PROPONOWANE TEMATY PRAC MAGISTERSKICH DLA KIERUNKU BIOTECHNOLOGIA 1. Katedra Biotechnologii Rozrodu i Higieny Środowiska a) tematy prac inżynierskich Zastosowanie biotestów w badaniach ekotoksykologicznych Zastosowanie biotestów w ocenie toksyczności nanocząstek Wpływ metody pobierania na efektywność pozyskiwania i jakość oocytów świni Ocena morfologiczna pobranych oocytów świni w aspekcie wykorzystania ich w procedurze zapłodnienia in vitro Zapłodnienie in vitro – znaczenie oraz możliwości wykorzystania u ludzi i zwierząt Zastosowanie wybranych metod w ocenie jakości nasienia ludzi i zwierząt Inseminacja i transplantacja zarodków – metody i możliwości wykorzystania Rozwój technik wspomaganego rozrodu a aktualna tendencja ograniczonej płodności mężczyzn i kobiet Zastosowanie systemów komputerowo wspomaganej analizy obrazu w ocenie jakości nasienia Zastosowanie niskich temperatur w długotrwałym przechowywaniu obiektów biologicznych b) tematy prac magisterskich Ocena zmian w jakości konserwowanego nasienia knurów z wykorzystaniem wybranych testów fluorescencyjnych i metod tradycyjnych Ocena ruchu plemników z wykorzystaniem komputerowego sytemu analizy obrazu i metod tradycyjnych Ocena wybranych składników płynu pęcherzykowego w zależności od cech morfologicznych jajnika świni Profil lipidowy w pęcherzykach jajnikowych krów Stężenie wybranych składników biochemicznych w bydlęcych pęcherzykach jajnikowych Stężenie wybranych pierwiastków w pęcherzykach jajnikowych krów Zmiany integralności i funkcjonalności wybranych struktur plemnika podczas konserwacji nasienia Zastosowanie komputerowo wspomaganej analizy do oceny zmian parametrów ruchu plemników podczas konserwacji nasienia Analiza zmian morfologicznych plemników w najądrzu. Kształtowanie się koncentracji wybranych hormonów w okresie okołokoncepcyjnym samic norki amerykańskiej Ocena składu biochemicznego świńskich pęcherzyków jajnikowych. Ocena składu biochemicznego bydlęcych pęcherzyków jajnikowych 2. Katedra Fizjologii, Cytobiologii i Proteomiki a) tematy prac inżynierskich/licencjackich Aminy biogenne – fizjologia i patofizjologia jelita grubego. Liczba nefronów a nadciśnienie tętnicze. Jonowa i niejonowa forma platyny a skuteczność terapii w chorobach nowotworowych. Znaczenie badań proteomicznych w poszukiwaniu klinicznych biomarkerów chorób nowotworowych. Proteomika zwierząt gospodarskich – dokonania i przyszłe kierunki badań. Analiza strategii umożliwiających badanie białek niskokopijnych płynów ustrojowych. Analiza porównawcza wybranych metod detekcji białek na żelach 2-D. Identyfikacja i analiza widm masowych wybranych białek odpowiedzialnych za metabolizm energetyczny w mięśniach szkieletowych świni. Identyfikacja i analiza widm masowych białek składowych proteomu mięśni/jąder emu. Identyfikacja i analiza widm masowych wybranych białek proteomu jelit: cienkiego/grubego i ślepego świni. Analiza bilansu oksydo-redukcyjnego (PEB) cieląt żywionych mlekiem lub preparatem mlekozastępczym. Identyfikacja oraz analiza ekspresji wybranych białek w osoczu krwi różnych gatunków zwierząt z zastosowaniem techniki Western Blot. Identyfikacja oraz analiza ekspresji białek TRPM6 i TRPM7 w rdzeniu i korze nerek z zastosowaniem techniki Western Blot. b) tematy prac magisterskich Możliwość wykorzystania wyników analizy profili białkowych pierwiastek do prognozowania późniejszej produkcyjności i stanu zdrowia. Identyfikacja i analiza widm masowych wybranych białek odpowiedzialnych za metabolizm energetyczny w mięśniach szkieletowych świni. Identyfikacja i analiza widm masowych białek składowych proteomu mięśni/jąder emu. Identyfikacja i analiza widm masowych wybranych białek proteomu jelit: cienkiego/grubego i ślepego świni. Analiza bilansu oksydo-redukcyjnego (PEB) cieląt żywionych mlekiem lub preparatem mlekozastępczym. Identyfikacja oraz analiza ekspresji akwaporyny 2 (AQP2) w nerkach i moczu różnych gatunków zwierząt z zastosowaniem techniki Western Blot. Identyfikacja oraz analiza ekspresji apolipoproteiny AIV w osoczu krwi i nerkach różnych gatunków zwierząt z zastosowaniem techniki Western Blot. Analiza budowy histologicznej tkanek różnych narządów. Identyfikacja oraz analiza ekspresji wybranych białek w rdzeniu i korze nerek różnych gatunków zwierząt z zastosowaniem techniki Western Blot. Analizy proteomiczne osocza krwi zwierząt wykazujących objawy chorób metabolicznych. 3. Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt a) tematy prac inżynierskich Analiza molekularna zafałszowań żywności Poszukiwanie polimorfizmów genów wpływających na cechy użytkowe zwierząt Izolacja oraz porównanie jakości DNA pochodzącego z różnych źródeł Porównanie czułości różnych testów molekularnych Metody określania polimorfizmu DNA Zastosowanie osiągnięć genetyki molekularnej u ludzi i zwierząt Optymalizacja określonej metody genetycznej w celu uzyskania amplikonu wybranego genu Opracowanie metodyki identyfikacji polimorfizmu typu SNP 820 G/A w bydlęcym genie UCP-3 w oparciu o ACRS-PCR ACRS-PCR jako metoda identyfikacji polimorfizmu SNP Analiza genetyczna wybranych chorób ludzi i zwierząt Projektowanie testu molekularnego dla identyfikacji mutacji punktowych Projektowanie testu tetra-primer ARMS-PCR do analizy polimorfizmu w genie FABP3 Projektowanie testu ACRS-PCR do analizy polimorfizmu w genie SLC27A1 b) tematy prac magisterskich Projektowanie testu tetra-primer ARMS-PCR do analizy polimorfizmu w genie FABP3, Projektowanie testu ACRS-PCR do analizy polimorfizmu w genie SLC27A1, Opracowanie metodyki identyfikacji polimorfizmu typu SNP 820 G/A w bydlęcym genie UCP-3 w oparciu o ACRS-PCR, Analiza polimorfizmu MARC0017000 w odniesieniu do jakości cech tusz wieprzowych, Doskonalenie genetyczne bydła mlecznego, Polimorfizm genetyczny a użytkowość rozrodcza loch, Mutacje genetyczne w populacji kotów rasy Ragdoll Analizy molekularne z wykorzystaniem DNA mitochondrialnego. Analiza polimorfizmu genetycznego w odniesieniu do cech użytkowych bydła. Gen czynnika transkrypcyjnego MITF kota domowego (Felis catus). Analiza polimorfizmów genetycznych typu SMT w odniesieniu do cech użyteczności bydła mlecznego. Analiza polimorfizmu genetycznego w odniesieniu do cech użytkowych i funkcjonalnych u bydła. 4. Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin a) tematy prac magisterskich ● Poszukiwanie markerów molekularnych sprzężonych z dominującym genem karłowatości Dw3 u żyta ● Wykrywanie polimorfizmów cDNA-AFLP sprzężonych z dominującym genem karłowatości Dw3 u żyta ● Wpływ witaminy C i kwasu nikotynowego na namnażanie in vitro Celozji pierzastej (Celosia argentea var. cristata) w warunkach stresu solnego. ● Indukowanie mutagenezy chemicznej w kulturach in vitro i in vivo na przykładzie wybranej rośliny ogrodniczej. ● Wpływ roślinnych regulatorów wzrostu na rozwój i kwitnienie roślin kosmosu siarkowego. ● Wpływ roślinnych regulatorów wzrostu na rozwój i kwitnienie roślin rudbekii owłosionej. ● Wpływ zasolenia na morfologię systemu korzeniowego żyta w kulturach dojrzałych zarodków in vitro. ● Indukowanie zmienności somaklonalnej u żyta. ● Poszukiwanie markerów molekularnych dla genów odpowiedzialnych za tworzenie nalotu woskowego u żyta (S. cereale L.) ● Poszukiwanie markerów molekularnych dla recesywnego genu karłowatości żyta (S. cereale L.) Identyfikacja różnic genotypowych między kwitnącymi i niekwitnącymi roślinami borówki wysokiej z zastosowaniem wybranych technik biologii molekularnej. Rozmnażanie honkenii piaskowej (Honekenya peploides L.) w kulturach in vitro. Rozmnażanie aksamitki rozpierzchłej (Tagetes patula L.) w kulturach in vitro. b) tematy prac inżynierskich ● Technologie sekwencjonowania NGS, potencjał i możliwości ich wykorzystania w badaniach roślin uprawnych. ● Metody identyfikacji i analizy genów uczestniczących w szlaku produkcji wybranych fitohormonów roślinnych. ● Wpływ stężenia i rodzaju cukru (sacharozy i fruktozy) na namnażanie Celozji pierzastej (Celosia argentea var. cristata) w kulturach in vitro. ● Wpływ meta topoliny na namnażanie goi (L. barbarum) w kulturach in vitro.” ● Mikrorozmnażanie roślin z rodziny astrowatych (Asteraceae) na przykładzie nagietka lekarskiego. ● Mikrorozmnażanie roślin z rodziny astrowatych (Asteraceae) na przykładzie aksamitki rozpierzchłej. ● Kultury dojrzałych zarodków in vitro w biotechnologii roślin. ● Wpływ metod dezynfekcji nasion na efektywność zakładania kultur dojrzałych zarodków żyta. ●Charakterystyka morfologiczna i molekularna pary linii bliskoizogenicznych żyta (S. cereale L.) RXL10 i RXL10bw różniących się nalotem woskowym. ●Charakterystyka morfologiczna i molekularna pary linii bliskoizogenicznych żyta (S. cereale L.) M12 i M12bw różniących się nalotem woskowym. 5. Katedra Nauk o Zwierzętach Przeżuwających a) tematy prac inżynierskie: Determinacja płci - mechanizmy molekularne. Identyfikacja wybranych miejsc polimorficznych genów ważnych w produkcyjności zwierząt przeżuwających. Transgeneza zwierząt – aktualne trendy. Determinacja płci u ssaków - analiza ekspresji wybranych genów Żywność modyfikowana genetycznie. Markery genetyczne jakości produktów pochodzenia zwierzęcego. Detekcja zmienności w wybranych genach gołębia domowego. Polimorfizm genów kodujących miRNA u bydła. Wykorzystanie technik molekularnych w wykrywaniu zafałszowania żywności. Produkcja białek rekombinowanych w układach pro- i eukariotycznych. Mutageneza ukierunkowana w biotechnologii. Metody badania transkryptomów. Mikromacierze ekspresyjne – analiza danych. b) tematy prac magisterskie: Cytogenetyczne i molekularne podłoże zaburzeń w determinacji płci u ssaków z wykorzystaniem modelowych zwierząt gospodarskich. Określanie polimorfizmu w genach kandydujących oraz potencjalny wpływ na cechy użytkowe i rozrodcze zwierząt gospodarskich. Analiza polimorfizmu oraz ekspresji wybranych genów gołębia domowego (Columba livia var. domestica). Analiza ekspresji genów białek mleka w komórkach nabłonkowych gruczołu mlekowego. Analiza ekspresji genów cytoszkieletu w komórkach nabłonkowych gruczołu mlekowego. Analiza procesu chondrogenezy w warunkach in vitro. Determinacja płci u ssaków - analiza ekspresji wybranych genów. Markery genetyczne jakości produktów pochodzenia zwierzęcego. Markery genetyczne cech użytkowych bydła. Genetyczne podłoże gąbczastej encefalopatii bydła. Detekcja zmienności w wybranych genach gołębia domowego. Polimorfizm genów kodujących miRNA u bydła. Mikromacierze ekspresyjne – analiza danych. Polimorfizm genetyczny u krów w aspekcie cech rozrodczych 6. Katedra Hodowli Trzody Chlewnej, Żywienia Zwierząt i Żywności a) tematy prac: Efektywność biologicznego oczyszczania ścieków na przykładzie wybranej oczyszczalni. Wykorzystanie osadów pościekowych z miejskich oczyszczalni ścieków. Możliwość zastosowania fermentacji metanowej do unieszkodliwienia odpadów biodegradowalnych na terenie Polski. Odnawialne źródła energii – możliwości rozwoju w Polsce. Związek polimorfizmu genów z cechami użytkowymi świń Wpływ ziół na wskaźniki biochemiczne krwi świń Cechy prozdrowotne żywności pochodzenia roślinnego. Walory żywieniowe i zastosowanie orkiszu pszennego. Gryka – cenny surowiec w produkcji żywności funkcjonalnej. Żywieniowo-profilaktyczna wartość ziarniaków gryki. Hypocholesterolemiczne lub hipercholesterolemiczne działanie wtórnych metabolitów roślin. Ocena zawartości włókna pokarmowego w wybranych ziarnach zbóż lub nasion roślin strączkowych. Szczur laboratoryjny jako zwierzę eksperymentalne w doświadczeniach żywieniowych. Ocena wartości pokarmowej białka soi transgenicznej w badaniach na szczurach laboratoryjnych. Wpływ dodatku aminokwasów syntetycznych na podwyższenie wartości odżywczej i biologicznej białka zestawów paszowych z udziałem wytłoków rzepakowych. Analiza efektywności usuwania zanieczyszczeń ze ścieków na przykładzie wybranej oczyszczalni. Dodatki żywieniowe a wybrane wskaźniki biochemiczne w surowicy świń. Ocena pierwiastków biogennych i związków organicznych w wodach powierzchniowych w różnych porach roku. Ocena wybranych wskaźników biochemicznych w aspekcie cech produkcyjnych świń. 6. Katedra Immunologii, Mikrobiologii i Chemii Fizjologicznej a) tematy prac inżynierskich: Mechanizmy neoangiogenezy. Udział cząsteczek adhezji międzykomórkowej w inwazji nowotworowej i wybiórczej lokalizacji ognisk przerzutowych. Ocena in vitro antybakteryjnego i antygrzybiczego działania olejków eteryczynych otrzymanych z Thymus serpyllum L. (macierzanki piaskowej). Opracowanie narzędzi bioinformatycznych wykorzystywanych w badaniach mikrobiologicznych. Poszukiwanie diagnostycznych markerów do identyfikacji bakterii. Molekularne markery chorobotwórczości bakterii z rodzaju Staphylococcus. Modyfikacje celulozy bakteryjnej wytwarzanej przez bakterie z rodzaju Gluconacetobacter. Optymalizacja procesu wytwarzania celulozy bakteryjnej. b) tematy prac magisterskich: Izolacja, identyfikacja i zastosowanie fagów środowiskowych. Analiza lekooporności bakterii izolowanych z żywności. Wykorzystanie celulozy bakteryjnej wytwarzanej przez bakterie z rodzaju Gluconacetobacter do procesów immobilizacji. Optymalizacja procesu wytwarzania celulozy bakteryjnej pod kątem wykorzystania w procesach immobilizacji. Właściwości strukturalne i katalityczne tyrozynaz ze szczepów Streptomyces sp. Analiza właściwości strukturalnych i katalitycznych glikohydrolaz z wykorzystaniem metod modelowania molekularnego. Charakterystyka oraz ocena potencjału aplikacyjnego wybranych bakteriofagów środowiskowych. Ocena aktywności przeciwdrobnoustrojowej olejków eterycznych wobec wybranych patogenów bakteryjnych z użyciem narzędzi bioinformatycznych. Charakterystyka bakteriofaga środowiskowego EC/G/03-2015 wyizolowanego ze świńskiej gnojowicy. Utlenianie lipidów w mięsie drobiowym. Identyfikacja i różnicowanie rotawirusów w oparciu o analizę in silico wybranych fragmentów ich genomu oraz próba opracowania na tej podstawie wiarygodnego testu diagnostycznego. Pracownia Towaroznawstwa Produktów Spożywczych a) tematy prace inżynierskich: Cele i kierunki modyfikacji genetycznych drobnoustrojów wykorzystywanych w przemyśle spożywczym. Biotechnologiczne metody otrzymywania żywności funkcjonalnej. Wykorzystanie wybranych drobnoustrojów w biosyntezie podstawowych składników żywności. Kierunki modyfikacji genetycznych drożdży browarniczych i winiarskich. Wykorzystanie grzybów strzępkowych w przemyśle spożywczym. Biosynteza wybranych grup enzymów dla przemysłu spożywczego. Mikroorganizmy w produkcji wybranych aminokwasów. Wpływ efektywnych mikroorganizmów (probiotyków), bakteriocyn i bakteriofagów na organizm zwierząt gospodarskich oraz surowce od nich uzyskane. b) tematy prace magisterskich: Wykorzystanie kultur bakteryjnych SafePro do wydłużenia trwałości mięsa i wybranych produktów mięsnych. Wpływ bakteryjnych kultur biokonserwujących na kształtowanie się cech sensorycznych mięsa i półproduktów mięsnych. Wpływ temperatury i czasu przechowywania na cechy organoleptyczne i jakość mikrobiologiczną mlecznych napojów fermentowanych. Wpływ wybranych czynników na żywotność kultur probiotycznych w produktach mleczarskich. Wpływ zastosowania efektywnych mikroorganizmów (probiotyków) w tuczu świń i drobiu na wyniki produkcyjne i jakość mięsa. Wpływ zastosowania probiotyków w tuczu świń i drobiu na aktywność enzymów mięśniowych, koncentracje mikro- i makroelementów, profil kwasów tłuszczowych oraz zawartość cholesterolu w mięsie. 7. Zakład Hodowli Ptaków Użytkowych i Ozdobnych a) tematy prac: Skuteczność hodowli in vitro w zależności od czasu inkubacji in ovo zarodków przepiórek Porównanie hodowli in vitro zarodków przepiórczych w kontenerach lub skorupach zastępczych Analiza rozwoju i przeżywalności zarodków przepiórki japońskiej (Coturnix japonica) w hodowli in vitro prowadzonej w kontenerkach i skorupach zastępczych. Hodowle in vitro zarodków przepiórczych w kontenerach zastępczych 8. Pracownia Anatomii Zwierząt a) tematy prac inżynierskich Regulacja hormonalna w rozrodzie norki amerykańskiej. Warunki świetlne a wyniki rozrodu norki amerykańskiej b) tematy prace magisterskich: Biochemiczne wskaźniki krwi norek w okresie ciąży i odchowu norcząt. Odziedziczalność parametrów rozrodu oraz jakości okrywy włosowej u zwierząt futerkowych. 9. Katedra Mikrobiologii i Biotechnologii Stosowanej a) tematy prac magisterskich: Antymikrobiologiczna aktywność związków produkowanych przez szczepy z rodzaju Bacillus. Zmienność mikroflory w systemach akwaponicznej hodowli roślin. Identyfikacja przyczyn/y psucia się (i źródeł zanieczyszczeń) naturalnych soków jabłkowych – prewencja. Ocena wpływu paszy suplementowanej mikroflorą probiotyczną na mikrobiocenozę przewodu pokarmowego zwierząt hodowlanych. Aktywność antymikrobiologiczna szczepów z rodzaju Bacillus Zmienność mikroflory w systemach akwaponicznej w hodowli roślin Identyfikacja przyczyny psucia się i źródeł zanieczyszczeń naturalnych soków jabłkowych - prewencja 10. Katedra Fizjologii Roślin i Biochemii a) tematy prac magisterskich Wpływ zasolenia na parametry fizjologiczne dwóch odmian wierzby wiciowej (Solix viminalis). Wybrane parametry fizjologiczne wierzby wiciowej rosnącej w warunkach stresowych. 11. Centrum Bioimmobilizacji i Innowacyjnych Materiałów Opakowaniowych a) tematy prac magisterskich: Aktywność powlekanych folii polilaktydowych względem bakterii Gram-dodatnich. Aktywność powlekanych folii polilaktydowych względem bakterii Gram-ujemnych. Aktywność powlekanych folii polietylenowych względem bakterii Gram-dodatnich. Aktywność powlekanych folii polietylenowych względem bakterii Gram-ujemnych. Zastosowanie procesów bioimmobilizacji w hodowli alg.