzie prawdopodobieństwo urodzenia się córki będącej
niewydzielaczem o grupie krwi p, jeżeli matka ma grupę krwi P1, a
ojciec P2 i oboje rodzice są wydzielaczami. Wiadomo, że babka ze
strony matki i dziadek ze strony ojca byli niewydzielaczami i mieli
grupę krwi p.
e) Jakie jest prawdopodobieństwo urodzenia syna o grupie krwi A1B,
MN matce o grupie krwi A1, M i ojcu o grupie krwi A2B, N? Jeżeli
wiadomo, że babka ze strony matki miała grupę krwi 0.
Download