CV - Instytut Genetyki Roślin

CV
prof. dr hab. Jan Sadowski
E-mail: [email protected]
Telefon: (+48 61) 65 50 237
Zakład Biologii Stresów Środowiskowych
Zespół Sygnalizacji Stresowej
Specjalizacja: genetyka molekularna, sygnalizacja hormonalna, moduł
fosforylacji/defosforylacji białek, Brassicaceae, Hordeum vulgare
Profil badawczy
Głównym kierunkiem badań jest poznanie procesów zachodzących podczas adaptacji roślin do
stresów środowiskowych ze szczególnym uwzględnieniem sygnalizacji kwasu abscysynowego (ABA)
i etylenu. Nasze badania mają na celu poznanie sieci sygnalizacyjnej zależnej od białek
kontrolujących moduł fosforylacji i defosforylacji m. in. kaskady kinaz MAP, kinaz białkowych
zależnych od jonów wapnia (CDPK) i fosfataz białkowych 2C (PP2C). Moduł fosforylacji i
defosforylacji stanowi ważny poziom regulacyjny, od którego zależy włączanie i wyłączanie ścieżek
sygnalizacji w stresie suszy i zasolenia. Modelami w tych badaniach są: Arabidopsis thaliana,
Brassica napus, podgatunki Brassica oleracea i Hordeum vulgare.
Główne kierunki badań:

Poznawanie mechanizmów prowadzących do adaptacji roślin do stresów środowiskowych.

Poznawanie sieci interakcji między białkami uczestniczącymi w sygnalizacjach hormonalnych.

Genomika funkcjonalna i porównawcza paleopoliploidów: funkcjonowanie homeologów
genowych i ich rola w plastycznym dostosowywaniu się roślin do warunków środowiska
(model badawczy: Arabidopsis thaliana i Brassica napus).
Metody/ podejścia



Profilowanie transkrypcyjne genów (mikromacierze DNA, qRT-PCR).
Techniki nadekspresji, wyciszania genów, mutagenezy ukierunkowanej.
Profilowanie proteomiczne (BiFC, izolacja kompleksów białek, MS/MS, techniki
interakcji białek) .
Projekty badawcze krajowe i międzynarodowe

MNiSW
Nr projektu: N N303 568339
Tytuł projektu: Funkcjonowanie zduplikowanych genów u paleopoliploidów: udział
homologów genu ABI1 w sygnalizacji ABA u rzepaku ozimego (Brassica napus var.
oleifera L.)
Kierownik projektu: D. Babula-Skowrońska
Wykonawcy: J. Sadowski
Okres realizacji: 10.11.2010 – 09.11.2013

NCN
Nr projektu: 5728/B/P01/2011/40 (promotorski)
Tytuł projektu: Analiza funkcjonalna wybranych fosfataz białkowych 2C rzepaku
ozimego (Brassica napus var. oleifera L.): izolacja specyficznych kompleksów
białkowych
Kierownik projektu: prof. J. Sadowski
Wykonawca: mgr A. Cieśla
Okres realizacji: 06.05.2011 – 05.11.2012

Fundusze Strukturalne POIG 2007-2013
Nr projektu: UDA-POIG.01.03.01-101/08-00
Tytuł projektu: POLAPGEN Narzędzia biotechnologiczne służące do otrzymywania
zbóż o zwiększonej odporności na suszę
Koordynator: P. Krajewski
Tytuł zadania nr 17: Charakterystyka ekspresji wybranych genów CDPK związanych
z lepszym adaptowaniem się zbóż do stresu suszy
Kierownik zadania: J. Sadowski
Okres realizacji: 01.06.2008-31.12.2014
Staże zagraniczne
1993-1995, University of California, Davis, USA
1996, University of California, Davis, USA
2000, 2001, CNRS-Universite de Perpignan, Francja
Współpraca krajowa
Instytut Biochemii i Biofizyki PAN w Warszawie, prof. Michał Dadlez, analiza
fosfoproteomu w różnych genotypach jęczmienia jarego – w ramach projektu konsorcyjnego
POLAPGEN.
Zakład Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet im. A. Mickiewicza w Poznaniu; dr
Agnieszka Ludwików, dr Lucyna Misztal, dr Łukasz Gałgański; projekt N N303 568339
Funkcjonowanie zduplikowanych genów u paleopoliploidów: udział homologów genu ABI1 w
sygnalizacji ABA u rzepaku ozimego (Brassica napus var. oleifera L.), projekt promotorski
5728/B/P01/2011/40, 2 publikacje w przygotowaniu
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Poznaniu, prof. dr hab. Iwona Bartkowiak-Broda
i prof. dr hab. Teresa Cegielska-Taras; wspólne projekty obejmujące wyprowadzenie linii
transgenicznych rzepaku z nadekspresją genów ABI1 i CDPK6, projekt promotorski
5728/B/P01/2011/40 i projekt N N303 568339 Funkcjonowanie zduplikowanych genów u
paleopoliploidów: udział homologów genu ABI1 w sygnalizacji ABA u rzepaku ozimego
(Brassica napus var. oleifera L.), doniesienia konferencyjne, a obecnie 2 publikacje w
przygotowaniu
Współpraca zagraniczna
Rothamstead International, WB, prof. Graham King, 3-miesieczny pobyt dr Danuty Babuli
w jego zespole, publikacja w przygotowaniu
Publikacje:
Babula-Skowrońska D., Cieśla A., Sadowski J. (2011). Molecular linkage maps: strategies,
resources and achievements. In: Sadowski J. (Ed.) Genetics, Genomics and Breeding of
Vegetable Brassica, Science Publishers, Enfield, New Hampshire; 4: 125-196
Ziolkowski P.A., Kaczmarek M., Babula-Skowrońska D., Sadowski J. (2011). Brassica
genome evolution: dynamics and plasticity. In: Edwards D., Batley J., Parkin I., Kole C (Eds.)
Genetics, Genomics and Breeding of Oilseed Brassicas, Science Publishers, Inc., Jersey,
British Isles, New Hampshire; 2: 17-46
Jakubowicz M, Gałgańska H, Nowak W, Sadowski J (2010) Exogenously induced expression
of ethylene biosynthesis, ethylene perception, phospholipase D, and Rboh-oxidase genes in
broccoli seedlings. Journal of Experimental Botany 61(12): 3475-3491
Ziółkowski P.A., Babula-Skowrońska D., Kaczmarek M., Cieśla A., Sadowski J. (2010).
Sekwencjonowanie porównawcze genomów: generowanie markerów genetycznych typu
INDEL i SNP. Biotechnologia 4: 53-68
Kaczmarek M., Koczyk G., Ziolkowski P.A., Babula-Skowrońska D., Sadowski J. (2009).
Comparative analysis of the Brassica oleracea genetic map and the Arabidopsis thaliana
genome. Genome 52: 620-633
Ziolkowski PA, Koczyk G, Galganski L, Sadowski J (2009) Genome sequence comparison of
Col and Ler lines reveals the dynamic nature of Arabidopsis chromosomes. Nucleic Acids
Res. 37(10):3189-201
Ludwików A, Kierzek D, Gallois P, Zeef L, Sadowski J (2009) Gene expression profiling for
ozone-treated Arabidopsis abi1td insertional mutant: PP2C ABI1 modulates biosynthesis
ratio of ABA and ethylene. Planta 230(5): 1003-1017
Ludwików A, Sadowski J (2008) Gene networks in plant stress response and tolerance.
Journal of Integrative Plant Biology 50(10): 1256-1267
Ludwików A, Misztal LH, Krasowski K, Sadowski J (2008) Mikromacierze DNA i ich
zastosowanie w badaniach ekspresji genów u roślin. Biotechnologia 4(81): 131-143
Babula D., Kaczmarek M., Ziółkowski P.A., Sadowski J. (2007). Brassica oleracea. In: Kole
C (Ed.) Genome Mapping & Molecular Breeding. Vol. 5: Vegetables. Springer, Heidelberg,
Berlin, New York, Tokyo 5: 227-285
Babula D., Misztal L.H., Jakubowicz M., Kaczmarek M., Nowak W., Sadowski J. (2006).
Genes involved in biosynthesis and signalisation of ethylene in Brassica oleracea and
Arabidopsis thaliana: identification and genome comparative mapping of specific gene
homologues. Theor Appl Genet 112: 410-420
Ziolkowski P.A., Kaczmarek M., Babula D., Sadowski J. (2006) Genome evolution in
Arabidopsis/ Brassica: conservation and divergence of ancient rearranged segments and
their breakpoints. Plant J 47: 63-74
Kościańska E, Kalantidis K, Wypijewski K, Sadowski J, Tabler M (2005) Analysis of RNA
silencing in agroinfiltrated leaves of Nicotiana benthamiana and Nicotiana tabacum. Plant
Molecular Biology 59, 647-661
Kaczmarek M., Babula D., Sadowski J. (2004). Application of the Arabidopsis thaliana
sequence data in understanding the Brassica genome. In: J. Sadowski (Ed.) Understanding
the plant genome, s. 122-133
Ziółkowski P, Blanc G, Sadowski J. (2003) Structural divergence of chromosomal segments
that arose from succesive duplication events in the Arabidopsis genome. Nucleic Acids
Research 31: 1-12
Babula D., Kaczmarek M., Barakat A., Delseny M., Quiros C.F., Sadowski J. (2003).
Chromosomal mapping of Brassica oleracea based on ESTs from Arabidopsis thaliana:
complexity of the comparative map. Mol Genet Genomics 268: 656-665
Ziółkowski P, Sadowski J. (2002) FISH-mapping of rDNAs and Arabidopsis BACs on
pachytene complements of selected Brassicas. Genome 45: 189-197
Nagrody i odznaczenia
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetycznego za najlepszą publikację z zakresu genetyki
roślin opublikowaną w roku 2006 (przyznana w 2007 r. za pracę w Plant Journal)
Wyróżnienie Komisji Nagrody im. Jakuba Parnasa (Polskiego Towarzystwa Biochemicznego)
za najlepszą pracę z biochemii pochodzącą z polskiego laboratorium i opublikowaną w 2006
(przyznana w 2007 r. za pracę Ziółkowski P.A., Kaczmarek M., Babula D., Sadowski J
(2006). Genome evolution in Arabidopsis/Brassica: conservation and divergence of ancient
rearranged segments and their breakpoints. Plant J, 47:63-74), 2007 r.
Wyróżnienie Komisji Nagrody Polskiego Towarzystwa Biologii Eksperymentalnej Roślin i Carl
Zeiss Sp. z o.o. za pracę naukową w zakresie biologii eksperymentalnej roślin opublikowaną
w latach 2005-2007 (przyznana w 2007 r. za pracę: Ziółkowski P.A., Kaczmarek M., Babula
D., Sadowski J (2006). Genome evolution in Arabidopsis/Brassica: conservation and
divergence of ancient rearranged segments and their breakpoints. Plant J, 47:63-74, 2007 r.
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetycznego i Carl Zeiss Company za najlepsze prace
genetyczne opublikowane w okresie 2006-2009: I. Ziółkowski P.A., Kaczmarek M., Babula
D., Sadowski J (2006). Genome evolution in Arabidopsis/Brassica: conservation and
divergence of ancient rearranged segments and their breakpoints. Plant J, 47:63-74 and
II. Ziolkowski PA, Koczyk G, Galganski L, Sadowski J (2009) Genome sequence comparison
of Col and Ler lines reveals the dynamic nature of Arabidopsis chromosomes. Nucleic Acids
Res. 37(10):3189-201
Wyróżnienie (2012) Wydziału II Nauk Biologicznych i Rolniczych Polskiej Akademii Nauk za
książkę „Genetics, Genomics and Breeding of Vegetable Brassicas”, 2011, Science
Publishers, CRC Press, Enfield, New Hampshire, 2011
Zainteresowania / Hobby
Muzyka/pianistyka, pływanie i narciarstwo