Cel /zakres zastosowania Genomowa sonda diagnostyczna wg

Cel /zakres zastosowania
Genomowa sonda diagnostyczna wg metody hybrydyzacji “in situ” , stanowi nowe , atrakcyjne narzędzie do
wykorzystania w laboratoriach diagnostycznych (pracowniach mikrobiologii, weterynarii) celem diagnozowania
dermatofitów, tj patogennych grzybów powodujących infekcje skóry, włosów i paznokci. Do tej grupy należą gatunki
trichophyton mentagrophytes. Uproszczona procedura wykonania stanowi ważną cechę pozwalającą na stosowanie w
medycznych laboratoriach diagnostycznych, w pracowniach mikologii, mikrobiologii lub weterynarii. Sonda jest
wykorzystywana w molekularnej diagnostyce dermatofitów izolowanymi od ludzi i zwierząt.
Cechy unikalne/innowacyjne produktu lub technologii
Sonda genetyczna typu „in situ” (w miejscu naturalnego występowania) przewyższa inne metody specyficznością,
czułością i szybkością uzyskania wyniku. Dodatkowym atutem jest brak konieczności posiadania licznej aparatury do
przeprowadzenia badań. Do analizy potrzeba małej ilości materiału diagnostycznego.
Do znakowania sondy (wg znakowania biotyną) stosuje się technikę wielokolorową FISH.
Analizę preparatów przeprowadza się w mikroskopie fluoroscencyjnym.
Opracowana genomowa sonda diagnostyczna typu „in situ” znakująca DNA w jądrze komórkowym „Trichophyton
mentagrophytes” na szkiełku mikroskopowym zgodna z wynalazkiem chronionym patentem P.404901, charakteryzuje
się tym, że stanowi ją mieszanina fragmentów wyznakowanego genomowego DNA hybrydyzujących do DNA w jądrach
komórkowych „Trichophyton mentagrophytes”.
Cechy produktu / technologii pozwalające na rozwiązanie istotnych problemów dotychczasowych rozwiązań
Standardowa diagnostyka mikologiczna dermatofitów obejmuje identyfikację gatunków opartą na ocenie wizualnej
kolonii wyrośniętych na podłożu Sabourauda. Ocenia się również mikroskopowo makro i mikrokonidia oraz inne
specyficzne twory grzybni. Bada się zdolność i typ penetracji włosa in vitro oraz właściwości metaboliczne.
Najważniejszym etapem badania mikologicznego jest hodowla in vitro , pozwalająca na wyizolowanie szczepu grzyba z
materiału klinicznego. Hodowle prowadzi się do 6 tygodni. W celu oceny morfologii mikroskopowej identyfikowanego
gatunku dermatofita zakłada się mikrohodowle szkiełkowe, które prowadzi się przez okres od 5 do 15 dni, co dodatkowo
wydłuża okres oczekiwania na wynik diagnostyczny. W celu prawidłowego zidentyfikowania szczepu do poziomu
gatunku konieczne jest korzystanie z kilku metod fenotypowych jednocześnie. Są one kosztowne, pracochłonne , mają
różną i niską powtarzalność wyników. Często uzyskane wyniki okazują się trudne i niejednoznaczne w interpretacji.
Fluorescencyjne sondy hybrydyzujące „in situ” do aplikacji mikrobiologicznych oraz mikologicznych są najczęściej
otrzymywane poprzez znakowanie całego DNA lub poprzez amplifikację i znakowanie określonego, unikatowego
fragmentu (sekwencji DNA) np. określonego genu obecnego tylko u tego gatunku. Natomiast poważnym problemem w
przypadku otrzymywania sond genetycznych jest znajomość sekwencji genomowej określonego gatunku , szczepu. W
przypadku dermatofitów rodzajów Epidermophyton, Microsporum, Trichophyton sekwencja genomu nie jest znana a
wiedza w tym zakresie ogranicza się jedynie do niektórych tylko fragmentów sekwencji DNA. Konstrukty sond oparte na
tych unikatowych sekwencjach nie są w stanie różnicować gatunków podczas hybrydyzacji „in situ” ze względu na zbyt
dużą homologię sekwencji DNA między nimi.
Wad tych nie posiada metoda molekularnej diagnostyki dermatofitów zastrzeżona patentem P.404901.
Korzyści dla przedsiębiorcy
Sonda genomowa umożliwia szybką i jednoznaczną diagnostykę molekularną dermofitów, patogennych grzybów
trichophyton mentagrophytes. Technologia zalecana jest do stosowania w laboratoriach szpitalnych, weterynaryjnych i
innych laboratoriach medycznych.
Technika znakowania FISH może posłużyć do skonstruowania wygodnego w użyciu i taniego zestawu diagnostycznego
do identyfikacji dermatofitów. Do zalet można zaliczyć użyteczność techniki w zastosowaniu do różnicowania innych
gatunków dermatofitów: „Microsporum canis”, „Trichophyton rubrum”, Trichophyton mentagrophytes”.
Cechy produktu/ technologii tworzącego wartość dla klienta detalicznego
Zastosowanie sondy genomowej wyeliminuje błędy w diagnozowaniu grzybic, które są popełniane przy stosowaniu
klasycznych metod mikologicznych i mikrobiologicznych.