Zarządzanie i Inżynieria Produkcji Nowoczesne technologie i innowacje w produkcji rolniczej Kod przedmiotu: Rok/Semestr: 2011/2012 letni Nazwa: Biotechnologia w rolnictwie Typ studiów: I st. Inżynierskie Rodzaj kursu: obligatoryjny Semestr studiów: 6 Punkty ECTS: 5 Formy kształcenia (wykłady/ ćwiczenia) – godz.: 15/30 Prowadzący: prof. dr hab. Ewa Sawicka-Sienkiewicz Język: polski Efekty kształcenia: Student zna podstawowe metody biotechnologii wykorzystywane w rolnictwie dla doskonalenia roślin uprawnych – posiada ogólną wiedzę o budowie genomu roślin rolniczych – zna podstawy genomiki strukturalnej i funkcjonalnej i rozumie zależności występujące pomiędzy grupami spokrewnionych roślin. Rozumie zalety otrzymywania lepszych odmian przy zastosowaniu metod biotechnologicznych w połączeniu z krzyżowaniem oddalonym (kultury in vitro –linie DH, markery DNA typu MAS, otrzymywanie roślin GM, zastosowanie mutagenezy i wykorzystanie technik odwrotnej genetyki np. TILLING do wytwarzania nowej zmienności). Umiejętności: Student zna wyposażenie laboratorium kultur tkanek roślinnych i diagnostyki molekularnej oraz obowiązujące zasady bezpiecznej pracy z DNA. Ma opanowane podstawowe metody zakładania kultur in vitro, przygotowywania pożywek i sterylizacji materiału roślinnego. Rozumie zasady izolacji DNA, reakcji PCR i elektroforezy. Rozumie potrzebę zachowania sterylnych warunków w laboratorium i podczas pracy. Kompetencje społeczne (postawy): Student rozumie zależności doskonalenia roślin uprawnych a zastosowanie i wykorzystanie roślin uprawnych w nowoczesnym rolnictwie. Ma świadomość odpowiedzialności za wspólnie realizowane prace w zespole – wykazuje odpowiedzialność za powierzony sprzęt – rozumie konieczność przestrzegania zasad higieny w związku z koniecznością zachowania aseptycznych warunków w laboratorium. Wymagania wstępne: biochemia, genetyka i hodowla roślin Treści kształcenia Osiągnięcia z zakresu biotechnologii roślin, wykorzystanie tych metod w praktyce hodowlanej rolniczej, ogrodniczej i leśnej. Techniki stosowanych w kulturze in vitro i podkreślenie możliwości stosowania ich w praktyce dla przyśpieszenia i ułatwienia selekcji. Sposoby badania polimorfizmu DNA (markery molekularne) i korzyści płynących z ich stosowania. Wykorzystanie w praktyce rolniczej i ogrodniczej roślin genetycznie modyfikowanych, sposobów ich otrzymywania i rozpoznawania. Zastosowanie metod biotechnologii w postępie biologicznym. Literatura: 1. Biotechnologia roślin. 2007. Pod red. S. Malepszego. PWN, Warszawa; 2. Komórki roślinne w warunkach stresu. Tom II. Komórki in vitro. Pod red. A. Woźnego i K. Przybył. Wydawnictwo Naukowe UAM, Poznań, 2004; 3. Hodowla roślin z elementami genetyki biotechnologii. 2009. Pod red. Barbary Michalik. PWRiL; 4. Buchowicz. J. 2007. Biologia molekularna. Wyd. Nauk. PWN; 5. T.A. Brown. 2009. Genomy. Wyd. Nauk. PWN. Metody oceny: zaliczenie ćwiczeń, kolokwia, zaliczenie końcowe obejmujące treści wykładów i ćwiczeń. Szczegółowa tematyka wykładów i ćwiczeń: Wykłady 1. Określenie dziedziny wiedzy – biotechnologia – historia. Powtórzenie budowy DNA i kodu genetycznego. Znaczenie zmienności w doskonaleniu odmian roślin uprawnych - 2h 2. Metoda kultury in vitro (typy kultur, pożywki), mikropropagacja w ogrodnictwie i rolnictwie - 2h 3. Uwalnianie roślin od wirusów (chemioterapia, termoterapia, krioterapia, kultura in vitro izolowanych merystemów), zastosowanie somatycznych zarodków w tworzeniu sztucznych nasion -2h 4. Otrzymywanie mieszańców międzygatunkowych i międzyrodzajowych (oddalonych), mieszańce somatyczne (fuzja protoplastów) – przełamywanie barier niekrzyżowalności, kultury zarodków -2h 5. Wykorzystanie mieszańców oddalonych w hodowli roślin uprawnych (poliploidy, znaczenie) -2h 6. Otrzymywanie roślin haploidalnych oraz linii podwojonych haploidów (krzyżowanie oddalone, androgeneza i gynogeneza) - 2h 7. Wykorzystanie linii podwojonych haploidów w hodowli roślin uprawnych dla przyspieszenia procesu otrzymywania odmian -2h 8. Markery molekularne, typy markerów, poszukiwanie markerów sprzężonych z genami, techniki QTL dla cech ilościowych -2h 9. Markery molekularne typu MAS w selekcji odporności na patogeny i szkodniki oraz inne ważne rolniczo cechy, Mapy genetyczne i wykorzystanie ich w hodowli roślin -2h 10. Budowa genomu. Genomika strukturalna i funkcjonalna. Poznawanie funkcji genów, elementy ruchome transpozomy -2h 11. Mutageneza w hodowli roślin uprawnych (mutacje a faza rozwojowa komórki - mutacje punktowe, aberracje chromosomowe, aberracje liczbowe). Zastosowanie nowoczesnych metod biotechnologii do identyfikacji mutantów, na podstawie metod odwrotnej genetyki – system TILLING -2h 12. Transformacja u roślin, (mutageneza insercyjna) – izolacja genu, konstrukcja genowa, system wektorów binarnych, wprowadzenie konstrukcji genowej do komórki roślinnej – metody: wektorowe, bezpośrednie) - 2h 13. Rośliny GMO w rolnictwie– znaczenie i perspektywy (odporność na stresy, odporność na herbicydy, patogeny, szkodniki, ulepszone cechy użytkowe – wartość żywieniowa) -2h 14. Znaczenie GMO w medycynie i przemyśle – terapia genowa, biofabryki roślinne i zwierzęce, ksenotransplantacje nowe biofarmaceutyki, osiągnięcia mikrobiologii i wykorzystanie w przemyśle farmaceutycznym – 2h 15. Podsumowanie znaczenia biotechnologii w rolnictwie. Społeczne i prawne skutki wykorzystania GMO w rolnictwie. Zasady dopuszczenia do uprawy roślin GMO -2h Ćwiczenia 1. Powtórzenie wiadomości z genetyki klasycznej i molekularnej niezbędnych do zrozumienia zagadnień z hodowli i biotechnologii -2h 2. Wykorzystanie zmienności biologicznej, zastosowanie biotechnologicznych metod do poszerzania zmienności. Charakterystyka źródeł zmienności i ich wykorzystanie -2h 3. Znaczenie biologii kwitnienia w hodowli roślin. Samoniezgodność, rozdzielnopłciowość, determinacja płci. Metody selekcji i zależność od biologii rozmnażania (płodność pyłku i przerastanie łagiewek pyłkowych) -2h 4. Zastosowanie metod biotechnologicznych (przygotowanie pożywek, sterylizacja materiału i zakładanie kultury) -2h 5. Tworzenie map genetycznych. Mapowanie genomów. Wykorzystanie linii wsobnych i podwojonych haploidów do mapowania. Zastosowanie w hodowli – 2h 6. Sposoby rozmnażania materiałów hodowlanych przy zastosowaniu biotechnologicznych metod. Mikrorozmnażanie w hodowli roślin ogrodniczych – 2h 7. Identyfikacja odmian metodami molekularnymi, rodzaje markerów (zastosowanie markerów DNA) – 2h 8. Zajęcia praktyczne w laboratorium (izolacja DNA) – 2h 9. Zasady działania termocyklera, przeprowadzenie reakcji PCR elektroforezy (demonstracja, wykonanie niektórych fragmentów procesu) 10. Wizualizacja produktów reakcji PCR, odczyt i interpretacja. Zastosowanie do identyfikacji odmian 11. Zastosowanie metod biotechnologii w praktyce, w hodowli roślin – zasady tworzenia podwojonych haploidów, otrzymywanie sztucznych nasion, wykorzystanie markerów molekularnych na przykładzie roślin ogrodniczych – 2h 12. Prowadzenie obserwacji wzrostu wcześniej założonej kultury, wykonanie pomiarów i analiza zdolności morfogenetycznych badanego materiału (marchew, tytoń) – 2h 13. Statystyczne opracowanie wyników 14. Zasoby genowe – gromadzenie kolekcji. Instytucje tworzące banki genów - 2h 15. Zwiedzanie szklarni i pracowni kultur in vitro w Arboretum Leśnym (lub w Leśnym Banku Genów w Kostrzycy) - 2h