ZAGADNIENIA NA EGZAMIN MAGISTERSKI (OGÓLNE) 1. Budowa komórki bakteryjnej 2. Struktura kwasów nukleinowych 3. Kluczowe odkrycia prowadzące do poznania struktury DNA 4. Genom – wyjaśnij pojęcie 5. Chromosom bakteryjny – budowa i funkcje 6. Chromatyna eukariotyczna – upakowanie DNA 7. Struktura DNA a replikacja 8. Replikacja chromosomu bakteryjnego 9. Bakteryjne polimerazy DNA 10. Primosom – budowa i funkcja 11. Replisom – budowa i funkcja 12. Replikacja DNA eukariotycznego 13. Telomery a replikacja DNA 14. Transkrypcja 15. Ekspresja genu 16. Rodzaje i funkcje RNA 17. Transkrypcja u bakterii 18. Transkrypcja u eukariota 19. Modyfikacje RNA 20. Mechanizmy składania eksonów 21. Genetyczne podstawy biosyntezy białek 22. Kod genetyczny 23. Struktura i funkcje białek 24. Struktura rybosomów i ich funkcjonowanie w translacji 25. Inicjacja translacji u bakterii 26. Regulacja ekspresji genów 27. Regulacja ekspresji genów na poziomie transkrypcji 28. Operon laktozowy – budowa i regulacja ekspresji genów 29. Represja kataboliczna 30. Operon arabinozowy – budowa i regulacja ekspresji genów 31. Operon tryptofanowy – budowa i regulacja ekspresji genów 32. Atenuacja 33. Regulacja ekspresji genów u eukariota 34. Alternatywny splicing 35. Wyciszanie genów – zjawisko interferencji RNA 36. Technologia rekombinacji DNA in vitro 37. Klonowanie genu 38. Wektory do klonowania 39. Enzymy restrykcyjne 40. Enzymy modyfikujące DNA w klonowaniu molekularnym 41. Cechy plazmidów użyteczne w klonowaniu 42. Wektory serii pUC – budowa i metoda klonowania 43. Klonowanie i ekspresja genów w systemie Tabora-Studiera (system pET) 44. Klonowanie i ekspresja genów w systemie pBAD 45. Cechy dobrych wektorów do klonowania 46. Ogólne zasady polimerazowej reakcji łańcuchowej (PCR) 47. Ogólne zasady projektowania sekwencji starterów do PCR 48. Czynniki wpływające na efektywność PCR 49. Ekstremofile i ich użyteczność biotechnologiczna 50. Technologie metagenomowego DNA PYTANIA Z PRZEDMIOTÓW SPECJALIZACYJNYCH (egzamin magisterski) 1. Zastosowanie techniki PCR w diagnostyce molekularnej – przykłady 2. Odmiany techniki PCR stosowane do typowania genetycznego 3. Metody amplifikacji matrycy, sondy, sygnału – wymienić i krótko opisać 4. Na czym polega amplifikacja w czasie rzeczywistym (Real-time PCR) 5. Metody typowania genetycznego w badaniach epidemiologicznych 6. Molekularne metody wykrywania nowotworów 7. Badania przesiewowe wykrywania mutacji Wykrywanie punktowych, znanych mutacji 8. Sekwencjonowanie DNA: metoda sekwencjonowania Sangera z rozdziałem kapilarnym oraz metody sekwencjonowania drugiej generacji (ang. next generation sequencing). 9. Metody hybrydyzacji DNA 10. Co to są mikromacierze DNA – podział i zastosowanie 11. Czym zajmuje się Proteomika? Zastosowanie w diagnostyce. Wykorzystanie elektroforezy dwuogniskowej w badaniach proteomu. 12. Omówić poziomy ustrukturyzowania białek w następującej kolejności: białko zdenaturowane, struktury II-rzędowe, motywy (Struktury super-II-rzędowe), struktura III-rzędowa 13. Objaśnij pojęcie efektu hydrofobowego na przykładzie procesu fałdowania białek 14. Wybrane metody stosowane w inżynierii genetycznej zwierząt: amplifikacja transgenu za pomocą metotreksatu, ekspresja tkankowo-specyficzna transgenu, zasada działania i zastosowania systemu Cre-lox.Budowa genomu ludzkiego. 15. Podać definicję szczepionki oraz wymienić elementy składowe szczepionek wraz z przykładami 16. Wymienić i krótko scharakteryzować systemy ekspresyjne stosowane do produkcji rekombinantowych antygenów szczepionkowych 17. Optymalizacja produkcji białek rekombinantowych w układach prokariotycznych 18. Mechanizmy regulacji ekspresji genów wykorzystywane przy produkcji białek rekombinantowych 19. Domeny fuzyjne białek rekombinantowych i ich zastosowania 20. Budowa wirusów i symetrie nukleokapsydów 21. Typy zakażeń wirusowych 22. Replikacja u wirusów 23. Struktura i somatyczna rekombinacja genów kodujących immunoglobuliny 24. Źródła różnorodności receptorów TCR i immunoglobulin 25. Immunoidentyfikacja białek.