instytut biologii eksperymentalnej

Biologia
eksperymentalna
to
połączenie
zdobyczy
merytorycznych i metodycznych fizjologii, cytologii, biochemii,
biologii molekularnej i biotechnologii organizmów roślinnych
i zwierzęcych, tak w odniesieniu do pojedynczego organizmu, jak
i całych grup organizmów funkcjonujących w określonym
środowisku.
Poznanie funkcjonowania określonego organizmu na wszystkich
szczeblach jego organizacji w warunkach prawidłowych
i stresowych pozwala na badanie metabolizmu w zależności od
warunków środowiskowych, ale dopiero rozszerzenie warsztatu
badawczego o wzajemne relacje i podstawy współistnienia wielu
organizmów pozwala prognozować jego zmiany.
Zdobywanie
wiedzy i umiejętności
I stopień - Blok licencjacki: biologia eksperymentalna
II stopień - Studia magisterskie sp. biologia eksperymentalna
III stopień – Stacjonarne Studia Doktoranckie Mikrobiologii,
Biotechnologii i Biologii Eksperymentalnej
 indywidualne podejście do każdej pracy
z uwzględnieniem pomysłów własnych studenta
 pomoc merytoryczną i techniczną przy rozwiązywaniu
problemów naukowych
 możliwość uczestniczenia w konferencjach,
sympozjach, warsztatach - pod warunkiem prezentacji
wyników
 publikacja wyników badań (współudział)
 pomoc przy organizowaniu stażu w kraju czy za granicą
Absolwent Biologii Eksperymentalnej:
 potrafi wykonać analizę każdego materiału
biologicznego stosując różnorodne, nowoczesne
techniki badawcze i analityczne
 jest przygotowany do pracy z podstawową i wysoko
specjalistyczną aparaturą analityczno-diagnostyczną
 jest merytorycznie i praktycznie przygotowany do
pracy w jednostkach naukowo-badawczych,
laboratoriach kontrolnych i diagnostycznych,
przemyśle farmaceutycznym, spożywczym,
kosmetycznym i rolnictwie, placówkach ochrony
przyrody i zdrowia oraz w szkolnictwie
JEDNOSTKI oferujące możliwość
przygotowywania prac dyplomowych:
 KATEDRA CYTOFIZJOLOGII
 KATEDRA FIZJOLOGII I BIOCHEMII ROŚLIN
 KATEDRA EKOFIZJOLOGII I ROZWOJU ROŚLIN
oraz
 KATEDRA NEUROBIOLOGII
KATEDRA CYTOFIZJOLOGII
Kierownik Katedry:
Prof. dr hab. Janusz Maszewski [email protected]
+48 42 635 45 14
Pracownicy:
dr hab. Andrzej Kaźmierczak [email protected]
dr hab. Katarzyna Popłońska [email protected]
dr hab. Justyna Polit [email protected]
dr hab. Dariusz Stępiński [email protected]
dr Dorota Rybaczek [email protected]
dr Konrad [email protected]
dr Agnieszka Wojtczak [email protected]
dr Aneta Żabka [email protected]
mgr Marta Gabryelczyk …………[email protected]
mgr Dorota Czekalska …………[email protected]
+48 42 635 42 03
+48 42 635 47 34
+48 42 635 47 36
+48 42 635 47 34
+48 42 635 47 35
+48 42 635 47 34
+48 42 635 47 36
+48 42 635 45 14
+48 42 635 45 14
Doktoranci:
mgr Magdalena Doniak …………[email protected]
mgr Anita Kunikowska …….…..…[email protected]
KATEDRA CYTOFIZJOLOGII
Tematyka badań:
 Mechanizmy regulacji procesów kondensacji chromatyny
i chromosomów.
 Regulacja procesów transkrypcji.
 Mechanizmy procesów fosforylacji i defosforylacji w cyklu
komórkowym.
 Udział aktywności proteolitycznej proteasomów oraz rola ER
w procesie spermiogenezy.
 Struktura i funkcjia lipotubuloidów i mikrotubul w ruchu
obrotowym kul lipidowych.
 Struktura i funkcja jąderek w komórkach merystematycznych
korzeni.
 Mechanizmy regulacji procesu determinacji płci i morfogenezy
u roślin.
 Indukcja i mechanizmy regulacji programowanej śmierci
komórki.
 Udział hormonów roślinnych w regulacji wzrostu i rozwoju
komórek roślinnych.
KATEDRA CYTOFIZJOLOGII
Metodyka badań:
Klasyczna mikroskopia świetlna i fluorescencyjna.
Mikroskopia elektronowa.
Agarozowa i poliakrylamidowa elektorforeza żelowa.
Cytochemia, immunocytochemia i metody „immunoblot”.
Spektrofotometria i mikrocytofotometria.
Chromatografia cienkowarstwowa i jonowymienna oraz
sączenie molekularne.
 Analizy ilościowe metabolitów komórkowych, a w tym
kwasów nukleinowych, cukrów, białek, hormonów roślinnych
i aktywności enzymatycznej.






KATEDRA CYTOFIZJOLOGII
Prace dyplomowe:
Prace magisterskie
„Rola kinetyny w długotrwałym wzroście siewek Vicia faba ssp. minor”
„Indukcja programowanej śmierci komórki (PCD) w korzeniach siewek
bobiku (Vicia faba ssp. minor) z wykorzystaniem kinetyny”
„Wpływ stresu replikacyjnego na przebieg procesów mitotycznych
w merystemach korzeni Allium cepa”
„Indukcja przedwczesnej kondensacji chromosomów (PCC) w
merystematycznych komórkach korzeni Allium cepa poddanych ciągłemu
działaniu hydroksymocznika i kofeiny”
Prace licencjackie
„Cykl komórkowy i śmierć komórki jako podstawowe mechanizmy regulacji
liczby komórek w organizmach eukariotycznych”
„Endoreduplikacja w pracach naukowych Katedry Cytofizjologii Uniwersytetu
Łódzkiego”
„Nieinwazyjne metody oceny oocytów i embrionów ludzkich”
„Od jednej komórki do nowotworu”
„Endosymbiotyczne pochodzenie mitochondriów i chloroplastów.”
KATEDRA CYTOFIZJOLOGII
Koła Naukowe
W Katedrze Cytofizjologii działają:
Koło Naukowe Biologów Komórki „Homunculus”
pod opieką :
Prof. dr. hab. Janusza Maszewskiego
Prof. nadzw. Andrzeja Kaźmierczaka
Dr hab. Justyny Polit
Dr. Konrada Winnickiego
Dr Doroty Rybaczek
Dr Anety Żabki
oraz
Sekcja Koła Naukowego Biologów „Iris”
pod opieką :
Dr hab. Katarzyny Popłońskiej
Dr. hab. Dariusza Stępińskiego
Dr Agnieszki Wojtczak
KATEDRA FIZJOLOGII
I BIOCHEMII ROŚLIN
Kierownik Katedry:
prof. dr hab. Maria Skłodowska
ul. Banacha 12/16,
budynek A, poziom IIA
[email protected]
tel. (42) 635 44 20
dr hab. Elżbieta Kuźniak-Gębarowska, prof. UŁ
[email protected]
tel. (42) 635 44 14
dr hab. Urszula Małolepsza, prof. UŁ
[email protected]
tel. (42) 635 44 19
dr hab. Jacek Patykowski, prof. UŁ
[email protected]
tel. (42) 635 44 18
dr hab. Ewa Gajewska, prof. UŁ
[email protected]
tel. (42) 635 44 16
dr Katarzyna Bergier
[email protected]
tel. (42) 635 44 18
dr Marzena Wielanek
[email protected]
tel. (42) 635 44 16
dr Anna Wyrwicka
[email protected]
tel. (42) 635 44 16
dr Marcin Naliwajski
[email protected]
tel. (42) 635 44 18
Pracownicy:
Doktoranci:
mgr inż. Joanna Chojak
mgr Tomasz Kopczewski
mgr Justyna Nawrocka
mgr Agata Nowogórska
mgr Monika Skwarek
KATEDRA FIZJOLOGII I BIOCHEMII ROŚLIN
Tematyka badawcza:
Wpływ czynników środowiskowych na rośliny
• Biochemiczne mechanizmy odporności roślin na patogeny oraz szkodniki
• Indukcja naturalnych reakcji obronnych roślin na czynniki infekcyjne
z wykorzystaniem elicytorów, biostymulatorów, grzybów Trichoderma
• Odporność roślin na stres abiotyczny (zasolenie, kwaśny deszcz, metale
śladowe) na poziomie organów i organelli (chloroplasty, mitochondria)
• Metaboliczne i hormonalne reakcje roślin na stres wieloczynnikowy
• Wpływ warunków glebowych na rozprzestrzenianie się gatunków roślin
endemicznych oraz gatunków obcych i ekspansywnych
• Ocena fitotoksyczności prób środowiskowych (gleba, woda, osady ściekowe)
skażonych trwałymi zanieczyszczeniami organicznymi oraz metalami ciężkimi
• Fitoremediacja - makrofity w systemie biofiltracyjnym
• Antyoksydanty i metabolity wtórne w kontekście odporności roślin oraz
roślin jako źródła nutraceutyków i farmaceutyków
KATEDRA FIZJOLOGII I BIOCHEMII ROŚLIN
Tematyka badawcza:
Wykorzystanie roślinnych kultur in vitro
• Mikrorozmnażanie roślin leczniczych, ozdobnych, użytkowych, ginących
• Biosynteza związków bioaktywnych o właściwościach prozdrowotnych
i leczniczych oraz biokosmeceutyków, barwników, antyoksydantów
i ekologicznych środków ochrony roślin
• Biotransformacja jako źródło nowych związków dla prewencji i leczenia
chorób cywilizacyjnych
• Fitoremediacja – kultury korzeni transformowanych w systemie biofiltracji
i biodegradacji
KATEDRA FIZJOLOGII I BIOCHEMII ROŚLIN
Metodyka badań:
• Hodowla roślin w glebie, hydroponiczna, in vitro
• Izolacja organelli komórkowych
• Spektrofotometryczne i fluorymetryczne oznaczanie aktywności enzymów
i stężenia związków
• Immunochemiczne oznaczanie zawartości hormonów roślinnych
• Histochemiczne oznaczanie reaktywnych form tlenu
• Identyfikacja i oznaczanie zawartości metabolitów za pomocą
wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC) i spektrometrii mas (MS)
• Biotesty aktywności przeciwdrobnoustrojowej metabolitów wtórnych
• Mikroskopia fluorescencyjna i konfokalna
• Elektroforeza białek w żelu poliakrylamidowym w warunkach natywnych
i denaturujących
KATEDRA FIZJOLOGII
I BIOCHEMII ROŚLIN
Przykładowe tematy prac licencjackich:
•Żurawina – zdrowie w naturze
•Mikoryza – podziemny świat ekosystemu
•Kawa i herbata - wpływ na zdrowie człowieka
•Rośliny alchemików
•Biomasa roślinna jako energia przyszłości
•Rośliny jako źródło związków biologicznie czynnych – zielona apteka
•Psychoaktywne rośliny i grzyby
•Związki pochodzenia roślinnego stosowane w profilaktyce i leczeniu otyłości
•Choroby nowotworowe – rola roślinnych składników diety w profilaktyce raka
•Elicytory – indukcja odporności u roślin
KATEDRA FIZJOLOGII
I BIOCHEMII ROŚLIN
Przykładowe tematy prac magisterskich:
• Wpływ wybranych szczepów Trichoderma na przeżywalność form
przetrwalnych grzybów patogenicznych i ochronę roślin
• Właściwości fitoremediacyjne kultur korzeni transformowanych Tropaeolum
majus L. i Oxalis triangularis L.
• Zmiany aktywności wybranych enzymów antyoksydacyjnych w siewkach
drzew iglastych po ataku owadów
• Wpływ traktowania selenem na toksyczność niklu w siewkach pszenicy
• Biosynteza związków bioaktywnych w kulturach korzeni transformowanych
Codonopsis pilosula i Saussurea nepalensis
• Rola BTH i arbutyny w indukcji odporności roślin na Pseudomonas syringae
• Wybrane parametry biochemiczne makrofitów zastosowanych w modelowym
systemie biofiltracyjnym (MBS)
• Wpływ selenu na przeciwgrzybiczą aktywność metabolitów wtórnych korzeni
transformowanych wybranych gatunków roślin
KATEDRA FIZJOLOGII
I BIOCHEMII ROŚLIN
Sekcja Fizjologii i Ekobiotechnologii
Studenckiego Koła Naukowego Biologów
Opiekun naukowy Sekcji:
dr Anna Wyrwicka
UDZIAŁ W KONFERENCJACH MŁODYCH NAUKOWCÓW
WARSZTATY DLA LICEALISTÓW
NOC BIOLOGÓW
FESTIWAL NAUKI, TECHNIKI I SZTUKI
KATEDRA EKOFIZJOLOGII
I ROZWOJU ROŚLIN
Kierownik Katedry:
dr hab. Małgorzata M. Posmyk ................... [email protected]
635-44-22
Pracownicy:
dr hab. Zdzisława Romanowska-Duda ….. [email protected]
635-44-21
dr Katarzyna Szafrańska ............................ [email protected]
635-44-21
Dr Agnieszka Kobylińska …………………. [email protected]
635-44-21
Katarzyna Opas..............................................katka@biol.uni.lodz.pl
635-44-21
Doktoranci:
mgr Krzysztof Piotrowski
mgr Izabela Kołodziejczyk
mgr Agata Pszczółkowska
mgr Wiktor Pszczółkowski
90-237 Łódź, ul. Banacha 12/16,
budynek A, poziom IB, p. 136, 171, 174
budynek A, poziom -IB, p. 027
Tematyka badań KEiRR:
Fizjologiczne i biochemiczne mechanizmy odporności roślin
na abiotyczne stresy środowiskowe.
Priming i biostymulacja roślin uprawnych / ogrodowych
w kontekście ich aklimatyzacji do suboptymalnych warunków
środowiska.
Uszlachetnianie materiałów siewnych poprzez dobór
i zastosowanie różnych technik kondycjonowania nasion
z jednoczesną aplikacją substancji czynnych / ochronnych.
Melatonina jako potencjalny fitobiostymulator .
Badanie antyoksydacyjnych własności związków
pochodzenia roślinnego - w kontekście ich wykorzystania do
fitoterapii jako: suplementy diety, żywność funkcjonalna,
biokosmeceutyki itp.
Tematyka badań KEiRR:
Wpływ czynników abiotycznych na wzrost i rozwój roślin.
Indukcja i regulacja procesu śmierci komórek roślinnych
(model BY-2).
Nowe strategie optymalizacji uprawy biomasy roślin
energetycznych z wykorzystaniem innowacyjnej
technologii stosowania metabolitów glonów i
Cyanobacteria celem ograniczenia nawozów sztucznych
w ekologicznej produkcji roślin energetycznych.
Fitoremediacja jako nowy obszar wykorzystania roślin
energetycznych w odnowie środowiska i renaturyzacji
wód.
Allelopatyczne oddziaływania makrofitów i fitoplanktonu
w zbiornikach śródlądowych.
Metodyka KEiRR:
Hodowle tradycyjne (w glebie), hydroponiczne i in vitro.
Biotesty, testy fizjologiczne.
Pomiar aktywności fotosyntetycznej i fluorescencji chlorofilu.
Analizy biochemiczne, testy enzymatyczne.
Proteomika - rozdziały elektroforetyczne jedno i dwuwymiarowe.
Zapraszamy do zapoznania się z galerią posterów prezentujących
tematykę badań KEiRR: budynek A, poziom IB, p.136 (w korytarzu)
Wymagania względem
studentów:
•Zaangażowanie.
•Dyspozycyjność.
•Aktywność.
•Język angielski w rozumieniu i piśmie.
•Drugi język mile widziany - np. francuski :)
Prace dyplomowe w KEiRR:
Istnieje możliwość wyboru tematyki pracy zgodnie z zainteresowaniami
studenta po wcześniejszej konsultacji z opiekunem pracy!
Przykładowe tematy prac licencjackich:
• Aronia – lek na XXI wiek.
• Farmakologiczne działanie wybranych związków fenolowych pochodzenia roślinnego.
• Flawonoidy – związki przeciwnowotworowe z roślin.
• Kolory roślin.
• Antocyjany – impresjoniści natury
• Melatonina jako nowy biostymulator roślin
• Odmienne stany świadomości... - alkaloidy halucynogenne.
• Rośliny energetyczne jako przyszłość energii odnawialnej w Polsce.
• Wybrane związki przeciwnowotworowe z roślin.
• Zielona herbata receptą na zdrowe życie.
• Zioła, co nam dają?
Przykładowe tematy prac magisterskich:
Wpływ hydrokondycjonowania nasion z dodatkiem melatoniny na zabezpieczenie aparatu
fotosyntetycznego liści grochu (Pisum sativum L.) przed szkodliwym działaniem parakwatu.
Wpływ melatoniny przedsiewnie aplikowanej do nasion na własności antyoksydacyjne ekstraktów z korzeni
siewek Vigna radiata traktowanych niską temperaturą.
Egzogenna melatonina jako biostymulator i czynnik modyfikujący aktywność enzymów antyoksydacyjnych
w kiełkujących nasionach kukurydzy (Zea mays L.).
Efekt hydrokondycjonowania nasion Vigna radiata z melatoniną na fizjologiczne i biochemiczne parametry
stresu niskiej temperatury. Doświadczenia laboratoryjne i polowe.
Wpływ egzogennej melatoniny na zmiany wywołane niską temperaturą w czasie kiełkowania nasion
i wzrostu siewek ogórka (Cucumis sativus L.) i kapusty białej (Brassica oleracea var. capitata).
Porównanie efektywności dwóch metod przedsiewnej aplikacji egzogennej melatoniny do nasion
kukurydzy (Zea mays L.).
Oddziaływanie preparatów bioalgen i topolin na aktywność fizjologiczną makrofitu Lemna minor.
Allelopatyczne działanie wybranych glonów i Cyanobacteria na wzrost i rozwój roślin z rodziny Lemnaceae.
Udoskonalenie wzrostu i rozwoju Panicum virgatum z użyciem Cyanobacteria.
Kinetyka uwalniania toksyn sinicowych w warunkach naturalnych i laboratoryjnych.
Spirodela oligorrhiza jako bioindykator zanieczyszczeń środowiskowych.
KATEDRA NEUROBIOLOGII
ul. Pomorska 141/143; 90-236 Łódź
Kierownik Katedry:
prof. dr hab. Jan Konopacki
tel. (42) 66 55 680, email: [email protected]
Pracownicy naukowo-dydaktyczni:
dr hab. Maria Krotewicz
tel. (42) 66 55 665, email: [email protected]
dr hab. Marek Wieczorek
tel. (42) 66 55 668, email: [email protected]
dr Renata Bocian
tel. (42) 66 55 674, email: [email protected]
dr Paulina Kaźmierska
tel. (42) 66 55 669, email: [email protected]
dr Tomasz Kowalczyk
tel. (42) 66 55 681, email: [email protected]
dr Magdalena Strzelczuk
tel. (42) 66 55 663, email: [email protected]
Doktoranci:
mgr Magdalena Bajer
mgr Bartosz Caban
mgr Paulina Kłos-Wojtczak
KATEDRA NEUROBIOLOGII
Pracownia elektrofizjologiczna in vitro
Tematyka badań:
• Podstawy zjawisk oscylacji i synchronizacji w ośrodkowym
układzie nerwowym.
• Mechanizmy generowania rytmu theta rejestrowanego
w formacji hipokampa (HPC) oraz obszarze tylnego
podwzgórza (PHa) w warunkach pozaustrojowych.
• Aktywność pojedynczych neuronów HPC i PHa podczas
generowania aktywności rytmicznej in vitro.
• Aktywność oscylacyjna theta rejestrowana in vitro przy
użyciu macierzy wieloelektrodowych (256 kanałów).
KATEDRA NEUROBIOLOGII
Pracownia elektrofizjologiczna in vivo
Tematyka badań:
• Mechanizmy generowania rytmu theta rejestrowanego
w formacji hipokampa (HPC) oraz obszarze tylnego
podwzgórza (PHa) u anestetyzowanego szczura.
• Aktywność pojedynczych neuronów HPC i PHa podczas
generowania aktywności rytmicznej in vivo.
• Podstawy neurotransmisyjne generowania rytmu theta
i towarzyszących mu wyładowań komórkowych
obserwowane w warunkach in vivo.
KATEDRA NEUROBIOLOGII
Pracownia neurochemiczna (HPLC)
Tematyka badań:
•
•
•
interakcje układu nerwowego i odpornościowego - molekularne i komórkowe
mechanizmy kompensacyjne,
zmiany neurochemiczne i molekularne w izolowanych skrawkach formacji
hipokampa,
behawioralna i neurochemiczna odpowiedz organizmu na zakażenie Toxoplasma
gondii
KATEDRA NEUROBIOLOGII
Pracownia neurobehawioralna
Tematyka badań:
Obecna problematyka badawcza koncentruje
się na ośrodkowych mechanizmach
behawioralnych, neurochemicznych oraz
neuroreceptorowych reakcji emocjonalnych
oraz interakcji socjalnych.
Badania polegają na kompleksowej analizie
różnych stanów emocjonalnych w korelacji ze
zmianami aktywności monoaminergicznych
systemów neurotransmisyjnych w tych
obszarach mózgu, które odpowiadają za odbiór
i przetwarzanie informacji zagrażającej lub
stresogennej.
KATEDRA NEUROBIOLOGII
Przykłady prac dyplomowych
Rozprawy doktorskie:
• Aktywność elektroencefalograficzna (EEG) formacji hipokampalnej in vitro: wpływ
temperatury oraz profil warstwowy amplitudy i fazy
• Udział tylnego podwzgórza w generowaniu hipokampalnego rytmu theta in vivo
Prace magisterskie:
• Rejestracja aktywności rytmicznej theta w preparatach tylnego podwzgórza w warunkach
pozaustrojowych
• Transmisja oreksynowa jako nowy układ neurotransmisyjny uczestniczący w powstawaniu
hipokampalnego rytmu theta u anestetyzowanego szczura
• Efekty podania johimbiny do jądra środkowego ciała migdałowatego na zachowanie lękowe
i aktywność systemu serotoninergicznego u szczurów
• Wpływ uszkodzeń dootrzewnowego podania LPS na zachowanie szczura w uniesionym
labiryncie krzyżowym oraz aktywność neurotransmisyjną w ciele migdałowatym
Prace licencjackie:
•
•
•
•
Neurofizjologiczne podstawy uczenia się i pamięci
Zaburzenia psychopatologiczne w otępieniach z ciałami Lewy’ego
Gorączka czy hipertermia - mechanizmy, znaczenie, następstwa
Zaburzenia stresowe pourazowe, jako następstwo traumatycznych doświadczeń życiowych