potencjał badawczy ib pan

POTENCJAŁ BADAWCZY INSTYTUTU
BOTANIKI im. W. SZAFERA
POLSKIEJ AKADEMII NAUK
Warszawa 2017
Fot. Marcin Zięba (Polish-Swiss Research Programme)
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN to nowoczesna
placówka naukowa prowadzącą badania z zakresu:
 ekologii teoretycznej i stosowanej;
 fitogeografii;
 badań genetycznych, w tym analiz
filogenetycznych i filogeograficznych;
 taksonomii roślin naczyniowych,
mszaków, glonów, grzybów,
porostów i śluzowców;
 systematyki ewolucyjnej;
 geobotaniki;
 różnorodności flor współczesnych
i kopalnych.
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Profil badań
Analityka
chemiczna
Kryminalistyka
Inżynieria
i ochrona
środowiska
Biotechnologia
& Life Science
 wpływ zanieczyszczeń powietrza na
środowisko;
 biologia i ekologia organizmów w terenach
obciążonych metalami ciężkimi;
 renaturyzacja obszarów zdegradowanych;
 struktura bioróżnorodności i dynamika
jej zmian w czasie i przestrzeni;
 badania nad taksonomią, florystyką
i biogeografią różnych grup organizmów.
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Oferta IB PAN
 specjalistyczne analizy chemiczne z zakresu ekotoksykologii cieczy
(wody płynące, opady atmosferyczne)
oraz ciał stałych (składu chemicznego roślin i innych organizmów);
 analizy i ekspertyzy z zakresu biologicznej oceny czystości wód;
 specjalistyczne badania z zastosowaniem laboratoryjnych analiz
zmienności DNA w próbach roślin i grzybów z populacji dzikich
i hodowlanych, a także kultur tkankowych;
 ekspertyzy mykologiczne pomieszczeń mieszkalnych i użytkowych,
materiałów budowlanych;
 ocena obecności i uszkodzeń wywołanych przez grzyby
w zabytkach kultury – pomniki, elewacje, obrazy olejne, gwasze,
akwarele, tkaniny;
 badania z zastosowaniem analizy pyłkowej i analizy szczątków
makroskopowych wspomagające procesy identyfikacji, znajdujące
zastosowanie w kryminalistyce.
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
.
Stacja terenowa Zakładu Ekologii IB PAN
Doskonale wyposażone pracownie:
 laboratorium chromatograficzne;
 laboratorium spektrofotometrii;
 laboratorium analiz siarki i węgla;
 laboratorium analiz azotu i inne;
 i inne umożliwiające wykonywanie specjalistycznych
analiz chemicznych z zakresu ekotoksykologii
na poziomie światowym.
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Aparatura badawcza dostępna w Stacji
Chromatograf gazowy
3900 Saturn 2100T
GC/MS firmy Varian
z detektorem masowym
typu pułapka jonowa
Chromatograf gradientowy
Dionex-500 i automatyczny
ekstraktor prób ASE
Varian 280FS Zeeman
Spektrofotometr
absorpcji atomowej
Analizator
LECO AMA 254
Analizator firmy
LECO RC 612
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Przykładowe projekty
 Zmienność stechiometrii pierwiastków
w mchu Pleurozium schreberi w dużej skali
przestrzennej (Polska) w warunkach
zróżnicowanej antropopresji
 Effects of heavy metal deposition in Poland
using bryophytes as bioindicators
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Przykładowe projekty
Adaptation of Arabidopsis halleri to metal-polluted soils:
linking environmental, genomic, and phenotypic information
Poznanie genetycznych i fizjologicznych podstaw tolerancji
i hiperakumulacji metali ciężkich u roślin
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Pracownia Analiz Molekularnych
 sekwencjonowanie regionów DNA metodą Sangera;
 klasyczne genotypowanie osobników
(metoda AFLP – Amplified Fragment Length Polymorphism);
 sekwencjonowanie i genotypowanie masowe DNA
w oparciu o sekwencjonowanie NGS.
Analizy profilów restrykcyjnych DNA
Fragment matrycy genotypowania AFLP
Warszawa
29-31.03.2017 r.
Elektroferogramy
sekwencjonowania
metodą Sangera
Fragment matrycy sekwencjonowania NGS
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Przykładowe projekty
DRYADE: The fate of ecological interactions in
a changing climate: using next-generation sequencing
technologies to unravel adaptive and historical
processes in a community of interrelated arctic-alpine
organisms (2012–2016)
Warszawa
29-31.03.2017 r.
Ewolucja i historyczna dynamika zasięgów lądowej
bioty Antarktyki w świetle szczegółowych analiz
filogeograficznych endemicznych gatunków mchów
(2016–2019)
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Aparatura badawcza dostępna w Pracowni
 kompletna platforma laboratoryjna do analiz z wykorzystaniem
klasycznego sekwencjonowania i genotypowania;
 kompletna platforma laboratoryjna do analiz z wykorzystaniem
sekwencjonowania nowej generacji (NGS) z odrębnym zapleczem
do analiz DNA zdegradowanego (próby muzealne i środowiskowe).
Sekwenator NGS
Illumina Miseq
TapeStation 4200 – aparat do
precyzyjnego ilościowego i jakościowego
profilowania próbki DNA
Automatyczny sekwenator
8-kapilarowy ABI 3500
Pippin Prep
Ultrasonikator Covaris
– aparat do precyzyjnego
– aparat do precyzyjnej
frakcjonowania DNA
fragmentacji cząsteczek DNA
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN
Tissue Lyser – aparat do
homogenizacji materiału
biologicznego
Termocyklery Veriti (Life Technologies)
i Nexus (Eppendorf)
– aparaty do kierunkowej amplifikacji DNA
FireReader UVITEC Cambridge
– system do archiwizacji
i analizy danych z żeli
elektroforetycznych
Instytut Botaniki im. W. Szafera PAN