Dyrektywa Ptasia ma na celu ochronę gatunków ptaków, gospodarowanie nimi i regulowanie ich liczebności. Zawiera ona zasady dopuszczalnego wykorzystania tych gatunków, podaje listę gatunków ptaków rzadkich lub zagrożonych wyginięciem z powodu zmian zachodzących w ich siedliskach. Siedliska mają umożliwić zagrożonym gatunkom przetrwanie i rozród. W Polsce występuje 267 gatunków ptaków z załącznika I Dyrektywy Ptasiej i dla nich wszystkich powinny powstać obszary OSO (zarówno lądowe jaki i morskie), na których zapewni się ochronę tych gatunków i ich siedlisk. Ochronie powinny także podlegać gatunki wędrowne- zwłaszcza ich tereny lęgowe, zimowiska lub miejsca wypoczynku na trasach wędrówek. Dyrektywa Siedliskowa ma na celu zapewnienie różnorodności biologicznej przez ochronę siedlisk przyrodniczych oraz dzikiej fauny i flory na europejskim terytorium państw członkowskich. Siedliska przyrodnicze to nowe pojęcie w ochronie przyrody. Rozumie się przez nie: obszar lądowy lub wodny, naturalny lub półnaturalny, wyodrębniony na podstawie cech geograficznych, abiotycznych (nieożywionych) i biotycznych (ożywionych) środowiska. Siedliska przyrodnicze są wymienione w zał. I do Dyrektywy Siedliskowej. W Polsce występuje ich 76. Odpowiadają one różnym zbiorowiskom roślinnym, takim jak: np. murawy górskie na podłożu wapiennym, łąki użytkowane ekstensywnie, grądy środkowoeuropejskie, torfowiska wysokie itd. Siedliska o znaczeniu wspólnotowym, to takie, które: a) są zagrożone zanikiem w swoim naturalnym zasięgu lub b) mają niewielki naturalny zasięg w wyniku regresji lub w związku ze swoimi wewnętrznymi, przyrodniczymi właściwościami lub też c) stanowią wybitne przykłady typowych cech jednego lub więcej z pięciu wymienionych regionów biogeograficznych: alpejskiego, atlantyckiego, kontynentalnego, makaronezyjskiego lub śródziemnomorskiego. Wśród nich wyróżnia się tzw. priorytetowe rodzaje siedlisk, czyli takie rodzaje siedlisk przyrodniczych zagrożonych zanikiem, które występują na terenie UE i za których ochronę Wspólnota Europejska ponosi szczególną odpowiedzialność w związku z tym, że znacząca część ich naturalnego zasięgu obejmuje teren UE. W Polsce występuje 13 siedlisk priorytetowych. Drugim elementem podlegającym ochronie na mocy Dyrektywy Siedliskowej są gatunki roślin i zwierząt (z wyjątkiem ptaków) i ich siedliska. Siedlisko gatunku to obszar wyznaczony przez charakterystyczne cechy biotyczne i abiotyczne, na którym gatunek występuje w którymkolwiek stadium swojego cyklu biologicznego. W Polsce występują 44 gatunki roślin i 88 gatunków zwierząt (w tym 24 gat. ssaków, 1 - gad, 4- płazy, 19 gat. ryb i krągłoustych, 40- bezkręgowców) z II załącznika Dyrektywy Siedliskowej. Ponadto 11 priorytetowych gatunków roślin oraz 13 priorytetowych gatunków zwierząt występuje w Polsce. Przez ochronę typu siedliska czy siedliska gatunku rozumiemy jedynie ochronę jego reprezentacji, a nie wszystkich miejsc występowania w kraju. Dyrektywa Siedliskowa wyznacza cele i warunki zachowania poszczególnych siedlisk i gatunków, wg właściwego celu ochrony, co oznacza, że dla typów siedlisk przyrodniczych: - naturalny zasięg siedliska nie zmniejszy się, - zachowuje ono specyficzną strukturę i swoje funkcje, - stan ochrony typowych dla niego gatunków również jest właściwy. Właściwy stan ochrony w przypadku gatunków oznacza, że: - zachowana zostaje liczebność populacji, gwarantująca jej utrzymanie się w biocenozie przez dłuższy czas, naturalny zasięg gatunku nie zmniejszy się, pozostaje zachowana wystarczająco duża powierzchnia siedliska gatunku.